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Propiedades de regiones eucromaticas y heterocromaticas

Propiedades de regiones eucromaticas y heterocromaticas. Heterocromatina Facultativa (fHC) retiene el potencial de pasar a eucromatina. Cambios dinámicos entre varios estados de la cromatina. Arquitectura nuclear: distribución de zonas de distintas densidad cromatinica. corte retina.

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Propiedades de regiones eucromaticas y heterocromaticas

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Presentation Transcript

  1. Propiedades de regiones eucromaticas y heterocromaticas

  2. Heterocromatina Facultativa (fHC) retiene el potencial de pasar a eucromatina

  3. Cambios dinámicos entre varios estados de la cromatina

  4. Arquitectura nuclear: distribución de zonas de distintas densidad cromatinica corte retina Tinción DNA cromocentros y lamina nuclear Zonas de alta densidad en cromatina condensada En bastones hay un solo cromocentro en el centro del núcleo En las demás células varios cromocentros y una lámina perinuclear

  5. Arquitectura nuclear: distribución de zonas de distintas densidad cromatinica Conos Células ganglionares fibroblastos Distribución de bandas C, G y R C: Major satellite repeats (MSR) G: L1 (major class of long interspersed repeats) R: B (major class of short interspersed repeats in euchromatin)

  6. Arquitectura nuclear: distribución de genes DAPI lamina genes silenciosos genes activos genes housekeeping cromocentros En células ganglionares los genes están subrepresentados en la superficie nuclear, mientras que en bastone están enriquecidos en la periferia

  7. Eucromatina o heterocromatina: diferente HS a la DNAsa I El locus de la b-globina de gallina HS constitutivo LCR: Locus control region Estos elementos son reguladores (enhancers) transcripcionales complejos que regulan la expresión de genes que se expresan ordenadamente durante el desarrollo o diferenciacion. Los LCRs se caracterizan por tener múltiples DHS (DNAseI hipersensitive sites). Se distinguen de los enhancers por su capacidad de conferir a un transgen un nivel de expresión independientemente de la posición donde se inserte y proporcional al numero de copias Se atribuye a los LCRs un rol dominante en la apertura de la cromatina, una fuerte actividad enhancer y la capacidad de establecer dominios de modificación de histonas.

  8. DNAsa I HS en el locus de la b-globina de gallina kb b b t t b b b b b: bazo t: timo

  9. e, g b expresión Análisis de la sensibilidad generalizada a la DNAsa I durante el desarrollo DNAsa I NF-M murine neurofilamente gene inactivo

  10. DNAseI-chip method para estudiar la distribución genómica de DHS hibridar simultaneamente con una biblioteca formada por un DNA cortado al azar, sin haber tratado con DNAsaI

  11. Identificación a escala genómica de sitios de DHS en células CD4+ T

  12. Correlacion DHS (celeste) con nivel de expresion Distribución de la posicion de los DHS Ubicación de los DHS alrededor del TSS

  13. Localizacion de las mono-, di- y tri-metilaciones en K9 en células MEF 3mK9 localiza en regiones pericentromericas 2mK9 y 1mK9 localizan en regiones eucromaticas

  14. HMT G9a dirige las mono- y di-metilaciones en K9

  15. HMT Suv39h1 y Suv39h2 dirigen las trimetilaciones en K9 DN: doble mutante

  16. Arquitectura nuclear: distribución de las modificaciones de histonas marcadores de heterocromatina marcador de eucromatina

  17. Cambios en las modificaciones de histonas al pasar de eu a hetero cromatina

  18. HP1 y sus interacciones WT anti-HP1 DAPI anti-HMT myc3-SUV39H1 -- myc3H324L mutante inactiva de SUV39H1

  19. mapeo de alta resolucion de la localizacion de Swi6 (HP1) en el locus Mat de S.pombe

  20. Distribución de la H3-K9 metilada en el locus Mat

  21. Distribución de la H3-K4 metilada en el locus Mat

  22. Distribución de Swi6, H3-K9 met o H3-K4 met en el locus Mat al delecionar los elementos aislantes

  23. Distribución de las proteínas de ClrC Cul4 Rik1 Raf1 Raf2 Rbx1 Clr4

  24. Clr4 HMT escribe y lee cromo domain SET domain Clr4

  25. Modelo de nucleación y propaganción de heterocromatina Figure 7 Model showing RNAi-mediated nucleation and spreading of heterochromatin. RNAi factors such as RITS, RDRC and Dicer, involved in processing of repeat transcripts (red line) into siRNAs, are required for targeting of ClrC to the heterochromatic repeats. siRNA-bound Ago1 is likely to specify the targeting of RITS to nascent repeat transcripts. RITS then facilitates ClrC loading. Rik1 might also directly associate with the repeat transcript and/or some part of the elongating RNAPII complex, thus promoting ClrC loading to nucleate heterochromatin. After the initial methylation of H3K9 by ClrC, Clr4 bound to H3K9me could modify adjacent nucleosomes creating additional binding sites for ClrC and other chromodomain proteins including Swi6 and Chp2 (HPs), which in turn mediate recruitment of factors such as SHREC, thereby promoting higher-order chromatin organization. Swi6 could further contribute to long-range heterochromatin spreading by promoting higher-order chromatin organization by forming oligomers and stabilizing the ClrC binding to chromatin. Boundary DNA elements block inappropriate spreading of heterochromatin into euchromatic regions. Green flag, histone acetylation; red lollipops, H3K9me

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