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RNAi y siRNA

RNAi y siRNA. Joel Salazar-Mendiguchía Módulo Genómica y Proteómica Máster en Genética Avanzada Universitat Autónoma de Barcelona. Definición. Proceso de regulación génica secuencia-específico , desencadenado por RNA bicatenario Mecanismo altamente conservado entre eucariotas

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RNAi y siRNA

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Presentation Transcript

  1. RNAi y siRNA Joel Salazar-Mendiguchía MóduloGenómica y Proteómica Máster en GenéticaAvanzada UniversitatAutónoma de Barcelona

  2. Definición • Procesode regulacióngénicasecuencia-específico, desencadenadopor RNA bicatenario • Mecanismoaltamenteconservado entre eucariotas • Importanciabiológica (respuestacelularinmune a infecciones, estabilidadgenética, desarrollo, etc) • Diversasclases de RNA reguladorespequeños (20-30 nt), algunos de los cualescompartenbiogénesis y vías

  3. Small RNAs and silencing

  4. PUBLICACIONES EN REVISTAS INDEXADAS (RNAi, siRNA, miRNA) 2013 2012 2011 2010 2009 2008 2007 2006 2005 2004 2003 2002 2001 2000 0 200 400 600 800 1000 1200 1400 1600 Pubmed.gov as of June 2013

  5. Historia

  6. Historia… Wildtype Control negativo dsRNAmex-3 Antisense mex-3

  7. RNA silencing pathways

  8. Utilidades

  9. Estrategias de “entrega” in vivo Estrategiasvirales Estrategias no virales

  10. Limitaciones • Estabilidad de los dsRNA (ribonucleasas) • Vida media corta • Respuestainmuneinespecífica • Off-Target Effects (OTEs – específicos y generales) • ¿Efectosadversosserios? • ¿Mejorvía de administración?

  11. ¡ ¡ ¡ G R A C I A S ! ! !

  12. Bibliografía • Fire AG, Xu S, Montgomery MK, et al. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorrhabditiselegans. Nature. 1998, 291: 806-811 • Scherr M, Morgan M, Eder M. Gene Silencing Mediated by Small Interfering RNAs in Mammalian Cells. Current Med Chem. 2003, 10: 245-256 • Jinek M, Doudna J. A three-dimensional view of the molecular machinery of RNA interference. Nature. 2009, 457: 405-412 • Castanotto D, Rossi J, The promises and pitfalls of RNA-interference-based therapeutics. Nature. 2009, 457: 426-433 • Siomi H, Siomi M. On the road to reading the RNA-interference code. Nature. 2009, 457:396-404 • Moazed D. Small RNAs in transcriptional gene silencing and genome defence. Nature. 2009, 457: 413-420 • Pfeffer S, Meister G, Landthaler M. RNA silencing. B.I.F Futura 2005, 20:83-91 • Vázquez-Ortíz, Piña P, Salcedo M. Grandesalcances de los RNAs pequeños RNA de interferencia y microRNA. Rev InvClin. 2006, 58: 335-349

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