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Algorithm Engineering „Suffix-Bäume und Suffix-Arrays“

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Algorithm Engineering „Suffix-Bäume und Suffix-Arrays“. Stefan Edelkamp. Übersicht. Suffix-Mehrwegsuchbaum (- Trie ) Patricia-Bäume Suffix-Bäume Konstruktion von Suffix-Bäumen nach McCreight Generalisierte Suffix-Bäume Suffix-Arrays. Suffix- Tries. Definierende Eigenschaft.

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Presentation Transcript

  1. Algorithm Engineering„Suffix-Bäume und Suffix-Arrays“ Stefan Edelkamp

  2. Übersicht • Suffix-Mehrwegsuchbaum (-Trie) • Patricia-Bäume • Suffix-Bäume • Konstruktion von Suffix-Bäumen nach McCreight • Generalisierte Suffix-Bäume • Suffix-Arrays

  3. Suffix-Tries

  4. Definierende Eigenschaft

  5. Suffix-Bäume (akaSuffixbäume)

  6. Suffixbaum für den String 11010$

  7. Definitionen

  8. Notation

  9. Definierende Eigenschaft

  10. Beweis

  11. Konstruktion von Suffix-Bäumen

  12. Naives Verfahren

  13. Beweis

  14. Visualisierung

  15. Algorithmus von McCreight Algorithmus

  16. Zentrale Eigenschaft

  17. Invarianten des Algorithmus

  18. Bezeichnungen

  19. Schritt 1: Einfügen des Ortes von headi+1

  20. Schritt 2: Einfügen des Suffix-Zeigers für den Ort von headi+1

  21. Korrektheit

  22. Zu zeigen:

  23. Beispiel

  24. Analyse: Algorithmus von McCreight tobecontinued …

  25. Analyse Rescannen

  26. Analyse Scannen

  27. Beispiel

  28. Beispiel (ctd.)

  29. PseudoCode

  30. Verwendung von Suffix-Bäumen

  31. Generalisierte Suffix-Bäume

  32. Beispiel

  33. Beobachtungen

  34. Beispiel

  35. Löschen von Strings

  36. Erkenntnisse

  37. Korrektheit

  38. Invarianz

  39. Pseudo-Code

  40. Pseudo-Code

  41. Suffix-Arrays

  42. Eigenschaft

  43. Beispiel

  44. Engineering

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