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定序工作介紹

定序工作介紹. 中班. 晚班. 分析人員. 工作流程. 菌的樣品. 14hrs. 1 0 Day :. 收 件. 當天養菌. 電泳檢視 (1hr). 2 0 Day :. 抽取 plasmid DNA (4hrs) ( 中午前完成 ). 添加 Big Dye 反應試劑 (2hrs) ( 下午 5~6 點完成 ). PCR 循環 cycle (4hrs). ( 會依客戶的 primer Tm 值改變 annealing temperature). 酒精沉澱 (2hrs). 放置到 3730 機器中 (1run 需 2hrs)

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定序工作介紹

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Presentation Transcript

  1. 定序工作介紹

  2. 中班 晚班 分析人員 工作流程 菌的樣品 14hrs 10 Day : 收件 當天養菌 電泳檢視 (1hr) 20 Day : 抽取plasmid DNA (4hrs) (中午前完成) 添加Big Dye反應試劑 (2hrs) (下午5~6點完成) PCR循環cycle (4hrs) (會依客戶的primer Tm值改變annealing temperature) 酒精沉澱 (2hrs) 放置到3730機器中 (1run需2hrs) (12:00 pm準時上機) 30 Day : 分析結果、上傳檔案、寄發mail、列印紙本

  3. PS.若有抽不到plasmid DNA或DNA濃度太低時 即會判定重養或預養 (以單管養3 ml) 抽取DNA的方式則採取以單管Kit的方式 PS.若當天收回來的菌為客戶剛塗或剛點菌 (尚未有菌長出時會再培養箱內培養一天後再點在養菌盤中 此時會發mail告知客戶Data會delate並不表示菌有問題)

  4. 工作流程 Plasmid DNA & PCR product DNA直接電泳檢視(1hr) 中班 10 Day : 收件 (下午3點前) PCR純化 (30min~1hrs) 電泳檢視 (1hrs) 添加Big Dye反應試劑 (2hrs) (下午5~6點完成) PCR循環cycle (4hrs) 酒精沉澱 (2hrs) 晚班 放置到3730機器中 (1run需2hrs) (12:00準時上機) 20 Day : 分析結果、上傳檔案、寄發mail、列印紙本 分析人員

  5. 工作流程 Plasmid DNA & PCR product DNA直接電泳檢視(1hr) 中班 10 Day : 收件 (下午5點後) PCR純化 (30min~1hrs) 電泳檢視 (1hr) 進行Big Dye反應 (2hrs) (晚上8:00~) PCR循環cycle (4hrs) 20 Day : 酒精沉澱 (2hrs) 放置到3730機器中 (1run需2hrs) (10:00am準時上機) 早班 分析結果、上傳檔案、寄發mail、列印紙本 (12:00am ~ 6:00pm) 分析人員

  6. PS1. 3730為48根毛細管，一次需花費2個小時 PS2.固定上機時間為當日12 pm (當日中午Sample + 前日菌的sample) 以及隔日10 am (當日下午sample) PS3.晚上機器可以跑的最大數量: 2盤半 (5 runs) 上午上機可以跑的最大數量: 2盤 (4 runs)

  7. 寄發郵件,上傳GBST, 聯絡客戶 Tm值:做反應, 分析 養菌 樣品品質, 反應

  8. ☆ 送件注意事項

  9. 定序結果分析 1.依照反應單Key-in客戶資料夾 (訂單編號、單位名稱與實驗室主持人) 2.將客戶Data分別放入資料夾中 3.以分析軟體分析客戶的結果 4.若需重做則填寫重做單並打電話告知客戶 5.將客戶的定序結果上傳至GBST系統 6.若有歸還樣品的部分，則在正副本上均以螢光筆標示 並將訂單正本交給實驗室人員處理

  10. PCR product-1

  11. Plasmid DNA-1 1

  12. Plasmid DNA-1 2

  13. 謝謝大家!

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