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Les logiciels libres de bibliographie

Les logiciels libres de bibliographie. Les logiciels libres de gestion bibliographique http://www.projet-plume.org/fr/ressource/zoom-sur-la-gestion-de-references-bibliographiques-dans-plume Site de la journée du 20 mars 2009 « Gérez vos références bibliographiques avec des logiciels libres »

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Les logiciels libres de bibliographie

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Presentation Transcript


  1. Les logiciels libres de bibliographie • Les logiciels libres de gestion bibliographique http://www.projet-plume.org/fr/ressource/zoom-sur-la-gestion-de-references-bibliographiques-dans-plume Site de la journée du 20 mars 2009 « Gérez vos références bibliographiques avec des logiciels libres » http://www.projet-plume.org/fr/ressource/journee-plume-biblio-2009 • Logiciel de gestion bibliographique (liste de logiciels libres) http://fr.wikipedia.org/wiki/Logiciel_de_gestion_bibliographique (Bibus, Zotero, CiteULike, Connotea, Mendeley, Wikindx…) et Wizfolio (www.wizfolio.com) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  2. Zotero version 2.0.9 • Support adapté à la version 2 de Zoteroqui apporte beaucoup de nouveautés : • Synchronisation • Groupes • Notes formatées • Détection automatique des métadonnées PDF etc. C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  3. ZoteroPrésentation générale • Créé fin 2006 • Projet du Center for history and New Media (University georges Mason, Virginia USA) http://chnm.gmu.edu/ • Fonds de plusieurs institutions et fondations Unitive States Institute of Museum and Library Services (IMLS) http://www.imls.gov/ Andrew W. Mellon Foundation http://www.mellon.org • Ethymologie : vient du verbe albanais zöteroj =« master, acquire » « apprendre » C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  4. ZoteroLogiciel libre de bibliographie • Extension du navigateur Firefox 3.6 (dernières fonctionnalités) • Extension de firefox, mais données stockées indépendamment • Multi-plateformes (Linux, Mac, Windows) • Captures de pages web • Orientation hypermédia (vidéos, images, pages html, billets de blogs) • Possibilité d’annoter les références • Multilingue dès le départ (dont le français) • Utilisation individuelle et/ou collective • Avec la v2, synchronisation, collaboration, partage de données etc. • Fort dynamisme de développement C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  5. ZoteroLogiciel libre de bibliographie • à télécharger à partir du site de Zotero http://www.zotero.org • Guide de démarrage rapide en français • Support (aide, documentation : nombreuses rubriques en français) • Forums (par thèmes) • Blog • Groups • People (communauté Zotero) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  6. Zotero Installation • Installer la dernière version de firefox • Aller sur le site de Zotero http://www.zotero.org • Télécharger la version 2.0.9 (au 25/11/10) • Si firefox bloque l’installation, cliquer sur Autoriser • Redémarrer Firefox • Une fois le logiciel téléchargé, l’icône Zotero apparaît en bas à droite de l’écran du navigateur internet Firefox • Emplacement de Zotero: C:\Documents and Settings\Nom\Application Data\Mozilla\Firefox\Profiles Toutes les données sont stockées dans un répertoire en local (on peut changer cet emplacement, voir Préférences) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  7. Clic sur le logo Zotero Fenêtre partagée avec Firefox C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  8. Terminologie de Zotero • Ma bibliothèque : ensemble des références de toutes les collections ou isolées • Collections : dossiers thématiques contenant les références • Marqueurs : mots-clés • Créateur : auteur (sauf pour la saisie = auteur) • Très important : la logique Bibliothèque/Collections (très différent de Endnote) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  9. Interface Zotero zones 1, 2 et 31) La bibliothèque et ses collections2) Les notices d’une collection sélectionnée3) La fiche de la notice sélectionnée 1 3 2 1 2 3 C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  10. Interface : colonne de gauchevoir aussi « Organiser sa bibliothèque et ses collections »(Diapo 37) • Contient par défaut « Ma bibliothèque » (toutes les réfs des collections + les réfs qui ne sont pas classées dans une collection particulière) • Collections : dossiers créés par l'utilisateur; on peut créer des sous-collections • Pour savoir combien de réfs dans une collection : se positionner dans la colonne du milieu, faire ctrl-a, le nombre de réfs s'affiche dans la colonne de droite C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  11. Interface : colonne du milieu • Affiche les références contenues dans la collection en cours d’utilisation • Pour afficher + de champs : cliquer sur icône « grille » (à droite du +) • Pour changer ordre d'affichage des champs : cliquer/glisser l'intitulé du champ • Tri alphabétique en cliquant sur chaque intitulé de champ • Le « + » à droite du nom des champs = tri multiple C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  12. Interface : colonne de droite • Onglet Info : détail de la notice sélectionnée dans la colonne du milieu • Onglet Notes : note de lecture, annotation éventuelles (sera ajoutée comme élément fils de la notice ; ex. ajouter « très intéressant » comme note à un article) (voir détails plus loin) • Onglet Marqueurs : voir plus loin • Onglet Connexe : pour lier des réfs entre elles (ex un article et sa traduction) : clic et choisir la réf (un signe s'ajoute à côté de la réf) • Le Bouton Afficher, dans l’onglet infoest actif quand la réf. est un site web.Un clic sur ce bouton fait apparaître la page du site dans le navigateur. • Le Bouton Localiser, dans l’onglet Info : cela lance le résolveur de lien OpenURL, paramétré par défaut vers WorldCat, pour localiser le document (on peut modifier ce paramétrage vers un autre catalogue par le menu actions-> préférences, par exemple vers le SFX de l’INRA) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  13. Divers statuts de notices article Site web Thèse/Mémoire livre C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  14. Le menu et les icônes de Zotero(détail de chaque fonction diapos suivantes) Ajouter nouvel élément Recherche avancée Nouvelle note Nouveau groupe Recherche simple Créer un nvel élt à partir de la page courante Fermer Zotero Synchronisation avec serveur Zotero Créer nouvelle collection Roue dentelée Actions (détails plus loin) Joindre/attacher (voir plus loin) Bascule Mode plein écran Ajouter un élément par son identifiant C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  15. Le menu et les icônes de Zotero :Bouton actions (roue dentelée) Voir plus loin Import/export C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  16. Créer une chronologieBouton actions (suite) • = outil d’exploration des données • Une chronologie peut être basée sur la bibliothèque, ou sur une collection ou sur une sélection manuelle de références • Sélectionner puis cliquer sur le bouton actions et sur créer une chronologie • Zotero affiche 3 bandes (par mois, par année, par décennie) basées sur la date de publication des références • Le critère date est changeable en date d’ajout de la notice ou date de modification de la notice (cela permet un suivi détaillé de l’évolution de sa bibliographie) • Pour se déplacer horizontalement, cliquer à un endroit dans une des 3 bandes,rester appuyé et bouger la souris C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  17. Exemple de chronologie C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  18. Préférences de ZoteroBouton actions (suite) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  19. Préférences : synchronisationSettings : se créer un compte (diapo 75) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  20. Préférences : synchronisationReset : avec le serveur Zotero (diapo 76) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  21. Préférences : Recherchetélécharger pdftotext et pdfinfo pour l’indexation des pdf C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  22. Préférences : exportationChoix du style par défaut C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  23. Préférences de Zotero : stylesOptions de citation à cocher et ajout de styles Lien vers liste de styles sur site Zotero Cliquer sur install C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  24. Préférences : avancées Pour changer la localisation des données Par défaut = worldcat Résolveur SFX de l’INRA C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  25. Ajouter nouvel élément Option stocker conseillée Choisir type de document pour saisie manuelle ajou C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  26. Création d’une noticeClic sur le bouton vert (nouvel élément) Choix du type de document : remplir les champs dans la colonne de droite C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  27. Ajout manuel de marqueurs (mots-clés) géographie C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  28. Créer un nouvel élément à partir de la page courante Photo de l’écran Pas un lien C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  29. Annoter et surligner une capture de page web Adresse de stockage sur Zotero Icônes d’annotation C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  30. Annoter et surligner une capture de page web Ajouter un post-it à n’importe quel endroit Réduire toutes les annotations Supprimer le surlignage Surligner le texte C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  31. Capture de page couranteExemple des pdf et récupération des métadonnées • Ouvrir le pdfen pleine page • Avoir installé pdf tools dans les préférences recherche (voir diapo 21) • Cliquer sur icône créer un nouvel élément à partir de la page courante • On a bien une nouvelle notice avec icône pdf • Clic droit et clic sur récupérer les métadonnées du pdf : la notice s’affiche dans la colonne de droite C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  32. Récupération des métadonnées du pdf(partiellement selon les sources) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  33. Ajouter un élément par son identifiant : DOI, ISBN ou PMID Saisir le DOI ou l’ISBN La référence est chargée Automatiquement dans la collection Saisir le DOI ou l’ISBN Le document est chargé automatiquement dans la collection C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  34. Ajouter une nouvelle note Ajout d’une note indépendante S’affiche comme une référence On peut ensuite Relier cette note à une référence par glisser/déposer On peut copier/coller du texte dans les notes Ajout d’une note liée à une référence C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  35. Fichiers attachés à une référencefichiers attachés éventuels (on a le choix entre « lien vers un fichier » et « stocker une copie du fichier », 2e choix recommandé) Lien vers le fichier attaché sur son ordi = photo de l’écran pas un lien Le fichier attaché va être stocké dans les données de Zotero (conseillé) = lien vers l’adresse de la page web C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  36. Attacher un pdf à une notice déjà existante • Ouvrir le pdf en pleine page • Se positionner sur la bonne notice • Cliquer sur l’icône trombone et sur joindre une capture de la page courante • Apparemment pas possible d’attacher fichier à une note indépendante (menu du trombone pas actif) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  37. Organiser sa bibliothèque C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  38. Organiser sa bibliothèque (suite)Ma bibliothèque clic sur l’icône pour créer une nouvelle collection Clic droit dans une collection pour créer une sous-collection (la nommer)Choisir sa collection pour créer des notices ou en importerNombre de références dans sa collection : « ctrl a » affichage en colonne 3 Clic droit dans une collection : renommer ou supprimer une collection mais les références de la collection supprimée resteront dans Ma bibliothèque Si on supprime des références dans Ma bibliothèque, elles seront supprimées aussi dans la collection On peut faire glisser-déposer des notices dans une autre collection, mais elle restent dans le fichier d’origine C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  39. Actions sur les références (clic droit) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  40. Générer un rapport à partir d’un élément sélectionnéClic droit sur la référence : Générer un rapport à partir de l’élément sélectionné Tous les champs non vides de la colonne 3 figurent dans ce rapport qu’on peut enregistrer dans un fichier en tant que page html C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  41. Fonctions de recherche • Simple • Avancée • Par les marqueurs C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  42. Recherche simple (dans une collection) C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  43. Recherche simple • Case « recherche » de la barre d’outils de Zotero : recherche dans My library ou dans une collection sélectionnée • Recherche dans toutes les références + fichiers attachés + notes et dans tous les champs y compris les marqueurs (+ dans les pdf si sont indexés) • troncature * et opérateurs AND/ET implicites • minuscules / majuscules sans importance C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  44. Recherche avancée Recherche multi-critères Remplace et/ou C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  45. Recherche avancée • clic sur l'icône loupe • Possibilité de rechercher dans les sous-collections ou non • Possibilité d'enregistrer la recherche et de générer une bibliographie ou un rapport à partir du résultat de cette recherche • Recherche enregistrée : une nouvelle collection est créée qui comprend toutes les réfs correspondant au résultat de la recherche ; cette collection s' actualise au fur et à mesure (si une réf est ajoutée à ma bibliothèque et qu'elle correspond à la recherche, elle y est ajoutée) • Recherche dans tous les champs, recherches croisées + options de recherche • ATTENTION : pas de ET ou de OU mais 1er menu déroulant est équivalent : « Correspond à toutes les conditions suivantes » ou « au moins à une » C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  46. Recherche par les marqueurs Sélectionner un ou plusieurs marqueurs en cliquant dessus pour filtrer votre bibliothèque (ou votre collection) Marqueur sélectionné C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  47. Recherche par les marqueurs Collection sélectionnée : tous les marqueurs sont affichés Seul le marqueur non grisé est actif et correspond à une référenceOn peut faire glisser une référence sur un marqueur pour que ce dernier soit ajouté à la référence C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  48. Récupération de références à partir de Endnote • Ouvrir fichier Endnote • edit -> select all -> output styles -> Endnote export File -> export -> fichier.txt • se remettre dans Zoteroicône actions (roue dentelée) -> import -> fichier .txt • Importe les références à la fois dans « ma bibliothèque » et dans une nouvelle collection appelée « import jour date année » : il faut ensuite faire glisser les réfs au bon endroit. • L'import des pdf ne marche pas ! • Pb de champs Zotero/Endnote : Zotero n’a pas tous les champs de Endnote et on ne peux pas en ajouter dans Zotero C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  49. Import d’une autre collection de Zotero • Roue dentelée : import • Format d’import .rdf C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

  50. Récupération des références depuis des base de données(liste des sites des bases de données compatibles avec Zotero : onglet support) Sites complètement compatibles C. Silvy (INRA, Montpellier) C. Roure (SupAgro Montpellier) Zotero V2 mise à jour 25/10/2010

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