290 likes | 377 Vues
”Teknikken” i testdagsmodellen(1). Jørn Pedersen Dansk Kvæg, Afdeling for Specialviden. Disposition. Testdagsmodellen Systematiske effekter Tilfældige dyreffekter (avlsværdier). ”Teknikken” i testdagsmodellen(2) – Gert Pedersen Aamand Effekt af Multi-trait model.
E N D
”Teknikken”i testdagsmodellen(1) Jørn Pedersen Dansk Kvæg, Afdeling for Specialviden
Disposition Testdagsmodellen • Systematiske effekter • Tilfældige dyreffekter (avlsværdier) ”Teknikken” i testdagsmodellen(2) – Gert Pedersen Aamand • Effekt af Multi-trait model
Systematiske effekterDen ”ikke-genetiske” del af TD-modellen • Kælvingsalder * tidsperiode • Drægtighedsdage • Goldperiode • Heterosis og genetiske grupper (phantom-parent) • Kontroldato * besætning • Laktationskurve * (måned * tidsperiode * klv.-alder) • Kurve * besætning * tidsperiode • Heterogen varians
Kælvningsalder • Inddelt i måneder • For 1., 2. og 3. laktation • Øvre og nedre grænser • F.eks. SDM 1. laktation: under 18 – over 40 • RDM: Vekselvirkning med raceandele (ABK, HOL) • Ved manglende fødselsdato udgår ALLE data !! • Fordi: Alderskorrektionen giver problemer
Effekt af drægtighedsdage(DCC, days carried calf) • Erstatter: Samtidigt kælvingsinterval/tomdage • 0-120 dage: Ikke drægtig eller under 120 dage • 120-239: 0-dages klasser • 240 og derover (de fleste køer er goldet) • 1.. 2. og 3. laktation
Effekt af golddage(foregående laktation) • Erstatter: Foregående kælvningsinterval • Registreret golddag eller • Beregnet ud fra sidste kontroldag med ydelse og næste kontrol/kælvning/afgang • 7 dages intervaller 0-49 dage
Heterosisog genetiske grupper • SDM: Uændret – effekterne mindre • DRH: Uændret – effekterne uændret • Jersey: Uændret – effekterne uændret • RDM: heterosis og rekombination • Generel krydsningseffekt (heterosis og rekombination) • RDMxABK, RDMxHOL, RDMxNordisk, ABKxHOL, ABKxNordisk: tilfældig (”regresset”)
Kontroldag indgår i modellenBesætnings-kontroldato (HTD = Herd-Test-Dag) Erstatter besætningseffekterne (”managementgrupper”, HYS) Korrigere for: • Besætning, årstid(måned), år • Derudover: Påvirkning, der kun vedrører en enkelt kontroldag, f.eks. foderskift, personaleskift, vejrskift Hvilke effekter indgår: • 1. laktationseffekter for sig • 2. + 3. laktationseffekterne samlet
Laktationskurven • En kurve pr. måned i 4 års-perioder (4 perioder) • 1. laktation: 3 aldersgrupper: 3 * 4 * 12 = 144 kurver • 2. og 3. laktation hver især: 4 * 12 = 48 kurver • I alt 144 + 48 + 48 = 240 laktationskurver med forskellig form • Indenfor periode: Forskellig niveau fra år til år (960 kurver) • 5 parameter kurver (a, b c, d, f) • 3 i andengradsligning (parabel):a + b * dag + c * dag2 Modellere det lange ”næste lige” stykke af kurven • 2 eksponentielle led:+ d * ek1 * dag + f * ek2 * dag Modellerer den første del af kurven
Laktationskurve pr. besætning • Laktationskurverne bliver modificeret pr. besætning pr. 5-årsperiode • Lineær regression • Virkning: Kan gøre laktationskurverne mere eller mindre flade
Heterogen varians Fremgangsmåde (iteration) • Beregning af avlsværdital • Korrektion for heterogen varians (pr. bes. x år) • Beregning af avlsværdital • Ny korrektion for heterogen varians • Osv. Heterogen varians pga. avlsværdier bliver ikke fjernet
Heterogen varians • Ændret varians over tid – langt det vigtigste • Forskelle i varians mellem besætninger
AvlsværditalUdvikler sig hen over laktationen ”Avlsværditalskurve” 4 parameter kurver (a, b c, d) Formel: a + b * dag + c * dag2 + d * ek1 * dag • 3 første Led = andengradsligning (parabel): • Modellere det lange sidste stykke af kurven • 4. eksponentielle led: • Modellere den første del af kurven • Ligner formel for fænotypisk laktationskurve • Det giver det bedste resultat • MEN det er IKKE en laktationskurve
Beregningsteknik Lignede metode for permanent miljø pr. laktation 4 avlsværdier pr. dyr, pr. egenskab(3), pr. laktation(3) – I alt 4*3*3 = 36 avlsværdier pr. dyr • Der er mange • Det er teknisk vanskeligt – pga. høje korrelationer Kan reduceres uden nævneværdigt tab af information • 6 avlsværdier for 1. laktation • 8 avlsværdier for 2. og 3. laktation
Trin i en avlsværdiberegning (1) • Dansk dataudtræk og editering • Data samles fra 3 lande – lidt kontrol • Opsætning af input-data til beregning incl. afstamning • Beregning af 14 avlsværdital pr. dyr Uden udenlandsk information – med HV-korrektion • Beregning af 14 avlsværdital pr. dyr Med udenlandsk information – data prækorrigeret for HV
Trin i en avlsværdivurdering (2) • Konvertering fra 14 avlsværdital til 36 avlsværdital pr dyr • 36 avlsværdital er ”regressionskoefficienter” Skal indsættes i formlen for ”avlsværditalskurve” Giver avlsværditallenes udvikling (positivt eller negativt) Ét avlsværdital pr. dag • Beregning af sum af ydelser i 305 dage • Standardisering – af gennemsnit og variation • Sammenvejning: Laktationer – egenskaber (Y-indeks)
Hvad er anderledes i en testdagsmodel? Systematiske effekter • Kælvingsalder * tidsperiode • Drægtighedsdage • Goldperiode • Heterosis og genetiske grupper (phantom-parent) • Kontroldato * besætning • Laktationskurve * (måned * tidsperiode * klv.-alder) • Kurve * besætning * tidsperiode • Heterogen varians
Hvad er anderledes i entestdagsmodel? • ”Avlsværditalskurve” • Avlsværdital for 1., 2. og 3. laktation separat Incl. afstamning/forventning Nye muligheder • Avlsværdital for persistens • Avlsværdital for ”maturity” – forhold mellem avlsværdi fra forskellige laktationer • Andre muligheder !!