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中外文医学文摘数据库检索方法与技巧

中外文医学文摘数据库检索方法与技巧. 北京大学口腔医院图书馆 李晓霞 Email: lxx_xc@163.com. 主要内容. PubMed 数据库检索技巧. CBM《 中国生物医学文献数据库 》. GOOGLE SCHOLAR 检索技巧. PubMed 数据库. PubMed 主要内容. PubMed 概况 PubMed 数据类型 PubMed 检索方法 My NBCI 个性化服务. PubMed 概况. 创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心 (NCBI) 1997 年 6 月开始向全球开放

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中外文医学文摘数据库检索方法与技巧

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Presentation Transcript


  1. 中外文医学文摘数据库检索方法与技巧 北京大学口腔医院图书馆 李晓霞 Email: lxx_xc@163.com

  2. 主要内容 PubMed数据库检索技巧 CBM《中国生物医学文献数据库》 GOOGLE SCHOLAR 检索技巧

  3. PubMed数据库

  4. PubMed主要内容 • PubMed概况 • PubMed数据类型 • PubMed检索方法 • My NBCI个性化服务

  5. PubMed概况 • 创建机构:美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI) • 1997年6月开始向全球开放 • 特色:具有收录范围广(约占世界医学文献期刊的80%以上)、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点, • 每篇文献都有全文通道链接(linkout),便于检索者方便地找到所需的原文。

  6. PubMed概况 • 收录文献的时间范围: 1950- 每日更新(周二-周六) • 检索全世界生物医学期刊论文的重要工具 • 网址:www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 或www.pubmed.gov

  7. PubMed - as supplied by publisher PubMed 属于Medline收录范围,建立ti、au、ab等基本书目信息。 (暂)不属于Medline收录范围,但也建立ti、au、ab等基本书目信息。 PubMed - in process 赋予MeSH、PT等字段并被index。 PubMed - indexed for MEDLINE  PubMed数据类型(状态) PubMed除了1966年以前的OldMedline,其余文献按处理过程分4种类型(或状态)

  8. PubMed检索方法

  9. 1. 检索机制 PubMed检索方法——怎么用? 如果输入的检索词在以上词表中未找到,且该词后有一或二个字母,PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词,PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词,PubMed将该词组的每个单词用`AND’组配并在所有字段中查找。 包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如,如果你输入“New England Journal of Medicine”,PubMed将按“N Engl J Med[ta]”查询。 如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词,PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表, MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词,则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如,如果我们输入Vitamin h,PubMed会这样检索:(“Biotin[MeSH]OR vitamin h[tw])——vitamin h是MeSH词Biotin的款目词。 • 自动转换匹配功能(Automatic Term Mapping) 对于输入的检索词,PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换,再进行检索。词表匹配转换顺序是: MeSH表 期刊刊名注释表 短语表 作者索引 • 短语检索(Phrase Searching) • 要将短语作为一个词组进行检索,可用双引号“ ”将其引起来。 • 如:“drug therapy”作为词组进行检索的词,系统不进行自动转换匹配,也不进行MeSH词的扩检。

  10. PubMed检索方法——怎么用? A B A B A B 2. 布尔逻辑运算符 布尔逻辑组合 检索,常用的 逻辑关系词有 AND,OR, NOT等 逻辑与(AND) --检出记录中同时含有检索词A和检索词B. 如:A AND B (AIDS and therapy) 逻辑或(OR) --检出记录中含有检索词A或检索词B或同时含有检索词A和B的文献。 如:A OR B ( AIDS or Acquired Immunodeficiency Syndrome) 逻辑非(NOT) --在含检索词A的记录中,去掉含检索词B的记录。 如:A NOT B(Hepatitis not Animal)

  11. 基本检索 高级检索 主题检索

  12. 一.基本检索 PubMed检索方法——怎么用? 默认检索字段为主题、作者、期刊

  13. 一.基本检索 PubMed检索方法——怎么用? • 关键词、词(词组)或短语: ⑴ 输入任意关键词:liver cancer、Lung cancer; ⑵ 带有双引号“ ”作为短语检索:“cancer therapy”; ⑶ 带有连接号“-”作为一个词组检索:interleukin-6。 • 限制检索字段:如liver cancer[ti] • 作者:Smith J 、 仅知道作者姓,则必须加上字段标识,如: Smith[au] 2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索 如:Joshua Lederberg

  14. PubMed检索方法——怎么用? 一.基本检索 作者姓名检索 按照姓+名缩写(不用标点)的格式键入作者姓名,如:smith ja或jones k, 系统会自动在作者字段内进行检索。姓名第一个字母可用大写也可用小写,姓前名后,姓用全称,名字一般用缩写。 考虑到作者姓名的不同形式,PubMed采用自动转换功能进行作者姓名检索,如:smith j将检索成smith ja, smith jc,smith jr 等。 精确检索:可以用双引号将作者名引起来,再加作者字段限定[AU],如:"smith j"[au],这样可避免PubMed自动转换,实现精确查找。

  15. PubMed检索方法——怎么用? 作者姓名检索 按照姓(全写) +名(缩写), 之间不用标点 键入作者姓名 smith j

  16. 精确检索避免 PubMed自动 词汇转换,实 现精确查找 "smith j"[au]

  17. 一.基本检索 PubMed检索方法——怎么用? • 期刊刊名: ⑴可用期刊全称:GENE THERAPY[TA]; ⑵可用期刊简称:JAMA[TA];(The Journal of the American Medical Association)

  18. PubMed检索方法——怎么用? 一.基本检索 期刊检索 在检索框中键入期刊名,如:molecular biology of the cell,系统的“自动词语匹配”功能会将它转换成mol biol cell[journal]进行检索。 也可以直接输入Medline的期刊标准缩写形式,如:mol biol cell,或者是输入刊物的ISSN(国际标准出版物代码)进行检索,如:1059-1524。 如果一个杂志名恰好是主题词或关键词,如:cancer, science,cell等,PubMed会首先将这些词转换成MeSH词表中的主题词进行检索。因此,需要将检索请求进行标准化处理,即在杂志名后面加[TA]。如:"cell"[ta]

  19. 期刊的一般检 索,是在检索 输入框中键入 期刊名或期刊 的ISSN号 Eur J Immunol

  20. 期刊的标准检 索,是在期刊 名后面加字段 限定[TA]. 比 如:"cell"[ta] "cell"[ta]

  21. 一.基本检索 PubMed检索方法——怎么用? • 复杂表达式:liver cancer AND therapy • 带有摘要文献的检索 :liver cancer AND has abstract

  22. PubMed检索方法——怎么用? 一.基本检索 截词检索 截词检索的作用:扩大检索范围,提高查全率。 截词符:用*表示,代表多个字符,将*加在检索词后可以表示对所有以该词开头的词进行检索。 如:bacter*,可以检出bacter,bacteria, bacteriophage ,bacterium,等最多600个单词。

  23. 截词检索可以 扩大检索范围 提高查全率。 bacter*[TI]

  24. PubMed检索方法——怎么用? 1.基本检索 字段限制检索 采用字段限制方式进行检索,其规则是: 检索词1[字段标识] 逻辑运算符 检索词2[字段标识] 如:查找作者为crick在1993年发表的有关DNA方面的文献. 检索式: DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]

  25. 常用字段组成 标识符 字段名称 TI Title AU Author AD Affiliation AB Abstract DP Publication Date SO Source TA Journal Title Abbreviation MH MeSH Terms PT Publication Type

  26. 字段限制检索 其规则是:检 索词+[字段 标识] DNA[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]

  27. 高级检索

  28. 高级检索

  29. 检索区 输入区 检索史

  30. 高级检索举例: 查阅北京大学俞光岩的文章. 分析该课题,可知: • 作者为:俞光岩(yu gy) • 作者单位为: 北京大学(peking university)

  31. MeSH主题词检索

  32. MeSH主题词检索 主题词也称为叙词,是描述文献重点讨论的内容,是对自然语言进行规范化处理后的结果,主要用于文献的标引和检索。 副主题词是用于对主题词进一步限定的词,又称限定词。 注意:主题词检索只适用于有主题标引的MEDLINE数据!

  33. 进入主题词检索界面,两个途径。

  34. 糖尿病(Diabetes )治疗(therapy)方面的文献。

  35. 主题词检索开始 第一步:输入检索词:diabetes

  36. 第二步:确定规范的主题词

  37. 第三步:确定副主题词

  38. 第三步:找到相应副主题词

  39. 第四步:检索

  40. 检索结束

  41. 选择检索条件 加权与不加权

  42. 主题词“加权”表示主题词的重要程度,反映文章论述的核心内容。加权主题词在数据库用“ * ”表示,如“ * 肝肿瘤”。 加权检索表示仅对加星号(*)主题词 (主要概念主题词) 检索; 不加权检索表示对加星号主题词和非加星号主题词(非主要概念主题词)均进行检索。 “加权检索”可提高检索结果的相关性。

  43. 如果想更准确,可进行加权检索

  44. 不加权检索 加权检索

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