Citogenetica II

1. Citogenetica II La citogenetica e` lo studio dei fenomeni genetici attraverso l’analisi citologica dei cromosomi al microscopio. Ferguson-Smith By NA

2. CML, Leucemia Mieloide Cronica • La CML è stata la prima malattia neoplastica dell’uomo in cui una specifica anomalia del cariotipo, il cromosoma Philadelphia (Ph), sia stata associata alla insorgenza della leucemia. By NA

3. CML, Leucemia Mieloide Cronica ABL ABL/BCR BCR/ABL BCR Nel 95% dei casi di CML cromosoma non normale chr Philadelphia (1961) Indagini FISH E MOLECOLARI Traslocazione reciproca braccio lungo chr.9 e il braccio lungo chr.22: t(9;22)(q34;q11). • SI FORMANO DUE GENI DI FUSIONE: • ABL-BCR su DER9 (nessuna proteina prodotta) • BCR-ABL su Ph (proteina di fusione coinvolta nella proliferazone cellulare) By NA

4. FISH nella CML 3 spot (Ph) By NA

5. FISH nella CML colocalizzazione (Ph) By NA

6. FISH nella CML 4 spote colocalizzazione By NA

7. CML esempi By NA

8. CML esempi By NA

9. AML, Leucemia Mieloide Acuta INVERSIONE inv(16)(p13;q22) (CBFB-MYH11) By NA

10. AML, Leucemia Mieloide Acuta By NA

11. Traslocazioni complesse in AML Esempio dell’uso di librerie totali per evidenziare riarrangiamenti t(8;13;14) By NA

12. Leucemia Acuta Promielocitica (APL) geni coinvolti PML-RAR) La traslocazione t(15;17)(q22;q21) è associata clinicamente alla leucemia acuta promielocitica (APL) In verde chr17 In rosso chr15 15 der15 der17 17 By NA

13. Leucemia Acuta Promielocitica (APL) La FISH permette di trovare traslocazioni criptiche (quelle che non si vedono dall’analisi del cariotipo) t(15;17)(q22;q21) 15 der15 der17 17 By NA

14. Linfomi Non Hodgkin t(8;14) by GP&NA By NA

15. Linfomi Non Hodgkin TRASLOCAZIONE t(14;18)(q32;q21) catene pesanti immunoglobuline oncogene BCL2 By NA

16. Caso I • Paziente 38enne all’inizio della gravidanza decide di ricorrere alla diagnosi prenatale sotto indicazione del consulente genetico che l’ha informata dell’aumentato rischio di aneuploidie cromosomiche fetali nelle madri con età avanzata. • Due precedenti gravidanze dalle quali ha avuto due figli fenotipicamente normali. • Assenza di aborti spontanei. traslocazione reciproca t (13;19) nel feto traslocazione reciproca t (13;19) nel padre By NA

17. Procedura diagnostica • ANALISI CITOGENETICA: • campione di liquido amniotico aspirato con l’amniocentesi; • allestimento del preparato citogenetico e analisi del cariotipo; traslocazione reciproca t (13;19) nel feto By NA

18. Procedura diagnostica • campione di sangue periferico di entrambi i genitori ; • allestimento del preparato citogenetico e analisi del cariotipo; traslocazione reciproca t(13;19) nel padre By NA

19. 13 12 11.2 12 13 14 13.3 13.2 13.1 12 12 13.1 13.2 13.3 13.4 13.3 13.2 13.1 12 12 13.1 13.2 13.3 13.4 13 12 11.2 12 13 14 21 22 31 32 33 34 13.3 14 21 22 31 32 33 34 19 Evidenziare i breakpoints mediante la FISH I 19 13 der(13) der(19) By NA

20. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH II By NA

21. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH III Dopo aver individuato la regione sul cromosoma 13 e sul 19 presumibilmente coinvolta nella traslocazione, selezionare i corrispondenti BAC da utilizzare per la FISH. individuare i BAC che vengono tagliati dal breakpoint; in questo caso dovrei avere tre segnali: uno sul cromosoma normale e un segnale su ciascun derivativo. per abbreviare i tempi si puo’ eseguire una coibridazione marcando contemporaneamente due o tre sonde di DNA con diversi fluorocromi. Cy3 Cy5 Fluor-X By NA

22. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH IV By NA

23. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH V RP11-84C17 chr19:7,777,647-777,8013 RP11-298C17 chr19:9,998,865-10,195,739 RP11-19I2 chr19:11,643,368-11,816,255 By NA

24. der(19) chr 19 Evidenziare i breakpoints mediante la FISH VI chr19:7,163,629-7,377,296 der(13) chr 19 chr19:6,726,912-6,917,544 Il breakpoint sul cromosoma 19 è situato tra la sonda prossimale RP11-52O9 e la sonda distale RP11-717H11. By NA

25. 13 12 11.2 12 13 14 13.3 13.2 13.1 12 12 13.1 13.2 13.3 13.4 13.3 13.2 13.1 12 12 13.1 13.2 13.3 13.4 13.3 14 21 22 31 32 33 34 19 Evidenziare i breakpoints mediante la FISH VII RP-1152O9 RP11-717H11 RP11-717H11 19 RP-1152O9 der(19) der(13) By NA

26. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH VIII By NA

27. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH IX By NA

28. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH X La sonda RP11-976L2 emette fluorescenza sul cromosoma 13 e sul der(13) (freccia rossa). La sonda RP11-1140C18 emette invece tre segnali : sul cromosoma 13, sul der(19) (freccia verde) e sul der(13) (freccia verde). IL BREAKPOINT SUL CROMOSOMA 13 CADE ALL’INTERNO DEL BAC 1140C18 By NA

29. 13 12 11.2 12 13 14 13.3 13.2 13.1 12 12 13.1 13.2 13.3 13.4 13 12 11.2 12 13 14 21 22 31 32 33 34 13.3 14 21 22 31 32 33 34 19 Evidenziare i breakpoints mediante la FISH XI RP11-1140C18 RP11-1140C18 RP11-976L2 By NA

30. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH Dopo aver individuato la regione sul cromosoma 13 e sul 19 presumibilmente coinvolta nella traslocazione, selezionare i corrispondenti BAC da utilizzare per la FISH. individuare i BAC che vengono tagliati dal breakpoint; in questo caso dovrei avere tre segnali: uno sul cromosoma normale e un segnale su ciascun derivativo. per abbreviare i tempi si puo’ eseguire una coibridazione marcando contemporaneamente due o tre sonde di DNA con diversi fluorocromi. Cy3 Cy5 Fluor-X By NA

31. Evidenziare i breakpoints mediante la FISH Dopo aver individuato la regione sul cromosoma 13 e sul 19 presumibilmente coinvolta nella traslocazione, selezionare i corrispondenti BAC da utilizzare per la FISH. individuare i BAC che vengono tagliati dal breakpoint; in questo caso dovrei avere tre segnali: uno sul cromosoma normale e un segnale su ciascun derivativo. per abbreviare i tempi si puo’ eseguire una coibridazione marcando contemporaneamente due o tre sonde di DNA con diversi fluorocromi. Cy3 Cy5 Fluor-X By NA