De Bio- (&Geo-) Diversiteit van het CWI

1. Arjen Doelman MAS, CWI & UvA De Bio- (&Geo-) Diversiteit van het CWI

2. OPZET: • Centraal staan een twaalftal voorbeelden van bestaande aan de aard- en levenswetenschappen gerelateerde onderzoeksprojecten op het CWI. •  Een `one man poster session’ • Andersoortige activiteiten: • Aard Leven • Plannen en `synergie’ • Opmerking: • Naamgeving `posters’ gebaseerd op groepsleiders – een versimpeling, zij representeren tevens aio’s en andere co-auteurs. • Het genoemde CWI-onderzoek is bijna zonder uitzondering uitgevoerd in samenwerking met aard- en/of levenswetenschappers.

3. Harry Buhrman/Peter Grunwald/Paul Vitanyi (INS4): Clustering & Similarity Analysis SARS is een Corona virus Andere toepassingen: evolutiaire bomen, tekstanalyse Een SARS virus

4. Leen Stougie (PNA1): Combinatorische optimalisatie  computationele biologie  `phylogenetic networks’  evolutionaire netwerk voor gistsoorten evolutionaire boom

5. . . . Eric Pauwels (PNA4): Extractie en matching van patronen `ambient intelligence’/ visuele plaatsbepalingen & walvissen, dolfijnen, zeeschilpadden, bomen, ... Foto Dezelfde walvis in de data base

6. Robert van Liere (INS3): Visualisatie & 3D oppervlakken  Kwantitatief meten aan biologische objecten foto Informatie over de groei/geschiedenis van het koraal skelet

7. Jason Frank (MAS1): Statistisch accurate (klimaat)simulaties Simulatie KNMI (140 jaar)

8. Daan Crommelin (MAS1): Deduceren van modellen uit data Andere toepassingen: klimaatsdynamica, moleculaire dynamica, ... Andere toepassingen: klimaatsdynamica, moleculaire dynamica, ... Temperatuur oceaan oktober 2005 Voorspellingen

9. Jan van Schuppen (MAS2): `System reduction’ , metabolische/proteine/genetische networks gist input ) output glycolyse netwerk

10. Antonios Zagaris (MAS1): Dynamische model reductie Laag dimensionaal gedrag in grote systemen  biochemische netwerken Een sterk vereenvoudigde verbrandingsreactie

11. Ute Ebert (MAS3): Multiscale analyse  Gasontladingen  Toepassingen in de techniek Sprites (50km) Laboratorium (4cm)

12. Joke Blom (MAS1): modelleren & simuleren biochemische processen  `Hybride’ systemen: Tussen continu (concentraties) en volledig discreet (moleculaire dynamica) Schalen: continu  discreet cel

13. Ben Sommeijer (MAS1): Phytoplankton dynamica  Simulaties, hydrodynamica en ecologie Modelleren planktonconcentraties in het Nieuwe Meer (Amsterdam ZO) Blauwalgen in het Ijsselmeer

14. Arjen Doelman (MAS1): `Pattern Formation’ Verwoestijning Vegetatiepatronen als indicatie voor verwoestijning Niger, Afrika; schaal: tientallen meters

15. ANDERSOORTIGE ACTIVITEITEN: • Het NISB = Netherlands Institute for Systems Biology • Samenwerking tussen: • & •  17 december `kennismakingsdag’ op de werkvloer. • Er loopt een wervingsactie voor twee bio-informatici en/of bio-mathematici op tenure track niveau. • De `bio-bonus’.

16. AARD  LEVEN • Wiskunde heeft langere traditie/is meer geïntegreerd in AARDwetenschappen • AARDwetenschappen `continue’ wiskunde  MAS • LEVENswetenschappen zijn nog op zoek naar `fundamentele wetten’ • Wiskunde/Informatica? LEVENswetenschappen INS, MAS, PNA • LEVENswetenschappen:Triviale W & I? Of juist veel te moeilijk??

17. PLANNEN & SYNERGIE • Gecombineerde aanstellingen, detacheringen, gasten, ... • Frank Bruggeman (CWI & VU: NISB) – MAS3 • Huib de Swart (IMAU, Institute for Marine and Atmospheric research Utrecht:NDNS) – MAS1 • ... • DIVERSITEIT & SYNERGIE: • Duidelijk aanwezig binnen de Aardwetenschappen (MAS) • Binnen de Levenswetenschappen? • AARD & LEVEN(phytoplankton, verwoestijning, ...) • Een gecombineerde krachtsinspanning? • Klimaat? `Genetics’? Kankeronderzoek? Medisch-technisch? ...