Grupo Greco Pesquisas em Ontologias

1. Grupo GrecoPesquisas em Ontologias Programa de Pós-Graduação em Informática IM/NCE UFRJ

2. Grupo GRECO – Grupo de Engenharia do Conhecimento • Fusão de dois grupos • DatAware • Foco em Gerência e Integração de Informações • Data Warehousing • Gerência de Metadados • Des. e uso de Taxonomias, Terauros e Ontologias • Tratamento de Informações não estruturadas • Web Semântica • CHORD • Foco em Suporte por Computador ao Trabalho Cooperativo • Groupware • Aspectos de SCTC no Desenv. de Software • Gestão do Conhecimento • Modelagem de Processos e Workflow • Engenharia de Resiliência • Interações via dispositivos moveis

3. Orientados atuais 4 Alunos de Doutorado 29 Alunos de Mestrado 20 Alunos de Graduação Membros do Grupo Marcos Borges (NCE&IM) Jose Orlando Gomes (DEI/POLI) Amauri M. Cunha (NCE) Paulo Victor Carvalho (CNEN) Maria Luiza Campos (DCC/IM) Vanessa Braganholo (DCC/IM) Pedro M. da Silveira (NCE&IM) João Carlos P.da Silva (DCC/IM) Jonice Oliveira (DCC/IM) Parceiros Maria Luiza A.Campos (CInform. – UFF) Maria Cláudia Cavalcanti (IME - RJ) Alberto Dávila (IOC) José H. Canós (Espanha) José A. Pino (Chile) Pedro Antunes (Portugal) Patrick Brezillón (França) David Woods (EUA) Grupo Greco

4. Características de nossas pesquisas • Grande ênfase em: • pesquisa aplicada • trabalho inter e multidisciplinar • Principais Áreas de Aplicação: • Resposta a emergências • Bioinformática • Petróleo

5. Membros do Grupo Marcos Borges (NCE&IM) Jose Orlando Gomes (DEI/POLI) Amauri M. Cunha (NCE) Paulo Victor Carvalho (CNEN) Maria Luiza Campos (DCC/IM) Vanessa Braganholo (DCC/IM) Pedro M. da Silveira (NCE&IM) João Carlos P.da Silva (DCC/IM) Jonice Oliveira (DCC/IM) Parceiros Maria Luiza A.Campos (UFF) Maria Cláudia Cavalcanti (IME - RJ) Alberto Dávila (IOC) José H. Canós (Espanha) José A. Pino (Chile) Pedro Antunes (Portugal) Patrick Brezillón (França) David Woods (EUA) Grupo Greco Eng. de Produção Eng. de Resiliência Ciência da Informação Bioinformática Engenharia de Resiliência, Emergências

6. Projetos recentes do Grupo • SAMU • Melhoria dos serviços prestados pelo SAMU-Rio: Desenvolvimento e implantação de soluções baseadas em Tecnologia de Informação e Gestão do Conhecimento (FAPERJ) • QUAMOSTRA: • Avaliação e melhoria da coleta de amostras de petróleo através da modelagem da cadeia amostra- ensaio(FINEP/CENPES) • FIOCRUZ: • Ambiente de workflow e uso de ontologias para análise genômica de protozoários (FAPERJ, CNPq) • ONS • Ambiente analítico de suporte aos Indicadores Elétricos e Energéticos • Gerência de metadados corporativos • Ambiente analítico sobre clippings do setor elétrico

7. Estado da arte em esquemas classificatórios e terminológicos • Metodologias atuais ineficientes • Tratam grandes etapas • Pouco suporte para a identificação de conceitos do domínio • Dificuldade de reúso de vocabulários e clara identificação do escopo de ontologias e outros esquemas de representação já existentes • Ferramentas de elaboração, integração e extração de taxonomias, tesauros, ontologias • Ainda pouco flexíveis, se quisermos contemplar os diferentes esquemas classificatórios e terminológicos

8. Pesquisas associadas a Ontologias • Investigação de Esquemas de Classificação, Controle Terminológico e Representação de Domínios em Sistemas de Informação e Gestão do Conhecimento • Taxonomias • Vocabulários Controlados • Tesauros • Ontologias • Aplicação visando a: • Melhoria na recuperação da informação • Integração e análise de informações • Suporte à proveniência e anotação de recursos

9. Aporte teórico da Ciência da Informação • Parceria iniciada há vários anos • Estudos e experiências no âmbito da organização da informação • Teoria da Classificação Facetada de Ranganathan • Teoria da Terminologia de Wüester • Teoria do Conceito de Dahlbe • Tipos de relações • Análise de domínio • Definições

10. Nossa pesquisas • Método de construção e melhoria de esquemas de organização e representação • Aporte da Ciência da Informação • Fundamental: Parceria com a UFF • Necessidade de uso de mecanismos para geração automática/ extração à partir de acervos • Aporte da Linguística Computacional e IA • Forte ênfase no reúso • Ferramental de apoio à visualização e utilização de ontologias • Gerência e descrição (formal?) de ontologias • Como descrever seu escopo? • Como definir recortes adequados para o domínio em foco?

11. Bioinformática • Projeto de parceria de 8 anos com Instituto Oswaldo Cruz • Genômica comparativa tripanosomatídeos • IME, PESC/COPPE, UFF, UFSC, ... • Experimentos envolvem múltiplos recursos de dados e programas • Descrição, utilização e integração dos recursos • Suporte à workflows científicos • Ontologias já são amplamente utilizadas neste domínio

12. Bioinformática - pesquisas • Exploração das ontologias da OBO • Melhoria da anotação genômica, com ampliação do uso de ontologias • Uso de múltiplas ontologias • Recorte para o foco requerido • Integração e recuperação de recursos • Melhoria na captura de informações de proveniência, através do uso de ontologias • Metamodelos para suporte à captura da proveniência • Uso de múltiplas ontologias como referência aos diversos tipos de proveniência

13. Bionformática - Proveniência

14. Gestão do Conhecimento na Resposta a Emergências Tratamento do conhecimento contextual Suporte de ontologias ao acesso, compartilhamento e integração de informações Tratamento analítico de dados heterogêneos Estudo de aspectos cognitivos e ambientais Uso de dispositivos móveis

15. Aplicações em emergências • Captura do conhecimento de situações de emergência • ontologias como quadro de referência, contendo conhecimento prévio do domínio • Integração de informações de diversas fontes na resposta à emergências • Ontologias no suporte à recuperação e integração de informações heterogêneas

16. Orientações em andamento no tema • Linair Campos (co-orientação): • Aporte da compatibilização de linguagens na Ciência da Informação aplicado ao reuso de ontologias • Sérgio Manuel Serra da Cruz • Uso de ontologias no suporte à proveniência em ambientes de workflow científico (IOC) • Vivian Santos • Alinhamento de múltiplas ontologias aplicado à anotação genômica • Débora Constantino: • Utilização de métricas de similaridade e qualidade de ontologias em estratégias de alinhamento de múltiplas ontologias

17. Orientações em andamento no tema • Miguel Prazeres • Tratamento de definições para complementar representação de domínios em ontologias biológicas • Eliêmia Araújo • Ontologias no suporte a Sistemas de Controle de Emergências

18. Recuperação e Visualização de Informação • Busca Exploratória e MultiFacetada • Expansão de consultas • Busca Multifacetada • Tratamento e exploração analítica de informação textual • DW integrando dados estruturados e não estruturados • Dimensões e facetas como perspectivas sobre o domínio • Clusterização para fins analíticos • Categorização hierárquica facetada • Abordagens de visualização para exploração de informações textuais e ontologias

19. Visualização de Informações • Como lidar com a sobrecarga cognitiva em ambientes analíticos de dados e documentos? • Novas formas de apresentação de dados que são numerosos e volumosos • Como lidar com grandes ontologias como a GO? • Apoiar interação visual entre usuario e sistemas com diferentes abordagens de manipulação e análise visual de dados e informações

20. SOM - Exemplo Aglomerado de documentos similares Documento Intensidade da cor verde retrata o tamanho dos documentos (bytes) Sub-região de documentos que compartilham os temas: aspirina, paciente e metamorfina. Sub-região de documentos que compartilham os temas: coração, sangue e pressão.

21. Orientações em andamento no tema • André Bechara: • Técnicas de expansão de consultas para domínios fechados • Renato Alves: • Uso combinado de técnicas de busca e taxonomias facetadas • Fábio Heuseler • Abordagem para definição de modelo integrado analítico para dados estruturados e não-estruturados, utilizando taxonomias facetadas • João Victor Freitas • Abordagem analítica facetada no apoio a medicina baseada em evidências

22. Orientações em andamento no tema • Projetos Finais de Graduação (6) • 4 bolsas IC e PIBEX • Aplicações em Bioinfo e Resposta a Emergências

23. Considerações finais • Ontologias, metamodelos, esquemas de classificação, etc. • Atendem diferentes objetivos • Mas têm muito em comum • Muitas ferramentas, formalismos • Necessário ampliar nossa compreensão de outros aspectos igualmente relevantes • Bases teóricas de organização de conhecimento • Aspectos cognitivos • Reais necessidades de nossos usuários.... • Trabalho interdisciplinar é muito importante