1 / 8

Service Commun en Biologie

Service Commun en Biologie.

zohar
Télécharger la présentation

Service Commun en Biologie

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Service Commun en Biologie Le SERCOBIO, dirigé par Fabrice Martin-Laurent, lie par une convention l ’INRA, l ’Université de Bourgogne, l’INSERM, le CNRS et l’ENSAD. Cette structure gère l ’investissement d’équipements lourds ainsi que leur mise en place et leur fonctionnement dans le cadre de services communs. Le SERCOBIO gère actuellement trois services commun : Centre de Microscopie : CMAB (Claude Imbert) SCME (Silvio Gianinazzi) Service Commun en Cytométrie de Flux (Anabelle Legrand) Service Commun de Séquençage et de Génotypage (Laurent Philippot)

  2. Service de Séquençage et de Génotypage

  3. Service de Séquençage et de Génotypage Le SSG c ’est quoi? Dernier service commun du SERCOBIO (début de l’aventure décembre 2000) Le SSG sert à quoi? réalisation de séquences nucléotiques d ’ADN analyse de fragments d ’ADN pour le génotypage quantification de gènes (PCR quantitative) utilisation de filtres et puces à ADN (détection/transcription de gènes) développement de techniques nouvelles d ’études des acides nucléiques participation à l ’enseignement et à la formation permanente

  4. Service de Séquençage et de Génotypage Le SSG c ’est qui? Intervenants du Campus Universitaire Dijonnais Laboratoire de Malherbologie, INRAStation de Génétique et d’Amélioration des Plantes, INRAUMR 692, INRA-UB, Laboratoire PhytopharmacieUMR BBCE-IPM, INRA-UB, UMR CNRS5561, CNRS-UB, Laboratoire d’Ecologie et d’EvolutionUMR MGS, Laboratoire de Microbiologie et Géochimie des Sols CESG Intervenants « extérieurs » CHU, Faculté de Médecine, Laboratoire de Génétique moléculairePromogène (start up hébergée par l ’Unité INSERM dirigé par Mr Solari)

  5. Service de Séquençage et de Génotypage • Le SSG c ’est quoi pour l ’instant? • un séquenceur/génotypeur (Beckman, CEQ2000XL, 2000) • deux séquenceurs/génotypeurs de type LICOR (2003, 2004) • un lecteur de microarrays Affimetrix (juin 2002) • une PCR quantitative ABI7900 • Le SSG ce sera quoi à l ’avenir? •  2005 un robot pipeteur •  2006 un robot extracteur

  6. Service de Séquençage et de Génotypage Les techniques de génotypage  T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) Marqueurs micro-satellites (pool-plexage) AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism Analysis)  A-RISA (Ribosomal Intergenic Spacer Analysis) Marqueur SNP (Single Nucleotide Polymorphism)  Tilling Les techniques quantitatives  PCR quantitative SYBRGreen et TaqMan  Lecture de puces à ADN

  7. Service de Séquençage et de Génotypage • Comment ça marche ? • réservation du séquenceur en ligne via le site web SERCOBIO • mise en route, maintenance et gestion des appareils assurés par D BRU (AI MGS), •  préparation des échantillons, lancement de l ’analyse, analyse et/ou transfert des données assurés par l ’utilisateur, • Le coût du fonctionnement du séquenceur/génotypeurSSG ? •  un abonnement de 250 € (HT)/an, •  un coût de 2,30 € (HT) par séparation soit 18,40 € (HT) pour 8 échantillons, • analyse LICOR coût fonction longueur du gel,

  8. Service de Séquençage et de Génotypage • Quelle perspective pour le SSG ? • vers une plateforme RIO: réponse appel offre • Localisation dans le bâtiment CMSE

More Related