1 / 13

Programiranje u bioinformatici

Programiranje u bioinformatici. Zadaci. String. http://www3.ntu.edu.sg/home/ehchua/programming/java/J3d_String.html. Zadatak 1. Napravi varijablu dna tipa String koja sadrzi vrjednost od 10-tak DNA slova, te ju ispisi na ekran!. Zadatak 2.

cambria-jovan
Télécharger la présentation

Programiranje u bioinformatici

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Programiranje u bioinformatici Zadaci

  2. String http://www3.ntu.edu.sg/home/ehchua/programming/java/J3d_String.html

  3. Zadatak 1 Napravi varijablu dnatipa Stringkoja sadrzi vrjednost od 10-tak DNA slova, te ju ispisi na ekran!

  4. Zadatak 2 Varijablu dna iz prvog zadatka ispisi slovo po slovo unutar petlje for koristeci metodu charAt(int)klase String.

  5. Zadatak 3 Napravi varijablu dnanekom vrjednoscu DNA. Pomocu Stringmetode:boolean String.contains(String) provjeri dali je String”ATC” postoji unutar varijable dna?

  6. Zadatak 4 Napravi dvije String varijable. Spoji ih u trecu String varijablu, te ispsi tu trecu varijablu.

  7. Zadatak 5 Ispisi u konzolu sljedece operacije:10 % 3 = ?2 / 1 = ? 5 / 0 = ?2 > 5 = ? Np.System.out.println(”2 + 3 = ”+ (2+3) );

  8. Zadatak 6 Napravi proizvoljan niz od 5 Stringova. Prođi kroz taj niz sa for i poslje while petljom te ispiši vrjednosti niza te poziciju svake vrjednosti u nizu.

  9. Zadatak 7 Napravi listu sa klasom ArrayList, napuni listu sa vrjednostima od 0 do 10 u for petlji. Zatim u drugoj for petlji ispisi vrjednosti liste.

  10. Zadatak 8 Napravi varijablu String dna i dodjeli joj proizvoljne vrjednosti. Pomocu petlje (while ili for) izracunaj GC sastav (postotak G i C baza).

  11. Zadatak 9 Napravi metodu int brojiZnakove(String text) koja prima jedan argument tipa String. Metoda vraca broj znakova tog strigna. Testiraj metodu sa nekim stringom te ispisi rezultat.

  12. Zadatak 10 Napravi metodu koja procita FASTA datodeku sa diska, te izracuna GC sastav (%). Nakon toga, omoguci da moze citati datoteke sa vise FASTA sekvencija i ispisiavti za svaku header i GC sastav.

  13. Zadatak 11 1. Napravi program u kojem korisnik unosti DNA sekvenciju preko konzole. Provjeri dali je unesena DNA ispravna. Napravi metodu Stringreverse(String) koja vraca String u obrnutom sljedu! 2. Nakon toga ucini to sa klasom StringUtils.reverse(String) a za to je potrebno skinuti sa interneta java library commons lang, postavi taj binarni i source .jar u eclipse.

More Related