1 / 30

Nukleotida dan asam nukleat

Nukleotida dan asam nukleat. Tri Rini Nuringtyas. Nukleotida. Merupakan prekursor / dasar untuk asam nukleat, RNA dan DNA Struktur terdiri dari Basa Gula phosphat. Nukleotida berbeda dengan nukleosida  karena nukleosida tdk mempunyai gugus fosfat

kellsie
Télécharger la présentation

Nukleotida dan asam nukleat

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Nukleotida dan asam nukleat Tri Rini Nuringtyas

  2. Nukleotida

  3. Merupakan prekursor / dasar untuk asam nukleat, RNA dan DNA • Struktur terdiri dari • Basa • Gula • phosphat

  4. Nukleotida berbeda dengan nukleosida  karena nukleosida tdk mempunyai gugus fosfat • Sehingga kita sering menuliskan nukleotida sebagai  • Nukleosida monofosfat • Nukleosida difosfat • Nukleosida trifosfat Tergantung pada jumlah fosfat yg dimiliki • Deoksiribonukleotida ditulis dng tambahan “d”  menunjukkan adanya gugus hidroksil pd atom C nomer 2

  5. Terdiri dari 2 golongan : • Ribonukleotida • Deoksiribonukleotida • Jenis nukleotida : • Nama tergantung pada basanya • Jumlah fosfat yang dimiliki Adenin AMP, ADP, ATP, dAMP, dADP, dATP Guanin GMP, GDP, GTP, dGMP, dGDP, dGTP Sitosin CMP, CDP, CTP, dCTP, dCDP, dCTP Timin TMP, TDP, TTP, - Urasil UMP, UDP, UTP, dUMP, dUDP, dUTP

  6. Nukleotida mengikat basa nitrogennya pada atom C no. 1, dgn ikatan glikosida • Gugus fosfat terikat pada gugus hidroksil atom C no. 5 • Kedua kondisi diatas, menyebabkan nukleotida mempunyai sifat sifat: • Gugus phosphat  bertindak sbg asam kuat (pKa= 1) • Gugus amina dr basa purin dan pirimidine, dpt di protonasi • Nukleotida mampu menyerap sinar uv  dapat diukur konsentrasinya

  7. Asam nukleat • Merupakan bagian organisme hidup yg sangat penting • Membawa informasi genetika yang akan diturunkan / ditransfer dr generasi ke generasi. Semua informasi yg ada dlm sel  DNA • Ada 2 macam: • Asam deoksiribonukleat : AND / DNA • Asam ribonukleat : ARN / RNA • Asam nukleat mrpk polimer nukleotida yg dihubungkan dgn ikatan fosfodiester

  8. DNA (DeoxyriboNucleic Acid ) Dikenal sebagai materi genetik Merupakan komponen kromosom Merupakan polimer deoksiribonukleotida yg dihubungkan dengan ikatan fosfodiester Backbone (rangka) terdiri dr: gugus fosfat dan gula yg saling berseling Memiliki orientasi 5’  3’ jk gugus fosfat dr C5 berikatan dgn OH C3

  9. Didalam sel  dalam jalin ganda (double helix) • Dimana gugus fosfat berada di luar dan basa nitrogennya di dalam • Jalin ganda yg terbentuk bersifat anti parallel  ?

  10. Susunan basa nitrogen pada jalin ganda DNA  tidak random Guanin (G) – Sitosin (C) Adenin (A) - Timin (T) Antara basa nitrogen satu dengan yang lain dihubungkan dengan ikatan hidrogen • Watson and Crick : replikasi  sangat mungkin untuk suatu DNA diperbanyak dg informasi yg sama

  11. DNA di dalam sel ditemukan  3 bntk utama • Bentuk B • Bentuk A • Bentuk Z Perbedaanya ?

  12. A C G T C 3’ 3’ 3’ 3’ P P P P P 5’ 5’ 5’ 5’ • seperti halnya protein, asam nukleat juga mempunyai struktur primer, sekunder dan tersier • asam nukleat mempunyai arah sense • Mempunyai individualitas  ditentukan dari urutan basa nitrogennya  disebut sebagai struktur primer • Informasi genetik ada pada struktur primer ACGTC 3’ P OH 5’

  13. Struktur sekunder • Double helix • Watson n Crick  menjawab struktur 3D DNA dgn X-ray diffraction pattern : hsl penelitian Rosalind Franklin • Mampu menyimpulkan bahwa : • mempunyai struktur double helix • dengan 10 basa setiap putaran • putaran 360, • basa Nitrogen A-T , G – C • cekukan mayor and minor • double helix memutar ke kanan • self replication

  14. Semikonservatif pd Replikasi DNA Mekanisme pengkopian DNA  melibatkan pembukaan double helix Setiap rantai menjadi pola / templat untuk pita baru Semi konservatif  apa beda dengan konservatif dan dispersive?

  15. X-ray diffraction : ada 2 macam • Yg telah diterjemahkan struktur 3 D nya : B form • Bentuk yang umum adalah B form • A form  RNA double helix • Gugus OH pd RNA  tidak memungkinkan melipat lebih dekat  membentuk A form yang lebih lebar

  16. Dalam kondisi normal (kondisi fisiologis)  DNA relatif stabil Kadang menjadi tidak stabil  krn proses2 replikasi, transkripsi

  17. Disosiasi double helix DNA  denaturasi • apabila DNA dipanaskan diatas melting temperaturnya (Tm) maka double helix akan terbuka • Tm  tergantung pada rasio (G+C)/(A+T) • G/C content dapat dihitung dengan (G+C) / (Total Basa N) x 100%

  18. RNA Ada 4 mcm • Hn RNA • mRNA • rRNA • tRNA • snRNA

  19. hnRNA  heterogeonous nuclear RNA  merupakan hasil transkripsi langsung dr DNA • mRNA  • telah mengalami proses posttranskripsi  menghilangkan intron  informasi genetik  dlm btk codon (urutan 3 nukleotida) • rRNA  • Komponen ribosom dimana translasi berlangsung • tRNA  • Menerjemahkan kode genetik • Menghubungkan antara asam nukleat dengan asam amino  protein • snRNA  • Small nuclear RNA  membantu proses splicing dalam post transkripsi proses

  20. composed of  a nucleic acid and a specific amino acid  provide the link between the nucleic acid sequence of mRNA and the amino acid sequence it codes for. An anticodon a sequence of 3 nucleotides in a tRNA that is complementary to a codon of mRNA Transfer RNA (tRNA) Structure of tRNAs

  21. Fungsi biologis • DNA sebagai pembawa informasi genetik • DNA  komponen dr kromosom • Fungsi yang lain: • Nukleotida sbg pembawa energi • Nukleotida sebagi koensim • enzim

More Related