1 / 173

CSL-NOTCH-MAML TERNARY COMPLEX

CSL-NOTCH-MAML TERNARY COMPLEX. Bea Antolín, Marta Curriu, Alba Diz, Laia Morató i Anna Morancho. ÍNDEX. Estudi per separat de les 3 proteïnes del complexe : 1.1 Notch IC  Domini RAM  Descripció (conservació) Modelat Domini ANK  Descripció

fraley
Télécharger la présentation

CSL-NOTCH-MAML TERNARY COMPLEX

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. CSL-NOTCH-MAML TERNARY COMPLEX Bea Antolín, Marta Curriu, Alba Diz, Laia Morató i Anna Morancho

  2. ÍNDEX • Estudi per separat de les 3 proteïnes del complexe: • 1.1 Notch IC Domini RAM  Descripció (conservació) • Modelat • Domini ANK Descripció • Estudi conservació del domini • 1.2 CSL Descripció (conservació) • Interaccions amb el DNA • Estudi d’homologia • 1.3 MAML  Descripció (conservació) • Modelat

  3. ÍNDEX • Estudi del complexe ternari • 2.1 Interaccions domini RAM  CSL i ANK • 2.2 Interaccions domini ANK  CSL • 2.3 Interaccions MAML  ANK i CSL

  4. Via NOTCH • CSL unit a DNA i acomplexat amb proteïnes corepressores • Unió delta-notch amb la consequent proteolisi de la part ICNotch • Translocació al nucli de ICNotch

  5. 4. Unió Notch (RAM) - CSL (β-trefoil domain) CSL passa de ser repressor a activador RAM desplaça els corepressors (?) 5. Unió Notch (ANK) a CSL (RHR) 6. Unió Notch-CSL crea la superfície de reconeixement per l’hèlix de MAML1 -> Unió de l’hèlix MAML1

  6. 7. Unió de p300 a MAML1 o Notch? 8. p300 connecta Notch a la maquinària de transcripció 9. Activitat transcripcional 10. Generalment el producte d’aquests gens són proteïnes reguladores que bloquegen l’expressió de gens necessaris per la diferenciació neural.

  7. Notch IC. Dominis RAM + ANK

  8. NOTCH: • Domini extracel·lular: • EFG • 3 LNR (Lin Notch Repeats) • Domini intracel·lulars: • RAM (RBP-jk-associated molecule) • Ankyrin Domains • C-terminal : • PEST • NLS sequence • TAD domains (en Notch 1 i 2)

  9. Domini extracel·lular: • LNR (Lin Notch Repeats) Família Notch domain

  10. NOTCH DOMAIN = ‘DSL’domain = Lin-12/Notch repeat (LNR).

  11. ESTRUCTURA: • Domini extracel·lular: • EFG • 3 LNR (Lin Notch Repeats) • Domini intracel·lulars: • RAM (RBP-jk-associated molecule) • Ankyrin Domains • C-terminal : • PEST • NLS sequence • TAD domains (en Notch 1 i 2)

  12. Arg1761 Ser1890 • NotchIC : Domini RAM (RBP- JkAssociated Molecule) • Inici: g - secretase cleavage site • Final: primera repetició d’ankirina  100 residus Nam, Y. et al. J. Biol. Chem. 2003;278:21232-21239

  13. Domini RAM: Semblant entre espècies properes Identitat = 59,2% Identitat = 46,03%

  14. Domini RAM: Semblant entre espècies properes Identitat = 28,45 %

  15. Domini RAM : Divergent entre espècies llunyanes Identitat = 3,25%

  16. EBNA2 (Virus Epstein Barr) • Motiu conservat dins la regió RAM : IMPORTANT  Interacció NotchIC:CSL FWFP

  17. NotchIC : Domini RAM (RBP- JkAssociated Molecule) • Regió sense homologia amb cap proteïna d’estructura coneguda

  18. NotchIC : Regió RAM (RBP- JkAssociated Molecule) • Predominantment desestructurada • Pèptid aïllat • Dins context del domini ANK adjacent Pèptid flexible sense estructura 2aria significativa

  19. NotchIC : Domini RAM (RBP- JkAssociated Molecule) • Regió RAM (C. Elegans): Arg931 – Pro1020 • Regió cristal·litzada : Arg933-Glu952 Wilson JJ., Kovall RA. Cell. 2006; 124:985-996

  20. Domini ANK Regió RAM • NotchIC : Domini RAM (RBP- JkAssociated Molecule)

  21. NOTCH: • Domini extracel·lular: • EFG • 3 LNR (Lin Notch Repeats) • Domini intracel·lulars: • RAM (RBP-jk-associated molecule) • Ankyrin Domains • C-terminal : • PEST • NLS sequence • TAD domains (en Notch 1 i 2)

  22. Domini Ankyrin

  23. Descripció domini ankyrin - Repeticions de 33 residus - Descobert en Swi6/cdc10 i Notch. Nom per ankyrina - Un dels motius d’interacció entre proteïnes més comú - En moltes proteïnes de funcions variades: iniciadors de la transcripció, reguladors de cicle cel·lular, citoesquelet... - En bacteris, arqueas i eucariotes (principalment) - Diferent nombre de repeticions (Notch  7) - Definits més per l’estructura que no pas per la funció, ja que no reconeixen una única seqüencia o estructura

  24. En què consisteix el domini ankyrin? - helix-loop-helix amb un b-hairpin o llarg loop que projecta cap a fora les hèlices. - Repeticions consecutives s’ajunten formant un domini L-shaped. (semblant a mà)

  25. En què consisteix el domini ankyrin? - helix-loop-helix amb un b-hairpin o llarg loop que projecta cap a fora les hèlix. - Repeticions consecutives s’ajunten formant un domini L-shaped. (semblant a mà)

  26. Gly His Pro Thr Gly SEQÜÈNCIA CONSENS

  27. Gly His Pro Thr Gly Pont d’hidrògen entre His i Thr

  28. Thr His Pont d’hidrògen entre His i Thr

  29. Hidrofòbic core

  30. Alineament per seqüència dels dominis ankyrines de diferents proteïnes notch • Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes notch • Alineament per seqüència dels dominis ankyrines de diferents proteïnes • Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes

  31. Alineament per seqüència dels dominis ankyrines de diferents proteïnes notch 25% d’identitat

  32. ESTRUCTURA SECUNDÀRIA DE NOTCH D.MEL (DSSP) 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14

  33. REPEAT 1 1 2 Inserció

  34. Estructura secundària amb dssp REPEAT 2 i 3 Repeat 3 3 4 5 6

  35. REPEAT 4 i 5 Repeat 5 7 8 10 9 Estructura secundària amb dssp

  36. REPEAT 6 i 7 Repeat 7 11 12 13 14 Estructura secundària amb dssp

  37. Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes notch: human i mouse

  38. Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes notch: human i mouse (parcial) 26% d’identitat

  39. Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes notch: human i mouse (parcial) RMS 1,35 P value:1,33 · 10-7

  40. Alineament per seqüència dels dominis ankyrines de diferents proteïnes notch • Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes notch • Alineament per seqüència dels dominis ankyrines de diferents proteïnes • Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes

  41. Alineament per seqüència dels dominis ankyrines de diferents proteïnes: Bcl-3, IkBa, p16, p18, p19, ankyrina... 6% d’identitat

  42. Alineament per seqüència dels dominis ankyrines de diferents proteïnes: Bcl-3, IkBa, p16, p18, p19, ankyrina... 6% d’identitat

  43. Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes

  44. Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes: IkBa, GABP-b, Notch humà 28% d’identitat

  45. , • Alineament per estructura dels dominis ankyrines de diferents proteïnes: IkBa, GABP-b, Notch CONVERGÈNCIA EVOLUTIVA RMS 1,30 P value: 4,63·10-13 - 4,09·10-71

  46. CSL : CBF/RBP-Jk, Su(H), Lag-1

  47. CSL Efector transcripcional universal de la senyalització de Notch CSL és un nom col·lectiu: - CBF1/RBP-Jk  Mamífers - Su(H) Drosophila melanogaster - Lag-1 Caenorhabditis elegans ACTIVACIÓ vs. REPRESIÓ

  48. CTD NTD BTD β C4

  49. 50%Identitat

More Related