1 / 16

VARIABILITE GENETIQUE

VARIABILITE GENETIQUE. la variabilité intra-population la variabilité inter-populations. VARIABILITE GENETIQUE INTRAPOPULATION. Paramètres d’étude de la variabilité intra population : . Richesse allèlique Fréquences allèliques Indices de diversité -Taux d’hétérozygotie observé

nansen
Télécharger la présentation

VARIABILITE GENETIQUE

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. VARIABILITE GENETIQUE

  2. la variabilité intra-population • la variabilité inter-populations

  3. VARIABILITE GENETIQUE INTRAPOPULATION

  4. Paramètres d’étude de la variabilité intra population :  • Richesse allèlique • Fréquences allèliques • Indices de diversité -Taux d’hétérozygotie observé -Taux d’hétérozygotie théorique  -Taux d’hétérozygotie non biaisé 

  5. I- Richesse allélique Nombre d’allèles différents présents dans une population - Pour un locus donné : - Si plusieurs loci : Nombre moyen d’allèle par locus 1 locus ayant 4 formes alléliques Nombre individu=12 Sensible à la taille de l’échantillon Ne tient pas compte de l’abondance Un allèle rare a le même poids qu’un allèle commun A=4 A=4

  6. Tableau : Nombre d’allèles pour le microsatellite OarCP34 présents chez les 6 races ovines étudiées.

  7. II-Estimation des fréquences alléliques • les fréquences alléliques sont calculés à partir des génotypes des individus étudiés dans une population • Les fréquences alléliques sont calculées par le logiciel GENETIX 4.03 (Belkhir et al. 2002) 2 x nbr d’animaux homoz pr l’allèle i + nbr d’animaux hétéroz pr l’allèle i Pi= 2N N : nombre total d’animaux typés au locus K

  8. Exemple du groupe sanguin MN chez l'hommeL’examen de 730 aborigènes australiens a donné les résultats suivants

  9. Les fréquences alléliques calculées sont les suivantes:

  10. Tableau : Fréquences alléliques pour le microsatellite OarCP34 chez les 6 races ovines étudiées

  11. Figure : Histogramme des fréquences alléliques pour le microsatellite OarCP34 dans les 13 races ovines étudiées.

  12. III- Indices de diversité • Taux d’hétérozygotie observé • Taux d’hétérozygotie théorique  • Taux d’hétérozygotie non biaisé 

  13. Taux d’hétérozygotie théorique une valeur théorique qui correspond à l’hétérozygotie de la population, en la supposant à l’EHW. 1k Hth=1-∑ P2ikx i =1 PiKx  est la fréquence de l’allèle i au locus k dans la population x.

  14. Taux d’hétérozygotie observé • le rapport du nombre d’animaux hétérozygotes sur le nombre total d’animaux typés pour un locus.

  15. Taux d’hétérozygotie non biaisé • Utilisé lorsque le nombre d’animaux testés est faible. • Formule • logiciel GENETIX 4.03 (Belkhir et al. 2002).

  16. En raison du faible nombre d’animaux typés, pour le microsatellite OarCP34 (13 à 30 ADN), nous tiendrons compte des valeurs des taux d’hétérozygotie non biaisés

More Related