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Seminar Biometrie 04.07.2002. 1. Permutative Tests Jonckheere – Terpstra Trendtest für doppelt geordnete, kategoriale Daten. Lars Burmeister. Trichoderma harzianum. 2. Organismus bodenbürtiger Pilz Mykoparasit.
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Seminar Biometrie 04.07.2002 1 Permutative Tests Jonckheere – Terpstra Trendtest für doppelt geordnete, kategoriale Daten Lars Burmeister
Trichoderma harzianum 2 Organismus • bodenbürtiger Pilz • Mykoparasit Wirkung (nach Bodenimpfung) • Auflauf von Keimlingen beschleunigt • Antagonist zu bodenbürtigen Schaderregern • verringerter Befall durch Wurzel- und Blattpathogene
Experiment 3 Versuchsfrage • Beschleunigt Trichoderma harzianum den Auflauf von Bohnen (Phaseolus vulgaris ´Duffrix´)? Faktor • Konzentration von Trichoderma harzianum im Substrat • t0 – Kontrolle • T1 – 0,5 % (= 2 g / Topf) • T2 – 1 % (= 4 g / Topf) Zielvariable • Auflauf der gesäten Bohnen nach x Tagen
Datensituation 5 • r x c – Tafel • i Konzentrationsstufen (i = 1,...,r) • j Ergebnis-Kategorien (j = 1,...,c) Daten sind doppelt geordnet!
Auswertung permutativ? 6 Auswertung parametrisch? • Verteilungsannahme? // 5 Klassen?? • NEIN, weil Daten NICHT stetig, sondern kategorial (0,1,...,4) • NEIN, weil sehr viele Bindungen vorliegen Auswertung nicht-parametrisch? • hohe Fallzahl (n = 48) spricht für Asymptotik • ABER: extrem viele Bindungen (und kategoriale Daten) Auswertung permutativ! • optimal für Zähl-Daten; kleine Fallzahl; Bindungs-„stabil“
Versuchsfrage 7 • Kommt es – in Abhängkeit von der Konzentration an Trichoderma im Substrat – zu einer Erhöhung der Auflaufrate (zum Zeitpunkt x)? • Hypothesen:
Auswertung 8 • Jonckheere-Terpstra Test • 3 x 5 - Tafel • StatXact • Statistics • Doubly Ordered R x C Table • Jonckheere-Terpstra Test
p-Werte 9
Ergebnis 10 • Je höher die Konzentration an Trichoderma im Substrat, um so höher ist die Auflaufrate zum optimalen Boniturzeitpunkt x. • signifikanter Trend zwischen Konzentrationsstufen 0 – 2 • kein signifikanter Unterschied zwischen Stufen 0 und 1
Analyse 11 • pmid < pasy • aber: Unterschied nur geringfügig • asymptotische Lösung entspricht der exakten wegen hoher Fallzahl
elegantere Problemlösung 12 • Anzahl Bohnen je Gefäß erhöhen • deutlicherer Effekt • Time-to-event – Analyse Auflaufzeit bis zu Ergebnis x bonitieren
Quelle 13 Lars Burmeister. SS 2002. Diplom-Versuch Phytomedizin. 8. Semester.
Quelle 14 Lars Burmeister. SS 2002. Diplom-Versuch Phytomedizin. 8. Semester.