1 / 11

SNELLE (MOLECULAIRE) DIAGNOSTIEK VAN KLEINE (GEVAARLIJKE) BEESTJES

SNELLE (MOLECULAIRE) DIAGNOSTIEK VAN KLEINE (GEVAARLIJKE) BEESTJES. van high tech tot Senseo. Dr. J. Frans Klinisch Laboratorium Ipodium, 15/03/2008. WAT IS SNEL IN MICROBIOLOGIE? (kweek). VROEGER (sputumkultuur): 3 dagen Maandag: bodems maken, enten, gramkleuring

charla
Télécharger la présentation

SNELLE (MOLECULAIRE) DIAGNOSTIEK VAN KLEINE (GEVAARLIJKE) BEESTJES

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. SNELLE (MOLECULAIRE) DIAGNOSTIEK VAN KLEINE (GEVAARLIJKE) BEESTJES van high tech tot Senseo Dr. J. FransKlinisch Laboratorium Ipodium, 15/03/2008

  2. WAT IS SNEL IN MICROBIOLOGIE? (kweek) • VROEGER (sputumkultuur): 3 dagen • Maandag: bodems maken, enten, gramkleuring • Dinsdag: aflezen primaire bodem en inzetten identificatiereeks en antibiogram • Woensdag: identificatiereeks en antibiogram aflezen; antwoorden (per brief) • NU (sputumkultuur): 1,5 dagen • Maandag: bodems nemen, enten, gramkleuring • Dinsdag: aflezen primaire bodem en om 8:00u inzetten op automaat (VITEK); ‘s middags rond 15:00u zijn er al afgewerkte resultaten (online)

  3. WAT IS SNEL IN MICROBIOLOGIE? (antigen) • Via snelle antigendetectie, heel wat betrouwbare diagnostiek beschikbaar op primaire staal, binnen het kwartier: • Bloed: Malaria, (Mycoplasma IGM), EBV IgG en IgM, Paul&Bunnel • Feces: Adenovirus 40-41, Clostridium toxines, Helicobacter pylori, Rotavirus, Cryptosporidium,Giardia • Naso-pharyngeale wisser: Influenza, RSV • Urine: Legionella, S. pneumoniae Probleem: kost

  4. WAAROM MOLECULAIRE? • Probleem: heel wat organismen zijn zeer moeilijk (langzaam) kweekbaar of aanvankelijk in heel kleine getallen aanwezig • Bv. Hepatitisvirussen, C. trachomatis, P. jirovecii • 1983: Kary Mullis: PCR • (idee tijdens nachtelijke rit langs Highway 1 na feestje) • 1993 Nobelprijs chemie http://www.virusmyth.net/aids

  5. MOLECULAIRE: EXTRACTIE

  6. MOLECULAIRE: AMPLIFICATIE

  7. F F F F Q Q Q Q MOLECULAIRE: DETECTIE NASBA reactie 20 µl Fluorescent signaal (real-time) Normalized fluorescence 0 10 20 30 40 50 60 Time (minutes)

  8. MOLECULAIRE: VOLAUTOMATISCH? • GeneXpert Technology (Cepheid) • “Sample in, Answer out” • TAT < 60 min, all inclusive • Biohazard Detection System • United States Postal Service • Anthrax testing in mail sorting facilities • Uitbreiding • Y. pestis, F. tularensis • Klinisch • MRSA (Imelda) • 28,80 EUR reagenskost • Enterovirus • 67,70 EUR reagenskost • Tumordetectie peroperatief http://www.cepheid.com/mrsa/video.html

  9. MOLECULAIRE: SEQUENCING • Principe: Het 16 S ribosomaal RNA gen is sterk bewaard • Binnen eenzelfde species en tussen species van hetzelfde genus • Kunnen we dit stuk amplificeren, in stukken knippen, sequentie bepalen en de uitkomst vergelijken met een “genbank”? • Nieuwe “gouden standaard” voor identificatie van bacteriën tot op species niveau • Op gegroeide kolonies bacteriën • Rechtstreeks op staal!! • Casus: jongedame met pleura-empyeem door S. pyogenes • Casus: Histoplasma capsulatum bijnieren • Samenwerking labo VJZ-Hasselt (Dr. R. Cartuyvels): bacteriën • Samenwerking labo H-Hart Roeselare (Dr. E. Delaere): fungi • Voorlopig niet mogelijk voor virusdiagnostiek

  10. MOLECULAIRE: MICRO-ARRAY

  11. MOLECULAIRE: DAGELIJKSE PRAKTIJK • Chlamydia pneumoniae (BA, BAL, NP) • Chlamydia trachomatis (O, U, W) • CMV (A, B, O, U) • EBV (B) • Enterovirus (B, CSV, F, W) • HBV (S) • HCV (S) • HIV (B) • hMPV (NP) • HPV (+mRNA) (W) • HSV (BA, BAL, CSV, O, S, W) • Mycobacterium tuberculosis (Sp) • Mycoplasma pneumoniae (BA, BAL, NP) • Norovirus (F) • Parvo B19 (A) • Pneumocystis jirovecii (BA, BAL) • Polyomavirus (CSV, U) • Toxoplasma (A, CSV, O) • VZV (CSV, O, W) A: Amniosvocht B: Bloed (EDTA) BA: Bronchusaspiraat BAL: Broncho Alveolaire Lavage CSV: Cerebrospinaal Vocht F: Faeces NP: Nasopharyngeale wisser O: Oog S: Serumbube Sp: Sputum U: Urine W: Wisser Reeds uitgevoerd in Imelda

More Related