1 / 8

Oddelenie b iofyzik y

Oddelenie b iofyzik y. Smery výskumu : Stabilita a funkcie biomakromolekúl Konformačné prechody biomakromolekúl Vplyv biologicky aktívnych látok na amyloidné štruktúry Vývoj supramolekulárnych komplexov nanočastíc s biomolekulami Elektrostatické interakcie polyelektrolytov

alisa
Télécharger la présentation

Oddelenie b iofyzik y

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Oddelenie biofyziky • Smery výskumu : • Stabilita a funkcie biomakromolekúl • Konformačné prechody biomakromolekúl • Vplyv biologicky aktívnych látok na amyloidné štruktúry • Vývoj supramolekulárnych komplexov nanočastíc s biomolekulami • Elektrostatické interakcie polyelektrolytov • Obrazová analýza biologických objektov • Molekulárnemodelovanie

  2. Projekty riešené na OBF • VEGA: (5) • Molekulárne mechanizmy konformačnej stability proteínov (M.Antalík) • Agregácia proteínov a identifikácia inhibítorovagregácie (Z. Gažová) • Molekulárne modelovanie interakcií dendrimérov s liečivami za účelom • využitia týchto komplexov ako presných nanočastíc pre „drug- • delivery“ systémy(T. Kožár) • Interaktívne algoritmy segmentácie na báze aktívnych kontúr a ich • uplatnenie pri meraní fyzikálnych vlastností biomedicínskych objektov (Z. Tomori) • APVV: (3) • 1-Methoxyindolové fytoalexíny a ich analanalógy ako nový typ zlúčenín • s protinádorovou aktivitou(T. Kožár) • Vytvorenie virtuálneho laboratória na účinnú analýzu ligandov a • ligand-receptor interakcií(T. Kožár)

  3. Publikácie: • CC: Výjdené: • ANDRE, S. - KOŽÁR, T. - SCHUBERTH, R. - UNVERZAGT, C. - KOJIMA, S. - GABIUS, H.J.Substitutions in the N-Glycan Core as Regulators of Biorecognition: The Case of Core-Fucose and Bisecting GlcNAc Moieties.Biochemistry. Vol. 46, no. 23 (2007), 6984-6995. (IF 3.63) • TOMÁŠKOVÁ, N. - VARHAČ, R. – ŽOLDÁK, G. – OLEKŠÁKOVÁ, L. – SEDLÁKOVÁ, D. – SEDLÁK, E.Conformational stability and dynamics of cytochrome c affect its alkaline isomerization.J. Biol Inorg. Chem. 12, (2007), 257-266. (3.224 - IF) • HEFFERAN, M.P. – KUCHAROVA, K. – KINJO, K. – KAKINOHANA, O. – SEKERKOVA, G. – NAKAMURA, S. – FUCHIGAMI, T. – TOMORI, Z. – YAKSH, T.L. – KURTZ, N. – MARSALA, M.Spinal Astrocyte Glutamate Receptor 1 Overexpression after Ischemic Insult Facilitates Behavioral Signs of Spasticity and Rigidity.J. Neurosci. 17, no. 27 (2007), 11179-11191. (IF - 7.45) • KOŇÁK, Č. - SEDLÁK, M.pH-Sensitive Micelles Formed by Interchain Hydrogen Bonding of Poly(methacrylic acid)-block-Poly(ethylene oxide) Copolymers.Macromolecular Chemistry and Physics. 208, (2007), 1893-1899. • (IF 2.02) • M. Pickhardt, Biernat J., Khlistunova I. Wang Y.P., Gazova Z., Mandelkow E.M., Mandelkow E. N-Phenylamine Derivatives as Aggregation Inhibitors in Cell Models of Tauopathy.Current Alzheimer Research, 4 (2007), 397-402 – nie je uvedený ústav • Zaslané: • S. Poniková, M. Antalík, T. Hianik • A CD spectroscopy study of the formation of guanine quadruplexes by DNA aptamers that selectively • bind thrombin at different exosites. Effect of potassium and sodium ions. • Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters • J. Bágeľová, D. Fedunová, Z. Gažová, M. Antalík, • Different effect of sorbitol and NaCl on native and acid unfolded cytochrome c” • Biophysical Chemistry • R. Varhač, M.Antalík • Binding of cyanide to ferricytochrome c in acidic pH region • J. Biol. Inorg. Chemistry • Z. Gazova, A. Bellova, J.Imrich, P. Kristian, Z. Daxnerova, J. Bagelova, D. Fedunova and • M.Antalik Acridine derivatives inhibit lysozyme aggregation • Europ. Biophys. J.

  4. Pozvané prednášky: • Z. Gažová – Amyloid structures, ISMN CNR Bologna, Taliansko – 13-16 Február 2007 • Z. Gažová – Amyloid structures, BIODOT Meeting, Budapest, Maďarsko, 7.-8. máj 2007 • KOŽÁR, T. Clusters, Grids & Molecules: Virual Screening. In Grid for Pharmaceutical & Biomedical Challenges. EGEE Industry Day Bratislava, Slovakia, 19 September 2007 • KOŽÁR, T.High-throughput computing in molecular modeling and design. In 3rd International Workshop on Grid Computing for Complex Problems, Bratislava, Slovakia, October 22-23, 2007 • Konferenčné príspevky: 15

  5. Organizácia konferencií: • Medzinárodná konferencia • 5. ročník - Štruktúra a stabilita biomakromolekúl (5-8. 9. 2007 Košice) • plus satelitná konferencia Moderné trendy vo výskume biomakromolekúl • Pedagogika: • PF UPJŠ v Košiciach M. Antalík (prednášky Biochémia I , Biofyzikálna chémia I a II ) Z. Gažová (prednášky Enzymológia ) • FEI TU Z. Tomori (prednáška Počítačové videnie)    • Diplomové práce: 6- (Z.Gažová, D. Fedunová, E. Valušová)

  6. Supramolekulárne štruktúry- Nanočastice biomakromolekuly • Cieľ: Vytvoriť metodický základ na syntézu a charakterizovanie nanočatíc • tri základné typy nanočastíc : plasmónové ( Au, Ag, Cu) • kvantové body ( ZnO, ZnS) • biokeramické (hydroxyapatit) • Dimenzionalita 0., 1., 2., 3.D • Rok 2007 sústredenie na prípravu a izoláciu Au a Ag nanočastíc pasivovaných s glutationom • Vlastnosti nanočastíc sú výrazne ovplyvnené veľkosťou a tvarom. • Pri syntéze vznikajú vždy rozdielne štruktúry nanočastíc. S využitím techník používaných pri izolácii biomakromolekúl je možné získať chemicky čisté veľkosťou a tvarom rovnaké nanočastice.

  7. PAGE elektroforéza Ag-glutation (Au- glutation)nanočastíc syntetizovaných mokrou cestou v rôznych koncentračných pomeroch reaktantov- • Tieto nanočastice vytvárajú komplexy s cytochrómom c pričom zvyšujú jeho stabilitu v okolí hemu. • Zlaté nanočastice majú výrazne protiagregačné vlastnosti na amyloidné štruktúry • V súčasnosti prebieha charakterizácia ich magnetických vlastností.

  8. ďakujem za pozornosť

More Related