130 likes | 282 Vues
Šūnu augšanas ātruma loma valīna biosintēzes regulācijā C. glutamicum celmos. M. Rukliša, L. Paegle, I. Deniņa. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas institūts. Izstrādāts EK 5. ietvara programmā
E N D
Šūnu augšanas ātruma loma valīna biosintēzes regulācijā C. glutamicum celmos M. Rukliša, L. Paegle, I. Deniņa LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas institūts Izstrādāts EK 5. ietvara programmā Construction of Corynebacterium glutamicum strains producing either L-valine or D-pantothenic acid – a rational approach using genome research (VALPAN)
Valīns - neaizvietojamā aminoskābe C. glutamicum - aminoskābju producenti: • Glutamīnskābe • Lizīns • Fenilalanīns • Glutamīns • Treonīns Aktualitāte • Valīns ???
L-Treonīns Piruvāts + Piruvāts acetohidroksiskābes sintāze (AHAS) Treonīndehidratāze (ilv A) (ilv BN) Acetolaktāts Ketobutirāts NADPH + Izomēro-reduktāze Piruvāts (ilv C) NADP+ (panBCDE) Dihidroksiizovalerāts D-pantotenāts Dihidroksiskābes dehidratāze L-leicīns (ilv D) H2O Ketoizovalerāts L-glutamāts Transamināze B (ilv E) oksoglutarāts L-Izoleicīns L-valīns (brnEF) L-valīns
Izmantotie celmi C. glutamicum ATCC 13032: 1. ilvA pJC1 ilv BNCD (i-leu auksotrofs ar val sintēzes gēnu overekspresiju) 2. ilvA panBC pJC1 ilvBNCD (“ “ ar papildus pantotēnskābes auksotrofiju)
AHAS Piruvāts + Piruvāts acetolaktāts Kāpēc svarīgs šūnu augšanas ātrums (µ) ? • svarīgs šūnas fizioloģiju raksturojošs lielums • viegli regulējams parametrs Kā raksturot valīna sintēzi? • qP - šūnu specifiskais valīna sintēzes ātrums • (g h. g X) • YP/S - valīna iznākums no substrāta • (g val g gli) • AHAS aktivitāte (nmol mg proteīna)
C. glutamicum pJC1, µ un šūnas enerģētiskais lādiņš (EC)* ATP+1/2 ADP ATP+ADP+AMP *EC=
Glikoze PTS FEP Piruvāts 0,32 Acetil-KoA OAA Citrāts AC Malāts Izocitrāts Glioksilāts ICDH Fumarāts Oxo-glutarāts Sukcināts Glutamāts NADP+ Laktāts G-6-PDH NADPH Glikozes-6- P NADPH 6- P -glukonāts Fruktozes 1,6bis P Valīns Ribozes-5- P FEP Liels Yval/S Piruvāts
6 h 11 h C. glutamicum pJC1: YX/S and YP/S eksponenciālajā (6 h) un palēninātas (11 h) augšanas fāzē
teorētiski - I-leu limits • parādīts eksperimentāli - valīna stress (valīns inhibē I-leu transportu šūnā) 1 g X sintēzei vajadzīgi 2,8 mmol piruvāta 1 g val sintēzei vajadzīgi 18 mmol piruvāta tomēr nepietiek!!! Kas izraisa µ samazināšanos? Kāds labums no µ samazināšanās?? • Ekonomējam piruvātu: • **uz biomasas rēķina ** ierobežojam piruvāta plūsmu Krebsa ciklā ** sekundāri: palielinam valīna eksporta ātrumu
Secinājumi • Šūnu augšanas ātruma samazināšanās ir metode kā palielināt valīna biosintēzi C. glutamicum šūnās • Valīna biosintēzes palielināšanās izskaidrojama: • 1) ar samazinātu piruvāta izmantošanu biomasai • 2) ar samazinātu piruvāta plūsmu TCA ciklā • 3) perspektīvā - ar palielinātu brnEF ekspresiju (???)