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第二章 电离辐射的分子生物学效应. 核酸概述. 核酸是一类重要的生物大分子,担负着生命信息的储存与传递。 核酸是现代生物化学、分子生物学的重要研究领域,是基因工程操作的核心分子。. 核酸的种类和分布. 核酸分为两大类: 脱氧核糖核酸 ( Deoxyribonucleic acid , DNA ) 核糖核酸 ( Ribonucleic acid , RNA ). DNA 的分布:. 98 %核中(染色体中) 真核 线粒体( mDNA ) 核外 叶绿体( ctDNA ) DNA 拟核 原核 核外:质粒( plasmid )
E N D
核酸概述 • 核酸是一类重要的生物大分子,担负着生命信息的储存与传递。 • 核酸是现代生物化学、分子生物学的重要研究领域,是基因工程操作的核心分子。
核酸的种类和分布 • 核酸分为两大类: • 脱氧核糖核酸 (Deoxyribonucleic acid ,DNA) • 核糖核酸 (Ribonucleic acid,RNA)
DNA的分布: 98%核中(染色体中) 真核线粒体(mDNA) 核外 叶绿体(ctDNA) DNA拟核 原核 核外:质粒(plasmid) 病毒:DNA病毒
tRNA • rRNA • mRNA • 其它 • RNA病毒:SARS • RNA主要存在于细胞质中 分子生物学的中心法则
碱基 核苷 戊糖 核酸 核苷酸 磷酸 元素组成: C H O N P 核酸的基本化学组成
Ribose Deoxyribose 一、戊糖 组成核酸的戊糖有两种。DNA所含的糖为 β-D-2-脱氧核糖;RNA所含的糖则为β-D-核糖。
6 二、碱基 7 5 1 8 2 1、嘌呤(Purine) 4 9 3 • 鸟嘌呤guanine • 腺嘌呤Adenine A G
2. 嘧啶(Pyrimidine) 4 5 3 6 2 1 尿嘧啶 uracil 胞嘧啶 cytosine 胸腺嘧啶 thymine U C T
核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类很多,大部分是上述碱基的甲基化产物。核酸中也存在一些不常见的稀有碱基。稀有碱基的种类很多,大部分是上述碱基的甲基化产物。
5’ 5’ 4’ 1’ 4’ 1’ 3’ 2’ 3’ 2’ (OH) (OH) 三、核苷(nucleoside) • 核苷:戊糖+碱基 • 糖与碱基之间的C-N键,称为C-N糖苷键
H H H H H H H H H 四、核苷酸(nucleotide)核苷酸核苷+磷酸 戊糖+碱基+磷酸
5’ 3’ 5’ 3’ 五、多聚核苷酸(核酸) • 多聚核苷酸是通过一个核苷酸的C3’-OH与另一分子核苷酸的5’-磷酸基形成3’,5’-磷酸二酯键相连而成的链状聚合物。
T U OH OH OH OH OH OH 3’ 5’ 3’ 5’ • 5′-磷酸端(常用5’-P表示);3′-羟基端(常用3’-OH表示) • 多聚核苷酸链具有方向性,当表示一个多聚核苷酸链时,必须注明它的方向是5′→3′或是3′→5′。 多聚核苷酸的表示方式 DNA RNA 5′PdAPdCPdGPdTOH 3′ 5′PAPCPGPUOH ′ 或5′ACGTGCGT 3′ 5′ACGUAUGU 3′ ACGTGCGT ACGUAUGU
DNA的结构 • DNA的一级结构 • 脱氧核糖核酸的排列顺序 • 可以用碱基排列顺序表示 • 连接键:3’,5’-磷酸二酯键 • 磷酸与戊糖顺序相连形成主链骨架 • 碱基形成侧链 • 多核苷酸链均有5’-末端和3’-末端
DNA的碱基顺序本身就是遗传信息存储的分子形式。生物界物种的多样性即寓于DNA分子中四种核苷酸千变万化的不同排列组合之中。
基因与基因组 • 基因(gene) 编码有功能的蛋白质多肽链或RNA所必需的全部核酸序列(DNA序列) 一段有功能的DNA片段,生物细胞中DNA分子的最小功能单位(交换单位)。 一个基因不仅包括编码蛋白质肽链或RNA的核酸序列,还包括保证转录所需的调控序列,,位于编码上游5‘端的非编码序列、内含子和位于编码下游3’端的非编码序列。
蛋白质(mRNA→蛋白质) 结构基因 产物 tRNA 基 因 RNA rRNA 调节功能:调节基因 无产物 作用未知
基因组(genome) 某生物体(完整单倍体)所含全部遗传物质的总和。 包括:核基因组(拟核/核DNA)及核外(质粒/质体DNA)
bp(碱基对) 人 两栖类 鱼类 藻类 酵母 细菌 E.Coli 病毒 质粒 103 104 105 106 107 108 109 1010 1011 1012 各种细胞、病毒和细菌质粒中基因组的大小
DNA的二级结构 • DNA的双螺旋模型 • 1953年,J. Watson和F. Crick 在前人研究工作的基础上,根据DNA结晶的X-衍射图谱和分子模型,提出了著名的DNA双螺旋结构模型,并对模型的生物学意义作出了科学的解释和预测。 • 在DNA分子中,嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。
2.0 nm 小沟 大沟
稳定双螺旋的力 • 氢键 • 碱基堆积力(疏水相互作用及范德华力) • 离子键等 • DNA变性剂(热、pH、脲/酰胺、有机溶剂)
DNA双螺旋缠绕在组蛋白珠外形成核小体,核小体自身堆积成纤维,纤维折叠起来并卷曲成不规则的螺旋状,形成染色体。DNA双螺旋缠绕在组蛋白珠外形成核小体,核小体自身堆积成纤维,纤维折叠起来并卷曲成不规则的螺旋状,形成染色体。
一、电离辐射致DNA的损伤 • 电离辐射损伤DNA途径: • 直接作用 指射线直接作用于DNA分子,通过电离和激发使DNA受到损伤。 • 间接作用 指射线与DNA周围其它原子或分子特别是水分子作用,产生具有很高活性的自由基(如·OH,·H和eaq-)进而损伤DNA。
二、电离辐射致DNA分子的变化 • DNA链断裂—单链断裂(SSB) 双链断裂(DSB) • DNA交联—DNA链交联 DNA-蛋白质交联 • DNA二级和三级结构的变化 其中DSB是辐射所致生物学效应中最重要的原初损伤,而非重接性的DSB则被认为是细胞杀伤效应的最重要的损伤。
一、DNA链断裂(DNA strand break) • 单链断裂(single strand break,SSB):DNA双螺旋结构中一条链断裂 • 双链断裂(double strand break,DSB):DNA双螺旋结构中两条互补链于同一对应处或相邻处同时断裂
单链断裂 双链断裂
一)、DNA链断裂的分子机制 • (1)脱氧戊糖和磷酸二酯键的破坏(直接) 三种自由基:eaq-,.OH,H. DNA链断裂主要与.OH作用有关,从脱氧戊糖抽氢,形成了5中不同的反应产物。
.OH从脱氧戊糖中抽氢,主要作用于C(3’,5’),C(3’)上磷酸二酯键断裂多余C(5’)端。.OH从脱氧戊糖中抽氢,主要作用于C(3’,5’),C(3’)上磷酸二酯键断裂多余C(5’)端。 .OH攻击糖基C(1’、2’、4’)形成碱不稳定性位点(alkali labile sites, ALS),这些位点在碱处理后发生链断裂。
碱不稳定性位点( ALS) .OH对C(1’), C(2 ’), C(3’), C(4’)攻击后的产物,在与六氢吡啶供热后都能导致DNA链的断裂。所以,在DNA链上含有损失后经碱处理后导致DNA链断裂的位点,这些位点称为碱不稳定性位点( ALS)
5 3
(2)碱基损伤 (base damage) • 1、充氧溶液中碱基损伤 • 嘧啶碱:羟自由基攻击5、6位 • 腺嘌呤:羟自由基攻击8位 • 鸟嘌呤:羟自由基攻击4、5、8位 • 2、细胞中碱基损伤 • 进展不大,用电子自旋共振仪
鸟嘌呤guanine • 腺嘌呤Adenine 5 8 8 4 A G
酶敏感位点(enzyme sensitive sites,ESS):碱基损伤可引起DNA双螺旋的局部变性,特异的核酸内切酶能识别和切除这种损伤,并通过酶的作用,产生链断裂。这种特异性酶敏感位点称为ESS。 无嘌呤或无嘧啶位点(apurinic/apyrimidinic sites , APS):DNA链上损伤的碱基可被特异的DNA-糖基化酶除去或由于N-糖基键的化学水解而丢失,形成APS。形成APS在内切酶的作用下形成链断裂。
二)、不同条件下辐射所致的DNA链断裂 • 1、充氧溶液中 DNA双链上引起SSB的概率均等,产额与放置时间、溶液PH有关。 2、固态下照射DNA 产生SSB与 PH有关。 以上两种情况均可产生ALS。 3、细胞中DNA受照射:与周围介质有关
三)、辐射引起DNA链断裂的主要特点 • 1、SSB与DSB的比值:10~20 • 2、LET对链断裂的影响:随LET增加,SSB降低,DSB增加。 • 3、氧效应对链断裂的影响:断裂增加,SSB增加明显。 • 4、DNA链断裂的部位:有争议。与ALS与碱基本身有关。
碱基位置发生断裂的顺序:G>A>T≥C(低剂量),T>G>A≥C • 5、DNA链断裂与细胞辐射敏感性的关系 • 无明显关系 • 损伤后修复与敏感性有关。