1 / 52

AMİNO ASİTLERİN ÖZELLİKLERİ

AMİNO ASİTLERİN ÖZELLİKLERİ. Prof. Dr. Esma GÜR. H. COOH. H. +. R – C – NH2 R – C – NH3. pH= 7. -. COO. ZWİTTERİYON. İNSAN VÜCUDUNDA -amino asitler hakim. CO. N. R. CORN prensibi ile L- amino asit (L-Ala). Alifatik amino asitler. Aromatik amino asitler.

chavi
Télécharger la présentation

AMİNO ASİTLERİN ÖZELLİKLERİ

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. AMİNO ASİTLERİN ÖZELLİKLERİ Prof. Dr. Esma GÜR

  2. H COOH H + R – C – NH2 R – C – NH3 pH= 7 - COO ZWİTTERİYON İNSAN VÜCUDUNDA -amino asitler hakim

  3. CO N R CORN prensibi ile L- amino asit (L-Ala)

  4. Alifatik amino asitler

  5. Aromatik amino asitler

  6. Bazik amino asitler

  7. Asidik amino asitler

  8. Nötral-polar amino asitler

  9. Yapısal önemi olan amino asitler

  10. - + • [H ] [A ] Ka = [HA] - - [A ] [A ] -log Ka = -log [H ] - log + [HA] [HA] pH = pKa + log Denge Sabiti(Ka) Dissosiasyon Kat Sayısı -logKa = pKa

  11. pKa1 + pKa2 pI = 2 pI = İzoelektrik Nokta Amino asitin 2’den fazla dissosiye olan grubu var ise pI = nötral formun iki tarafındaki pKa’ ların ortalamasıdır.

  12. pI = (2.35 + 9.69) / 2 = 6.02

  13. 2.09 3.86 9.8 pI = (2.09 + 3.86) / 2 = 2.98

  14. Glutamik Asit

  15. pKa1=3.2 pKa2=4.25 pKa3=9.67 pI = (3.2 + 4.25) / 2 = 3.7

  16. pI = (9.2+ 10.8) = 10.0 2.16 9.2 10.8

  17. Amino AcidpKa for a-COOHpKafor a-NH3+ pKa for R group Glycine2.349.6 Alanine2.349.69 Leucine2.369.6 Serine2.219.15 Threonine2.6310.43 Glutamine2.179.13 Aspartic acid2.099.823.86 Glutamic acid2.199.674.25 Histidine1.829.176.0 Cysteine1.7110.788.33 Tyrosine2.209.1110.07 Lysine2.188.9510.53 Arginine2.179.0412.48

  18. 2 Doğru cevap seçin: • PK değerinin altındaki pH’ da iyonize olabilen gruplar protonlanır. • Eğer bir molekül düşük pK değerine sahipse, bu molekülün protonlara ilgisi yüksektir. • Asetik asitin pK’sı =4.7 dir. pH 7.4 de sadece asetik asit bulunur. • Amino asitler gibi moleküllerin sadece 1 pK değeri olur. • pK, amino asitlerin birbirine bağlanma şeklini tahmine yarar. • Eğer ortamın pH’sı X molekülünün pK sından yüksek ise, X molekülünün proton kaybetmiş formu hakim olur.

  19. Proteinlerde Primer Yapının Saptanması • Örnek hidrolizi (6 M HCl 110°C 24 sa.) • Sekans (dize) Analizi : protein polipeptidlera.a. analizi veya Edman reaksiyonu Br-CN ile parçalanma

  20. Edman reaksiyonu ile a.a. dizesi saptanması Fenil izotiyosiyanür

  21. Amino asid dizesi saptanırken; • Protein zinciri denatüre edilerek çözülür • S-S bağları açılır • Daha küçük peptidlere parçalanır (proteazlar ile) • Küçük peptidlerin (oligopeptidler) dizeleri saptanır. • Büyük proteinin a.a. dizesi hesaplanır

  22. (H3N-) Gly-Arg-Phe-Ala-Lys-Trp-Val(-COO) Tripsin (Lys ve Arg C-terminalinden) Gly-Arg + Phe-Ala-Lys + Trp-Val Gly-Arg + Phe-Ala-Lys + Trp-Val (H3N-) Gly-Arg-Phe-Ala-Lys-Trp-Val(-COO) Kimotripsin (Aromatik a.a.lerin C-terminalinden) Gly-Arg-Phe + Ala-Lys-Trp + Val(-COO) Gly-Arg Phe-Ala-Lys Trp-Val Gly-Arg-Phe Ala-Lys-Trp Val

  23. Amino Asitlerin Kullanıldığı Reaksiyonlar • Peptid bağı oluşumu • Transaminasyon • Dekarboksilasyon • Deaminasyon

  24. Peptid bağı oluşumu

  25. Peptid zinciri

  26. Peptid bağını gösterin.

  27. Özel bir bağ: Disülfit bağı (S-S bağı)

  28. Transaminasyon

  29. AST (Aspartat Transaminaz)

  30. Transaminasyon reaksiyonları -amino asit Enzim-Piridoksal -aminoasit -keto asit Enzim-Piridoksamin -keto asit

  31. ALT reaksiyonu Alanin ALT -Piridoksal Glutamat Piruvat ALT-Piridoksamin -keto glutarat

  32. Dekarboksilasyon

More Related