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各種 PC クラスタの性能評価

各種 PC クラスタの性能評価. 同志社大学　工学部. 廣安　知之 三木　光範 谷村　勇輔. DSO/V パラダイス Magnate SDX. 81,800 円. パソコン工房 AMPHIS-1700M4R. 89,800 円. Pentium 4 1.6GHz Memory 256MB HDD 40GB. Pentium 4 1.7GHz Memory 256MB HDD 40GB. TWO-TOP ViP 84N-SP1500. 90,800 円. Pentium 4 1.5GHz Memory 256MB HDD 20GB.

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各種 PC クラスタの性能評価

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Presentation Transcript

  1. 各種PC クラスタの性能評価 同志社大学　工学部 廣安　知之 三木　光範 谷村　勇輔

  2. DSO/VパラダイスMagnate SDX 81,800円 パソコン工房AMPHIS-1700M4R 89,800円 Pentium 4 1.6GHz Memory 256MB HDD 40GB Pentium 4 1.7GHz Memory 256MB HDD 40GB TWO-TOP ViP 84N-SP1500 90,800円 Pentium 4 1.5GHz Memory 256MB HDD 20GB 日給 \5,000だったら 1ヶ月も働くと．．．

  3. コモディティハードウエア • CPU • ハードウエア • ネットワーク 性能の向上 価格の急激な下落 COTS (Commodity-off-the-Shelf)-based scalable parallel systems

  4. PCクラスタ Hardware CPU memory motherboard hard disc case network card cable hub

  5. Super Computer TOP 500 http://www.top500.org Ranking Name # Proc Rmax (Gflops) 1 8192 7226 ASCI White 4059 2 AlphaServer SC ES45/1 GHz 3024 3228 3 Power3 375 MHz 16 way 3052 4 ASCI Red 9632 2379 5 ASCI Blue-Pacific 5808 2144

  6. Super Computer TOP 500(self made) http://www.top500.org Ranking Name # Proc Rmax (Gflops) 30 1369 706.70 CPlant/Ross Cluster 618.30 40 SCore IIIe/PIII 933 MHz 1024 256 86 Presto III Athlon 1.2 GHz 331.70 137 CLIC PIII 800 MHz 530 221.60 184 Netfinity Cluster PIII 1 GHz 320 184.40

  7. 同志社大学　クラスタシステム • Cambriaシステム • Cambriaシステム 知能情報センター 複数のアプリケーションによる PCクラスタ特性の比較

  8. Cambriaシステム仕様

  9. Gregorシステム仕様

  10. Myrinet Myricom社が開発 最大転送速度が2Gbpsの高速通信 PCクラスタコンピューティングのデファクト・スタンダードとして期待 ｰ Ethernetより優れた性能，　 　 コストパフォーマンスを発揮

  11. LinpackBenchmark Top５００などをはじめ広く使用 密行列の線形代数問題　ガウスの消去法 問題のサイズなどはユーザが指定 HPLを利用の際にはATLASを使用する • 高速なCPU • 多ノード • 膨大なメモリ • 高速なネットワーク • 適切な放熱，電源処理 • コンパイラに依存しない 並列計算機の総合的な評価に向いている

  12. Myrinet2000とEthernetの比較 Linpack Benchmarkはネットワークに依存する

  13. 公式記録 78.62GFlops （84.58GFlops） Linpack　結果 Cambria 67.03/204.8 Gflops (N=80000) Gregor 69.94/128.0 Gflops (N=40000)

  14. カットオフのある粒子シミュレーション 比較的，通信量が 大きくなるプログラム 領域をどう分割するか？ カットオフ半径内に収まる粒子との相互作用を考える

  15. 結 果

  16. 感度の並列化など GAの並列化など 最適化における並列化

  17. Distributed Genetic Algorithms(Island GAs) subpopulation migration

  18. DGA Benchmark 乱数発生の繰り返し

  19. DGAによる処理速度の向上

  20. まとめ PCクラスタの性能 CPU メモリ ネットワーク 放熱問題 • 最適化問題 • 感度の並列 • 分散遺伝的アルゴリズム

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