Scientific Methodology and Scientific Paper Writing

1. Scientific Methodology and Scientific Paper Writing The Department of Ecology & Evolutionary Biology, Fudan University Bao-Rong Lu 复旦大学 卢宝荣

2. 主要社会兼职: 国际生物安全研究学会（ISBR）主席，中国国家生物安全委员会委员，中国植物学会理事，中国生物技术学会理事 担任编辑: Environmental Biosafety Research, Crop Research, Asian J of Plant Sciences, J Systematics & evolution,《中国科学》 《生物多样性》，《中国水稻科学》，《植物遗传资源学报》，《复旦学报》，《云南农业大学学报》等 卢宝荣 生态与进化生物学系主任 生物多样性与生态工程教育部重点实验室学术委员会主任 研究领域: 保护生物学，系统与进化，分子生态，生物安全 复旦大学 卢宝荣

3. Citation Distribution of Baorong Lu’s Publications Since 1991 复旦大学 卢宝荣

4. Course design Part 1:Scientific Methodology Part 2:Scientific Paper Writing 复旦大学 卢宝荣

5. Part 1: Scientific Methodology • Introduction: scientific research & article writing • Science & scientific methodology • General procedure of scientific research • Scientific question & hypothesis • Design a research (project) • Conduct a research (project) 复旦大学 卢宝荣

6. Part 2: Scientific Paper Writing • Organization & format of a scientific paper • Titles, authorships & Abstracts • How to write the Introduction • How to write Materials & Methods • How to write Results • How to write Discussion • Acknowledgement & references • How to submit your paper • The reviewing & publishing process 复旦大学 卢宝荣

7. Part 1: Scientific Methodology What is the most difficult part in scientific research ? 复旦大学 卢宝荣

8. 什么是科学研究？What is scientific Research? • 英文Research是什么意思？ • ReSearch（不断寻找） • 寻找什么？？ 复旦大学 卢宝荣

9. 寻找答案（结果）？ 科学假设的结果？ 科学问题! 科学问题 → 假设的结果？ 复旦大学 卢宝荣

10. A simple & effective way of scientific research • How ? • Which way ? The hypothesis driven approach 复旦大学 卢宝荣

11. Six steps: research process in fundamental sciences 1. Select projects (questions) 5.Generate theories 4. Test hypotheses 2. Obtain facts 6. Evaluate theories 3. Create hypotheses 复旦大学 卢宝荣

12. A hypothesis driven approach of scientific research: Proof (design & conduct Experiment) Scientific question Analysis -Conclusion -Finding-Theory Hypothesis 复旦大学 卢宝荣

13. Formulate a scientific question (A) Types of scientific questions： • What? – the nature of objectives • How? – the state& movementof objectives • Why? – the mechanisms of the state & movement of objectives 复旦大学 卢宝荣

14. Considerations when propose scientific questions: • Scientificity（科学性） • Values（重要性） • Feasibility （可验证性） • Lead to new questions（丰富性） • Innovativeness（创新性） • Relevant to scientific &/or social values（理论价值）（经济价值） 复旦大学 卢宝荣

15. Scientific questions should be: • Simple • Clear (not equivocal) • Possible to validate (or test) 复旦大学 卢宝荣

16. A hypothesis driven approach of scientific research: Proof (design & conduct Experiment) Scientific question Analysis -Conclusion -Finding-Theory Hypothesis 复旦大学 卢宝荣

17. Formulate a scientific hypothesis • A statement of expected results • A possible response (prediction) to the research question • "hypothesis" & "theory" are often used as synonym in informal usage • A hypothesis is untested theory 复旦大学 卢宝荣

18. Considerations when propose scientific hypotheses: • Testable (at your capacity) • Powerful (explain more facts) • Highly predictable (mature) • Accurate • Logically simple • No pre-set conditions 复旦大学 卢宝荣

19. A hypothesis driven approach of scientific research: Proof (design & conduct Experiment) Scientific question Analysis -Conclusion -Finding-Theory Hypothesis 复旦大学 卢宝荣

20. A well-down research work-plan: • Title of the experiment • Rational & Objectives(references) • Main research contents & activities (Core) • Technical details (Core) • Time frame (deadlines) • Expected outputs • Budget 复旦大学 卢宝荣

21. 问 题？ 复旦大学 卢宝荣

22. Part 2: Scientific Paper Writing The cripple but not lost can surpass the people who walk fast but in a wrong road — Francis Bacon 复旦大学 卢宝荣

23. Four questions? • Do you want to publish a high quality scientific paper ? • Whydo you want to publish a paper ? • What should you need for publishing a good paper ? • After publishing, what do you expect from your papers ? 复旦大学 卢宝荣

24. 什么是科学论文 ？ 科学论文是： • 记录原始研究结果，或 • 综述科学发现及发展 • 将正式发表或出版的 • 书写文件 复旦大学 卢宝荣

25. 科学论文的结构 背景和研究目的（I） 主要结果 （R） 结论（D） （发现，理论） 方法 （M&M） 复旦大学 卢宝荣

26. 复旦大学 卢宝荣

27. 科学研究与科学论文 科学研究： • 科学问题  科学假设  实验验证  结论（科学发现） 科学论文： • 研究背景（目的） 研究方法  研究结果  结论（科学发现的意义） • 科学研究与科学论文的形式相似而对应 • 有好的研究结果  才能创作出好的论文 复旦大学 卢宝荣

28. 怎样才是一篇优秀的 （研究）论文？ • 包含有意义的科学问题 • 有明确、合理的科学假设 • 有严密的实验设计 • 有令人信服的实验结果（数据） • 有令人鼓舞的理论、实践意义 • 有动人的故事情节（story） 复旦大学 卢宝荣

29. 每一个人都可能是“三者” • 读者 • 作者 • 编者 编辑好的论文 写出佳世之作 读精彩的文章 复旦大学 卢宝荣

30. 1) 科学论文的特点 科学论文的关键特性： • 科学论文向读者传递新知识 • 清楚 • 简单 • 易懂 • 科学论文撰写须选择特定语言 ? 复旦大学 卢宝荣

31. 科学论文的格式 ? • Title • Authors • Address • Abstract / summary • Key words • Introduction • Material & methods • Results • Discussion • Acknowledgements • Reference / literature cited • Tables • Figure legends • Figures • Appendices 复旦大学 卢宝荣

32. 2) 科学论文的一般格式 研究论文的“三部曲” • 前奏：标题、作者、摘要、关键词 • 主旋律：“IMMRD” • 尾声：致谢、参考文献等 复旦大学 卢宝荣

33. 研究论文的“IMMRD”格式 • I = Introduction • M&M = Material & method • R = Results • D = Discussion 复旦大学 卢宝荣

34. 科学（研究）论文的格式 题目 & 摘要 前言 材料和方法 结果 讨论 复旦大学 卢宝荣

35. 3) IMMRD 的功能 • Introduction:What question was studied ? （研究的目的） • Materials & methods:how & based on what the problem studied ? （如何实施的） 复旦大学 卢宝荣

36. IMMRD 的功能 • Results: what are the findings ? （发现了什么） • Discussion:what do the findings mean ? （新发现的意义） 复旦大学 卢宝荣

37. Title & Abstract Introduction Results Discussion M & M 其他格式 复旦大学 卢宝荣

38. Results & Results & Results & Discussion Discussion Discussion Title & Abstract Introduction 其他格式 M & M Conclusion 复旦大学 卢宝荣

39. 4) 综述论文的一般格式 什么是综述论文 ？ • 综述某一学科领域或某一位（组）科学家的研究进展和现状 格式： • Summarize（总结）information that has been published • Analyze（分析）… • Evaluate（评价）… • Synthesize（整合）information that has been published 复旦大学 卢宝荣

40. 5) 论文撰写的步骤： 前奏： • 标题、作者、(摘要)、关键词 主旋律： • 组织论文的结果 • 描述获取结果的方法 • 介绍论文的研究背景及目的 • 讨论研究结果的意义 尾声： • 致谢、参考文献 … 论文的核心 复旦大学 卢宝荣

41. 科学论文的格式 题目 & … Introduction Materials & methods Results Discussion 复旦大学 卢宝荣

42. 前奏 A. 如何撰写论文的题目 • 论文题目的重要性：论文的题目会被大量读者阅读（看到） • 好题目的特点：以最少的文字，但最大限度地表述论文的内容 • 题目不适宜将导致论文被埋没或无缘被需要的读者阅读 复旦大学 卢宝荣

43. 论文题目要意思明确 • 科学论文的题目应该使用意思明确语句 • 使用太“泛”的语句将使题目显得毫无意义 • 例如：“A study of rice”是一个好的论文题目么？ • 论文题目中的三要素：科学发现（结论）、研究材料、研究方法 复旦大学 卢宝荣

44. 复旦大学 卢宝荣

45. 复旦大学 卢宝荣

46. Running title/ 短题目： • 用于“页首”简短版本的题目 复旦大学 卢宝荣

47. 复旦大学 卢宝荣

48. B.论文摘要的撰写 I have the strong impression that scientific communication is being seriously hindered by poor quality abstract written in jargon-ridden & mumbo-jumbo -- Sheila M. Mcnab 复旦大学 卢宝荣

49. 摘要应该包括哪些最基本的信息？Minimum information elements • P= purpose of the study（目的） • M= methodology（方法） • R= results（结果） • C= conclusion (& recommendations)（结论&建议） PMRC:可以代表论文摘要的核心要点 复旦大学 卢宝荣

50. 复旦大学 卢宝荣