Les i -carraghénases : Un modèle de dégradation en phase hétérogène

1. Les i-carraghénases : Un modèle de dégradation en phase hétérogène Etienne Rebuffet Février 2008

2. Les galactanes d’algues rouges Agarose κ-carraghénane de la charge négative ι-carraghénane λ-carraghénane

3. Applications des carraghénanes Cosmétique Agriculture Dentifrice Stimulent les défenses des plantes Médecine Anti-coagulant Anti-viral Agroalimentaire Gélifiant Emulsifiant

4. La dégradation en phase hétérogène Collaboration entre différentes enzymes pour la dégradation d’un substrat récalcitrant ENDO PROCESSIVE EXO

5. Domaine A Domaine B Hélice β La ι-carraghénase d’A. fortis Topologie du site actif de type tunnel => Dégradation processive Michel, G. et coll. The structural bases of the processive degradation of iota-carrageenan, a main cell wall polysaccharide of red algae. Journal of molecular biology334, 421-33 (2003).

6. Résultats et perspectives Boucle formée par les résidus 343 à 349. Mutants catalytiques obtenus (E245, D247, E310) ■ Biochimie ■ Cocristallisation

7. Zobellia galactanivorans Isolé à Roscoff depuis une algue rouge : Delesseria sanguinea Décrite par T. Barbeyron Delesseria sanguinea

8. Les ι-carraghénases de Z. galactanivorans Domaine B Hélice β Domaine A CgiA_Af CgiA_Zg CgiB_Zg CgiC_Zg

9. Les ι-carraghénases de Z. galactanivorans CgiA_Zg CgiB_Zg CgiC_Zg Synergie entre les trois enzymes ?

10. Stratégie ■ Surexpression et purification des ι-carraghénases de Z. galactanivorans ■ Identification des produits de dégradation de ces iotases ■ Détermination des paramètres cinétiques (kcat, Vm) ■ Structures cristallographiques

11. Remerciements Equipe de glycobiologie marine CZJZEK Mirjam MICHEL Gurvan BARBEYRON Tristan JAM Murielle Région Bretagne CNRS Financement ARED du projet Iotase3D