1 / 16

Разрабатываемые технологии NGS

Рынок существующих технологий. Разрабатываемые технологии NGS. Владислав Трошин vladislav.troshin@gmail.com 8-929-509-44-89. ООО «Троицкий Инженерный Центр» Россия, 142190 г. Москва, г. Троицк, Сиреневый бульвар, д.1 . www.trdc.com. Рынок существующих технологий.

jun
Télécharger la présentation

Разрабатываемые технологии NGS

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Рынок существующих технологий Разрабатываемые технологии NGS Владислав Трошин vladislav.troshin@gmail.com 8-929-509-44-89 ООО «Троицкий Инженерный Центр» Россия, 142190 г. Москва, г. Троицк, Сиреневый бульвар, д.1. www.trdc.com

  2. Рынок существующих технологий

  3. Мировой рынок NGS систем Гонконг Сингапур Общее число устройств превышает 2500 шт. по данным из открытых источников и 10000 тысяч штук оценочное число. Так, в Китае оценочное число NGS систем 500-700 шт. Явно большее число устройств в Японии, Израиле, скандинавских странах.

  4. Стоимость секвенирования Стоимость секвенирования падает очень быстрыми темпами: • Завершение проекта «Геном человека»; • Выход на рынок первых NGS систем; • Появление и распространение настольных NGS систем, снижение стоимости обработки данных; • ? Если цена секвенирования генома упадет ещё на 2 порядка, то данная технология станет доступной практически любому человеку. 1 http://www.genome.gov/sequencingcosts/ 2 3 4 Кроме научных исследований активно начинается использование NGS систем в медицине, начинает развиваться персонализированная медицина. На рынке уже представлены компании с продуктами для персональной медицины. К примеру, компании Myriadhttp://www.myriad.com/products/ и Cardiodxhttp://www.cardiodx.com , предлагающие продукты для диагностики заболеваний, связанных с генетикой. Их генетические тесты уже прошли все стадии проверки, клинические тесты и доступные на рынке.

  5. Поколения NGS систем

  6. Распределение по платформам В основном секвенаторы второго и третьего поколений. Распространение секвенаторов первого поколения ограничивает высокая стоимость устройства, единичного анализа и время работы. Большинство устройств для секвенирования имеет стоимость выше 150000 USD, требует доступа к значительным вычислительным устройствам (суперкомпьютерам, облачным сервисам), имеют высокую цену обслуживания и запуска, таким образом приобрести и использовать оптические NGS секвенаторы могут только крупные научные центры.

  7. Распределение по платформам Общий рынок NGS систем, расходных материалов, сервисного обслуживания и т.д. составил в 2011 году 1.6 миллиарда USD. В 2013 году уже 2-2,5 миллиарда USD. Прогнозируется рост до 5-6.6 миллиардов USD к 2016 году. Только устройств второго и третьего поколения продано за все время их выпуска на рынок на сумму более 1 миллиарда USD. Например, рыночная капитализация компании Illumina (NASDAQ: ILMN)более 18.6 млрд. USD, а капитализация Pacific Bioscience (NASDAQ: PACB) более 317 млн. USD.

  8. Общая ситуация Основным лидером в области высокопроизводительных систем являются компания Illumina (второе поколение секвенаторов). В области настольных систем для анализа относительно небольших последовательностей LifeTechnologies (Ion PGM – второе-третье поколение) по числу установленных секвенаторов и компания IIlumina (MiSeq) от выручки от проданных устройств. Но учитывая относительно недавний выход IonTorrent на рынок при очень активных продажах наиболее вероятно их лидерство в этом сегменте рынка. Вывод в начале 2012 года нового продукта для анализа полных геномов (Ion Proton – более производительная версия Ion PGM) по цене в 150000 USD может сместить рынок в сторону их продуктов. Происходит вывод на рынок устройств 3-го поколения. Несколько компаний разрабатывает устройства 4-го поколения. Происходит разделение рынка на два направления – секвенаторы с высокой производительностью, высокой стоимостью для научных центров (более 150000 USD) и секвенаторы с низкой производительностью (настольные системы) для отдельных лабораторий (устройства Ion Torrent PGM, Illumina MiSeq и Roche 454 GS Junior – стоимостью до 150000 USD). Разделение линеек продукции основных производителей на два направления. Производительные системы для научных центров и настольные системы для лабораторий и малых компаний. Цены устройств делятся аналогично 300-900 тыс. USD за большие системы, менее 150 тыс. USD за настольные системы. Появляются «промежуточные системы» - Next Seq 500. Устойчивый ростотрасли. Потребность в устройствах для диагностики с низкими затратами на обслуживание. Цена самого устройства влияет пока незначительно. Основная масса проданных устройств относится к верхнему ценовому диапазону.

  9. Разрабатываемые технологии

  10. Нанопоры Для секвенирования с использованием пор предлагают различные технологии. В общем виде технологии основаны на том, что при прохождении ДНК через пору регистрируется какой-либо сигнал. Это может быть ионный ток, туннельный ток, изменение ёмкости, флюоресценция и т.д. Genia Technologies, Inc. http://www.geniachip.com/ Регистрируется изменение тока при прохождении отдельных нуклеотидов через нанопоры. OxfordNanoporeTechnologies https://www.nanoporetech.com Регистрируется изменение тока при прохождении отдельных нуклеотидов через нанопоры или прохождения цепочки ДНК через пору. Предполагается использовать различные варианты пор (биологические, изготовленные методом литографии, из графена и т.д.) IBM Регистрируется изменение тока при прохождении цепочки ДНК через сформированное методами литографии устройство.

  11. Нанопоры Nabsys http://nabsys.com/ Регистрируется изменение тока при прохождении цепочки ДНК с метками через поры. Noblegen Biosciences, Inc.  http://www.noblegenbio.com/Technology.html Регистрируется изменение тока при прохождении цепочки ДНК с метками через поры. Другой метод предполагает регистрацию флуоресценции меток при прохождении цепочек ДНК через поры.

  12. Нанопоры Two Pore Guys http://twoporeguys.com/ Дополнительно к регистрирующей поре добавляются ещё два слоя для фиксации цепочки ДНК. HEWLETT PACKARD US 2006/0275911 A1 ДНК протаскивают между частицами серебра в фокусе лазерного излучения для получения SERS.

  13. Электронный микроскоп ZS Genetics http://www.zsgenetics.com/ Секвенирование с помощью электронного микроскопа. Цепочки ДНК допируют атомами тяжёлых металлов.  Electron Optica http://www.electronoptica.com/ Секвенирование с помощью электронного микроскопа. Цепочки ДНК допируют атомами тяжёлых металлов.

  14. Чипы GenapSys http://genapsys.com/ Секвенирование на чипах. Предположительно в основе технологии лежит изменение силы тока при присоединении новых нуклеотидов. Существует ещё около 30 компаний с различными проектами на стадии R&D.

  15. Троицкий инженерный центр ООО «Троицкий инженерный центр» - частная коммерческая организация, созданная для проведения научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, производство и продажи наукоёмкой продукции, оказания консалтинговых и маркетинговых услуг в области высоких технологий. Мы предлагаем услуги по инженерному, маркетинговому и технологическому сопровождению разработок в области оптической спектроскопии, электроники и связанных областях. Пример задачи: создание считывающего устройства для микрофлюидных чипов. Цена коммерческих устройств около 2 млн. руб. Отечественного пока не представлено.

  16. Спасибо за внимание! Владислав Трошин vladislav.troshin@gmail.com 8-929-509-44-89 ООО «Троицкий Инженерный Центр» Россия, 142190 г. Москва, г. Троицк, Сиреневый бульвар, д.1. www.trdc.com

More Related