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2006 年诺贝尔医学奖

2006 年诺贝尔医学奖. RNA 干扰机制. 演讲人: 魏玮. 一 获奖者简介. 安德鲁 · 法尔 ( Andrew Fire ). · 1959 年出生于美国加利福尼亚州圣克拉拉县 · 1983 年获美国麻省理工学院生物学博士学位 · 现任斯坦福大学斯坦福医学院病理学和遗传学教授. 克雷格 • 梅洛( Craig C. Mello ). · 1960 年 出生于美国 · 1990 年获得哈佛大学生物学博士学位 · 现任美国哈佛大学马萨诸塞州医学院分子医学教授. 二 RNAi 机制 1. RNAi 背景.

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Presentation Transcript


  1. 2006年诺贝尔医学奖 RNA干扰机制 演讲人: 魏玮

  2. 一 获奖者简介 安德鲁·法尔(Andrew Fire) ·1959年出生于美国加利福尼亚州圣克拉拉县 ·1983年获美国麻省理工学院生物学博士学位 ·现任斯坦福大学斯坦福医学院病理学和遗传学教授

  3. 克雷格•梅洛(Craig C. Mello) ·1960年 出生于美国 ·1990年获得哈佛大学生物学博士学位 ·现任美国哈佛大学马萨诸塞州医学院分子医学教授

  4. 二 RNAi 机制 1.RNAi 背景 ●RNA interference由双链RNA(Double Strand RNA简称dsRNA)指导的,在特定酶参与下,以外源或内源mRNA为降解目标,在转录后水平上使特异性靶基因发生的沉默现象 ●生物界普遍存在的一种古老而进化的高度保守的生物学现象 ●存在于从真菌到高等植物、从无脊椎动物到哺乳动物的大多数真核生物中,原核生物暂未发现

  5. 2. RNAi的发现 ☆1990年,科学家Rich Jorgensen将产生紫色素的基因置于一个强启动子后导入开紫花的矮牵牛中,希望得到紫色更深的花,但结果是:矮牵牛花完全褪色,花瓣变成了白色。当时认为这是导入的基因和其相似的内源基因同时都被抑制,并将之称为协同抑制 ☆1995年,康奈尔大学的Su Guo博士在用反义RNA阻断线虫基因表达的试验中发现:反义RNA(anti sense RNA)和正义RNA( sense RNA)都阻断了基因的表达 ☆1998年,Andrew Fire和Craig Mello将反义RNA和正义RNA同时注射到秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)比单独注射反义RNA诱导基因沉默的效率高10倍

  6. 3.RNAi机理 3.1 dsRNA的形成 ◆ 基因组中DNA反向重复序列的转录产物 ◆DNA同时转录了反义RNA和正义RNA的互相结合 ◆ 病毒RNA 复制中间体 ◆ 以细胞中单链RNA 为模板,由细胞或病毒的RNA 在有关酶的催化下合成dsRNA等

  7. 3.2 siRNA(干扰性小RNA small interfering RNA,简称siRNA)的形成 3.21核酸内切酶Dicer ▲RNaseIII家族中特异识别双链RNA的一员 ▲含有解旋酶活性以及dsRNA结合域和PAZ结构

  8. 3.22siRNA形成过程 (1)dsRNA在细胞中大量扩增 (2) dsRNA在细胞中达到一定量时,核酸内切酶Dicer识别并与之结合形成酶-dsRNA复合体 (3)核酸内切酶Dicer 对siRNA进行切割,产生21-23nt长的dsRNA小片段,即siRNA

  9. 3.23 siRNA的特征性结构: ※siRNA的序列与所作用的靶mRNA 序列具有同源性 ※siRNA 两条单链末端为5′端磷酸和3′端羟基 ※ 正义链与反义链各有21个碱基,其中19个碱基配对,在每条链的3′端都有2个不配对的碱基(图1)。 图1 siRNA示意图

  10. 3.3 RISC的形成和发挥效应 3.31 RISC的形成 siRNA和核糖核酸酶复合物结合,形成RNA诱导的基因沉默复合体(RNA-induced silencing complex,简称RISC) 3.32 RISC蛋白成分 内切核酸酶、外切核酸酶、解旋酶、同源RNA 链搜索活性酶、Argonaute等

  11. 3.33 Argonaute蛋白 ☆RISC的特有成分,被比喻成“切薄片的机器”。 ☆Argonaute有一个月牙型的底座由三部分组成,分别为N-端(amino-terminal)、中部(middle)和PIWI区域(PIWI domain)。月牙底座上面有一个PAZ部分,由茎杆结构支撑。Argonature蛋白有一个凹槽贯穿整个蛋白,凹槽内壁带正电有利于与RNA带负电的磷酸骨架结合

  12. 图2siRNA引导mRNA被切割的模型

  13. 3.33 效应阶段 (1) RISC中的siRNA依赖ATP水解释放的能量而解旋,双链转变成单链而使复合体被激活,得到活性RISC。 (2) siRNA解旋后,siRNA单链的3’端伸入PAZ的裂缝中,整个单链沿着PAZ伸展开,同时目的片段mRNA结合于新月型底座。siRNA反义链与mRNA互补区域结合,形成双链 (3) 在离单链siRNA5’端9个碱基处,由RNA酶切割mRNA,阻断RNA的翻译,达到在RNA水平上干扰基因表达的效果

  14. 图4 RNAi原理示意图: 紫色 正义RNA段 蓝色 反义RNA段 绿色 目标信使RNA

  15. 3.34 siRNA特殊的保障机制——随机降解性多聚酶链式反应 siRNA形成后另外作为一种特殊引物,在RNA 依赖RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase, 简称RdRp) 作用下以靶mRNA为模板合成dsRNA,后者在Dicer酶的作用下又可被降解形成新的siRNA,新生成的siRNA再进入上述循环

  16. 3.5 siRNA目标位点的筛选 (1) 在预定沉默的mRNA中找一段21nt的序列,起始是AA (2) 找2~4个小片段的RNA,通过SECs(siRNA expression cassettes,简称SECs)筛选最有效的siRNA (3) 在19nt的RNA片断中不能含有连续4个T或A的区域 (4) 通过BLAST 确定片断的特异性; (5) 片断GC%应该在30%~50%

  17. 三 RNAi的应用 1. 开展基因治疗的新途径 一基因家族的多个基因具有一段同源性很高的保守序列这一特性, 设计针对这一区段序列的dsRNA分子,只注射一种dsRNA即可以产生多个基因表达同时降低的表现,也可同时注射多种dsRNA而将多个序列不相关的基因同时剔除。

  18. *抗肿瘤治疗 RNAi可用于抑制癌基因的表达 *传染性疾病 根据病原体如病毒、细菌等的致病基因序列,以及生物体内与疾病发生相关的基因序列,设计和制备与这些基因序列有同源序列的dsRNA,转入动植物内使有关的疾病基因“沉默”,从而达到治疗的效果。

  19. *AIDS治疗 利用siRNA抑制病毒再生或传染所需的蛋白质的生成。优势在于能够不损伤细胞而只抑制病毒蛋白质。 *动物实验证明,通过RNAi的方法使导致血胆固醇升高的基因“沉默”。 *美国哈佛医学院的科学家成功地利用RNA干扰技术治愈了实验鼠的肝炎。

  20. 2. 功能基因组的研究 *由于RNAi具有高度的序列专一性,可以准确地使特定基因沉默,获得功能丧失或降低突变,这样当某一特定基因被“沉默”后,其功能便反向的体现出来 *RNAi能够在哺乳动物中降低特异性基因的表达,制作多种表型,而且抑制基因表达的时间,控制基因表达的部位

  21. 四 未解难题 ★ RNA干扰在患者体内的有效部位进行 ★ 是否会影响目标基因以外的其他基因,引发副作用

  22. Thank You!

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