1 / 11

VisNow – czytanie danych regularnych

VisNow – czytanie danych regularnych. Krzysztof S. Nowiński visnow@icm.edu.pl. Siatka - struktura+geometria. Siatka regularna równoległościenna Struktura tablicy 1- 2- lub 3-wymiarowej ( komórki są odpowiednio odcinkami , czworokątami lub sześciościanami )

briar
Télécharger la présentation

VisNow – czytanie danych regularnych

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript


  1. VisNow – czytanie danych regularnych • Krzysztof S. Nowiński • visnow@icm.edu.pl

  2. Siatka - struktura+geometria • Siatkaregularnarównoległościenna • Strukturatablicy 1- 2- lub3-wymiarowej (komórkisąodpowiednioodcinkami, czworokątamilubsześciościanami) Do opisu struktury wystarczą jej wymiary, np. 100x128x256

  3. Geometria • Geometria: siatkaprostokątna • Najprostszy opis geometrii – brak opisu: Punkt (i,j,k) ma współrzędne i,j,k: • Często wystarczający opis geometrii: rozmiary Wystarczy podać zakresy, np. [-1,1]x[-1,2]x[0,4] • Siatkarównoległościenna • Punkt początkowy p0(x0,y0,z0) • Wektory v0, (v1, v2) w zależności od wymiaru siatki określające komórkę elementarną. Punkt o indeksach (i,j,k) będzie leżał w p0+i*v0+j*v1+k*v2) • Alternatywnie można podać wektory w0, (w1, w2) określające krawędzie całej siatki. Będzie wtedy np. v0=w0/(dim0-1) • Siatka równoległościenna nieprostokątna pojawia się zwykle w krystalografii a niekiedy w obrazowaniu • Siatka dowolna • Opis: Tablica coords[nSpace*dim0(*dim1*dim2)] • Wszystkie współrzędne muszą być explicite podane (przeczytane z pliku)

  4. Pole:siatka + wartości • Wartości są przechowywane w komponentach • name– nazwa używana przy wyborze komponenty • type – typ danych w tablicy - od DataArray.BOOLEAN do DataArray.DOUBLEi DataArray.STRING • veclen – 1 gdy dane skalarne, >1 gdy wektorowe • nData– liczba elementów danych • Dane w tablicy o długości veclen * nData • Dodatkowo: • Unit – nazwa jednostki fizycznej (przy tekście legendy barwnej) • User data – do dowolnego wykorzystania przez użytkownika

  5. Przykład I – prościej już się nie da #VisNow regular field dims 100 100 100 component ear byte file ear_uniform.vnd binary ear Wiersz obowiązkowy – VisNow rozpoznaje po nim plik Konieczne: pole będzie miało wymiary 100x100x100, czyli 106 punktów I jedną komponentę typu byte Plik binarny leży w tym samym katalogu I zawiera tablicę wartości naszej komponenty Wynik: najprostsza siatka sześcienna z danymi bajtowymi

  6. Przykład II – trochę za mało danych #VisNow regular field fdim80 80 30 x -1 1 y -1 1 z -1 1 component ear byte file=../AVSfld/ear.dat binary ear Wiersz obowiązkowy – VisNow rozpoznaje po nim plik Konieczne: pole będzie miało wymiary 80x80x30, Wypełni kostkę [-1,1]x[-1,1]x[-1,1] I jedną komponentę typu byte Plik binarny leży w sąsiednim katalogu I zawiera tablicę wartości naszej komponenty Wynik: prostopadłościenna siatka niejednorodna

  7. Przykład III – z ukosa i nie od samego początku • #VisNow regular field • field CT_sample, dim 156 366 170 • Origin 0 0 0 • v0 1 0 0 • v1 0 1 0 • v2 0.4 0.41 • component density byte • file=../volume/CTsample.dat binary • skip=13 • density Wiersz obowiązkowy – VisNow rozpoznaje po nim plik Tym razem pole ma nazwę Punkt początkowy I wektory wyznaczające komórkę jednostkową I jedną komponentę typu byte Plik binarny leży w sąsiednim katalogu I zawiera tablicę wartości naszej komponenty Ale na początku trzeba pominąć 13 bajtów Wynik: siatka ukośnokątna

  8. Przykład III – z ukosa i nie od samego początku • #VisNow regular field • field CT_sample, dim 156 366 170 • Origin 0 0 0 • v0 1 0 0 • v1 0 1 0 • v2 0.4 0.41 • component density byte • file=../volume/CTsample.dat binary • skip=13 • density Wiersz obowiązkowy – VisNow rozpoznaje po nim plik Tym razem pole ma nazwę Punkt początkowy I wektory wyznaczające komórkę jednostkową I jedną komponentę typu byte Plik binarny leży w sąsiednim katalogu I zawiera tablicę wartości naszej komponenty Ale na początku trzeba pominąć 13 bajtów Wynik: siatka ukośnokątna

  9. Przykład IV – wszystko krzyweA ile danych… #VisNow regular field field bluntfin, dim 40 32 32, coords component density float component momentum float, vector 3 component stagnation float file=../AVSfld/blntfinx.bin binary skip12 coord.0 coord.1 coord.2 file=../AVSfld/blntfinq.bin binary skip28 density momentum.0 momentum.1 momentum.2 stagnation Tym razem pole ma nazwę, wymiary i współrzędne czytane z pliku 3 komponenty float, w tym jedna wektorowa Plik binarny w sąsiednim katalogu 12 początkowych bajtów opuszczamy Kolejno czytamy pierwszą współrzędną wszystkich punktów, Następnie drugą i trzecią współrzędną W drugim pliku opuszczamy 28 bajtów i czytamy kolejno komponentę density, 3 składowe komponenty momentum i komponentę stagnation Każdy wiersz po wierszu file opisuje sekcję pliku Wynik: siatka krzywoliniowa

  10. Przykład VA czas płynie… #VisNow regular field field met, dim 433 601 x -216 216 y -300 300 comp orography float, unit m comp 10_metre_wind float, veclen 2, unit m/s comppressure_at_mean_sea_levelfloat, unit Pa file 2011Dec02_00/00033binary timestep 0 orography pressure_at_mean_sea_level end timestep 1 pressure_at_mean_sea_level 10_metre_wind end timestep1 10_metre_wind end …… Tym razem pole ma nazwę, zakres (prostokąt) i trzy komponenty typu float, w tym jedną wektorową z podanymi jednostkami fizycznymi Plik binarny zawiera kolejne kroki czasowe dla różnych chwil o różnej zawartości Uwaga: ponieważ sekcja zawiera po prostu 10_metre_wind, będzie czytana kolejno punktami: v0x,v0y,v1x,v1y,v2x,v2y…. – tak, jak jest przechowywana w pamięci

  11. Dziękuję za uwagę! • visnow@icm.edu.pl

More Related