Současné možnosti studia na MU se zaměřením na biologii a představení moderního studijního oboru Matematická biologie

1. Současné možnosti studia na MU se zaměřením na biologii a představení moderního studijního oboru Matematická biologie Bc. Renata Chloupková Brno 2. dubna 2014

2. Obsah prezentace • Zázemí na PřF MU • Obory se zaměřením na biologii • Matematická biologie Studium biologie na MU; Matematická biologie

3. Přírodovědecká fakulta • areál Kotlářská • botanická zahrada • Univerzitní kampus • moderní prostory • studium, výzkum, volnočasové aktivity Studium biologie na MU; Matematická biologie

4. BIOLOGIE: programy a obory • Biologie • Lékařská genetika a molekulární diagnostika • Ekologická a evoluční biologie • Ekologická a evoluční biologie • Experimentální biologie • Matematická biologie • Molekulární biologie a genetika • Speciální biologie • Biologie se zaměřením na vzdělávání Studium biologie na MU; Matematická biologie

5. prezenční forma studia povinná TV (2 semestry) odborná AJ (úroveň B1) odborný jazyk (AJ, F, N, RJ, Šp) – úroveň B2 Studium biologie na MU; Matematická biologie

6. přijímací řízení: • TSP + odborný test • prominutí přijímacího řízení: regionální (krajské) kolo vědní disciplína související s oborem do 1,5 Bi + Ch + 2 profilové předměty regionální (krajské) kolo vědní disciplína související s oborem Studium biologie na MU; Matematická biologie

7. Lekářská genetika a molekulární diagnostika • LF + PřF (=biomedicína) • důraz na praktické zaměření oboru • uplatnění v klinických laboratořích • genetika, cytogenetika, DNA diagnostika • předměty: Bi, Ch, F + M • 2013: Studium biologie na MU; Matematická biologie

8. Speciální biologie • 1. rok studia: společný základ (důraz na Ch) • Experimentální biologie rostlin • předměty v AJ, Antarktida • Experimentální biologie živočichů a imunologie • Mikrobiologie a molekulární biotechnologie • velký důraz na bioinformatiku • Ekotoxikologie • Recetox: • moderní pracoviště, inovace výuky • 2013: Studium biologie na MU; Matematická biologie

9. Molekulárníbiologie a genetika • moderní oblast biologie → velký zájem • 2013: • důraz na chemii (i praktická cvičení) • 2 směry, 1. rok studia společný: • Molekulární biologie a genetika • Antropogenetika obtížná SZZ přijetí na nMgr. Studium biologie na MU; Matematická biologie

10. Ekologická a evoluční biologie • nejvíce „popisná“ biologie • podrobná taxonomie i s cvičeními • terénní cvičení, exkurze (i zahraničí) • méně chemie oproti ostatním oborům • směry v nMgr: botanika a zoologie • uplatnění: Akademie věd, muzea, CHKO, Zoo,… • modernizace výuky, UKB • Ústav botaniky a zoologie • 2013: Studium biologie na MU; Matematická biologie

11. Biologie se zaměřením na vzdělávání • pedagogicko-psychologický základ + obecné odborné předměty napříč oborem • dvouobor: Bi + Fyzika, Matematika, Geografie nebo Informatika a druhý obor • 2013: Studium biologie na MU; Matematická biologie

12. Matematická biologie • založeno 1999, od 2003 pod IBA*, 2004 nové osnovy • aplikace matematických postupů a nástrojů pro řešení biologických a medicínských problémů • IBA = Institut biostatistiky a analýz • Lékařské a Přírodovědecké fakulty MU • vědeckovýzkumná činnost, řešení vědeckých projektů a poskytování souvisejících služeb • zejména v oblasti analýzy biologických a klinických dat, organizace a managementu klinických studií, vývoje softwaru a aplikace ICT Studium biologie na MU; Matematická biologie

13. Biologie a medicína bez analýzy dat dnes již není možná. • obor vznikl ze současné potřeby trhu • obor zaměřený na matematickou analýzu biologických a medicínských dat • cíl oboru: produkce odborníků se znalostí biologické i matematické podstaty problému Studium biologie na MU; Matematická biologie

14. Studium biologie na MU; Matematická biologie

15. Modelování dynamiky a vzájemných vztahů populací. • Modelování interakcí mezi chemickým látkami, prostředím a živými systémy. Studium biologie na MU; Matematická biologie

16. Sledování aktivity genů, analýza buněčných drah, sledování epigenetických změn • Sledování a srovnávání sekvence proteinů a nukleových kyselin • Studium strukturálních vztahů nukleových kyselin a proteinů Studium biologie na MU; Matematická biologie

17. Lucie Brožová: Metody hodnocení genetických asociačních studií (ukázka části práce) • zhodnocení asociace mezi výsledkem přímé mikroskopie a genetickou výbavou koně • testováno 101 Murgeských koní přítomnost parazitů přítomnost SNP Studium biologie na MU; Matematická biologie

18. hodnocení asociace pro více SNP současně (MDR): • datový soubor pro koně starší 2,5 let včetně (N=76) • kontrola kvality dat: • hodnocení vazebné nerovnováhy: maximální hodnota r2=0,44 • hodnocení Hardyho- Weinbergovy rovnováhy Model MDR Rizikový genotyp Genotyp bez rizika • Koně pozitivní v DM/koně negativní v DM=20/56=0,263 DM – přímá mikroskopie, M – minoritní alela, wt – obvyklá alela Studium biologie na MU; Matematická biologie

19. Aplikovaná analýza dat klinických experimentů • Hodnocení klinických studií • Hodnocení biologických společenstev Studium biologie na MU; Matematická biologie

20. Lucie Panáčková: Statistické modely pro hodnocení ekologického stavu stojatých vod pomocí fytobentosu • data z povodí Moravy, 21 nádrží • cíl: Pilotní analýza ekologického stavu nadrží s využitím statistických metod. (ukázka části práce) Studium biologie na MU; Matematická biologie

21. rozdělení nádrží podle chemických parametrů: • Obsah chemických látek se odráží na výskytu rozsivek v nádržích, jejich počtu i diverzitě. • S kvalitnější vodou počet rozsivek i jejich diverzita roste • Na vliv chemického složení nádrží má značný vliv také geografické charakteristiky nádrží (zejména nadmořská výška). • Nelze jednoznačně prokázat, zda rozsivky mají určitá specifika na trofický stav nádrže nebo je jejich přítomnost ovlivněna i jinými vlastnostmi nádrže. I. II. III. Studium biologie na MU; Matematická biologie

22. Zita Macháčková: Hodnocení nákladové efektivity programů prevence zhoubných nádorů (ukázka části práce) • program mamografického screeningu • od 2002, prevence rakoviny prsu poznámka: webový portál http://www.svod.cz/ Studium biologie na MU; Matematická biologie

23. Studium biologie na MU; Matematická biologie

24. Možnosti uplatnění Státní správa Česká informační agentura ŽP Agentura ochrany přírody a krajiny Zdravotní pojišťovny Komerční sféra Farmaceutické firmy Firmy vedoucí a hodnotící klinické studie Společnosti pro marketingové průzkumy 10% 10% 60% 20% Zdravotnictví Státní i soukromá zdravotnická zařízení Akademická sféra (Výzkum a vývoj) Mezinárodní centra klinického výzkumu Zahraniční univerzity IBA MU Studium biologie na MU; Matematická biologie

25. Zhodnocení oboru Studium biologie na MU; Matematická biologie

26. Skripta zdarma Studium biologie na MU; Matematická biologie

27. Letní školy • setkání v rámci oboru • každý rok jiné téma • přednášky domácích i zahraničních odborníků Studium biologie na MU; Matematická biologie

28. Možnost práce se špičkovými programy Studium biologie na MU; Matematická biologie

29. Předpoklady pro studium • Nebát se matematiky • vhodná znalost diferenciálního a integrálního počtu • Zajímat se o biologii • Mít vztah i k dalším oborům (medicína, chemie, ekologie, informatika) Komplexní pojetí = mezioborové zaměření → obtížné, ale s obrovským potenciálem. Studium biologie na MU; Matematická biologie

30. Přijímací řízení • Test studijních předpokladů • bez přijímací zkoušky: • studijní průměr do 1,5 z matematiky, biologie a chemie + jednoho dalšího profilového předmětu ∧ maturita z M+Bi nebo M+Ch • 2013: Studium biologie na MU; Matematická biologie

31. Děkuji za pozornost. renata.chloupkova@mail.muni.cz Studium biologie na MU; Matematická biologie

32. Zdroje, doporučené odkazy: • www.muni.cz • www.sci.muni.cz • www.iba.muni.cz • www.matematickabiologie.cz • Studijní katalog BIOLOGIE, 2013: http://www.sci.muni.cz/katalog/katalog2013/katalogB.pdf • Aktuální informace pro přijímací řízení (bc studium): http://www.sci.muni.cz/cz/PriBc/ • Prominutí přijímací zkoušky (bc studium): http://www.sci.muni.cz/cz/PriBc/Prijimaci-zkousky • Přehled otevíraných oborů na PřF MU: http://www.sci.muni.cz/cz/PriBc/Otevirane-obory • Statistiky z přijímacího řízení na MU (2013): • http://is.muni.cz/do/1499/metodika/stud/prijriz/zpravy/posledni/Prijimaci_rizeni_PriF-Bc_-_zprava.pdf • http://is.muni.cz/do/1499/metodika/stud/prijriz/zpravy/posledni/Prijimaci_rizeni_PriF-NMgr_-_zprava.pdf • Ukázky závěrečných prací: • BROŽOVÁ, Lucie. Metody hodnocení genetických asociačních studií [online]. 2012 [cit. 2014-03-26]. Bakalářská práce. Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta. Vedoucí práce Michaela Cvanová. Dostupné z: <http://is.muni.cz/th/357561/prif_b/>. • PANÁČKOVÁ, Lucie. Statistické modely pro hodnocení ekologického stavu stojatých vod pomocí fytobentosu [online]. 2012 [cit. 2014-03-26]. Bakalářská práce. Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta. Vedoucí práce Simona Littnerová. Dostupné z: <http://is.muni.cz/th/356971/prif_b/>. • MACHÁČKOVÁ, Zita. Hodnocení nákladové efektivity programů prevence zhoubných nádorů [online]. 2012 [cit. 2014-03-26]. Bakalářská práce. Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta. Vedoucí práce Ondřej Májek. Dostupné z: <http://is.muni.cz/th/356966/prif_b/>. Studium biologie na MU; Matematická biologie

33. Obrázky v prezentaci • http://www.muni.cz/sci/general/mu_presentation/logos • http://www.muni.cz/history/artworks/1205/1 • http://www.ukb.muni.cz/index.php/fotogalerie.html • http://www.muni.cz/history/events_gallery/1187/ • http://www.muni.cz/general/events/p233332/gallery/ • http://www.molekulara.cz/odborne-aktivity/ • http://polar.sci.muni.cz/cs/fotogalerie • http://www.recetox.muni.cz/index.php?pg=aktuality&aid=385 • http://www.sci.muni.cz/ueb/studium/bakalarske-studium/lekarska-genetika-a-molekularni-diagnostika/ • http://www.sci.muni.cz/zoolecol/verteb/gallery/pc020023.jpg • http://www.sci.muni.cz/botany/systemgr/fotoarchiv.php?dir=Laboratories%20and%20Field&show=02.jpg&lang= • http://pipz.webnode.cz/vtipy-o-skole-/ • http://www.matematickabiologie.cz/res/image/layout/studenti03-680-170.jpg • http://www.iba.muni.cz/res/image/homepage/matematicka-biologie.gif • http://www.matematickabiologie.cz/res/image/layout/priroda03-680-170.jpg • http://en.wikipedia.org/wiki/Single-nucleotide_polymorphism • http://www.linkos.cz/files/pro_odborniky/nop/registry/NOR.jpg • loga programů: • http://www.itbiz.cz/images/upload/s/sas.jpg • http://www.vscht.cz/ext/haimg/11/Matlab/matlab.png • http://pixhost.me/avaxhome/4a/2c/00102c4a_medium.jpeg • http://rhrv.r-forge.r-project.org/css/images/R.png • http://upload.wikimedia.org/wikipedia/en/b/b8/Ibm-spss-statistics-17.png • https://ui.pefka.mendelu.cz/files/image/Technika/statistica.jpeg • https://ui.pefka.mendelu.cz/files/image/Technika/arcgis.gif Studium biologie na MU; Matematická biologie