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Virologie, physiopathologie, histoire naturelle du VIH classification OMS promotion 8 session 1 médecins juin 2013. objectifs. connaître la diversité virologique du VIH et son implication pratique connaître les éléments utiles du cycle viral
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Virologie, physiopathologie, histoire naturelle du VIHclassification OMSpromotion 8 session 1médecinsjuin 2013
objectifs connaître la diversité virologique du VIH et son implication pratique connaître les éléments utiles du cycle viral connaître la relation CD4 et CV dans l’évolution de la maladie connaître la classification OMS et son implication dans la pratique
HIV-1 Global HIV-2 Afrique de l’ouest Deux types HIV
HIV-1/2 proche des lentivirus des primates (SIV) Au moins 40 especes infectes Seulement chez les primates africains Chaque espèce est infecté avec un SIV spécifique « species-specific SIV » Code de 3 lettres pour l’espèce Ex. SIVcpz in chimpanzee SIVgor in gorilla ….. Non-pathogène dans l’hôte naturel? SIVcol SIVden SIVbkm SIVsyk SIVtal SIVdeb SIVmus SIVasc SIVgsn SIVagm SIVery Vervet Tantalus Grivet SIVmon SIVmnd-2/drl SIVrcm SIV lho/sun/mnd-1 VIH-1/ O HIV-1/ M SIVagmSAB HIV-1/ N SIVcpz/SIVgor/HIV-1 SIVolc SIVwrc SIVsmm/ HIV-2
Origine du HIV Transmission inter-espèce du singe à l’homme • HIV-2 du SIVsmm chez les mangabés en Afrique de l’ouest • HIV-1 de SIVcpz/SIVgor chez chimpanzés et gorilles en Afrique centrale
A B C Characteristiques de l‘évolution du virus HIV • Taux de réplication élevé: 1010 virions par jour • Reverse transcriptase taux de mutation: 1 substitution par genome par cycle • Recombinaison :7-30 cross-overs par genome per cycle • double infection: recombinants gag pol env recombination A B C A C B A B C gag pol env
Characteristiques de l‘évolution du virus HIV HIV chez le patient: multiple quasi-espèces F.McCutchan Transmission singe-homme quasi-espèces chez l’homme Transmission de different quasi-espèces Effect foundateurs, evolution
Classification du HIV-1 : suivre l’evolution de l’épidémie F1 F F2 K B B/D D GROUP M C H 100 A1 A A2 G J SIVcpz-CAM3 100 SIVcpz-US. GROUP N SIVcpz-GAB1 100 GROUP O SIVcpz-ANT 0.1 • 4 groupes (transmission inter-espèces) GROUP M 9 Subtypes sub-subtypes Inter-subtype Recombinants Circulating Recombinant Forms (CRF) Unique Recombinant Forms (URF)
Nouveau groupe du VIH-1 !!! VIH-1 groupe P 2 Aout 2009 10
CRF: Circulating Recombinant Forms Meme structure recombinant identifié chez au moins 4 patients jouant un role dans l’epidemie >40 CRFS:
F1 F F2 K B B/D D GROUP M C H 100 A1 A A2 G J SIVcpz-CAM3 100 SIVcpz-US. GROUP N SIVcpz-GAB1 100 GROUP O SIVcpz-ANT 0.1 prevalence globale et distribution des différents soustypes/CRFs(Hemelaar et al, AIDS 2006) • Subtype C 50% • Subtype A 12% • Subtype B 10% • Subtype G 6% • CRF01-AE 5% • CRF02-AG 5% • Other CRFS 18% • Subtypes F+H+J+K 0.94%
Global distibution of HIV-1 M variants CRF03-AB A, B, C, F1 B, G CRF07-BC B CRF08-BC CRF14_BG B, C CRF09-CPX C, B, A CRF06-cpx CRF01-AE, B CRF02-AG A, D, C O, N A,C,D,F, G,H,J,K CRF01_AE CRF10-CD B, F1 CRF11-cpx CRF05-DF CRF12_BF B C, B
Distribution geographique des soustypes/CRF dynamique et évolutive
Pourquoi étudier l ’évolution de la diversité génétique du HIV? • Differences de pathogenicité, transmissibilité resistance aux ARVs ? • Implications pour developpement d’un vaccin? • Efficacité des tests diagnostques • Serologie • Moleculaire • Charge virale pour le suivi de l’efficacité des traitements
Système immunitaire normal • Protège l’organisme des agressions externes et internes notamment infectieuses • Organes lymphoïdes : moelle osseuse, rate, ganglions, thymus, sites lymphoïdes (TD), … • 2 mécanismes principaux/complémentaires • Cellulaire = : lymphocyte T, macrophages • destruction des cellules malades/infectées • récepteur de surface sur lymphocyte T: CD4 ++, CD8 (lymphocyte T killer), CD3 • Humorale = lymphocyte B • production des Ac de « reconnaissance » ultérieure après premier contact avec Ag facilite la destruction cellulaire • lymphocyte T CD4 : rôle majeur de « coordination » entre les acteurs • => CIBLE PRINCIPALE DU VIH
Interaction VIH-CD4 VIH Interaction co-récepteur VIH VIH gp41 Ancrage gp120 VIH CD4 Attachement CXCR4 CCR5 CD4 gp41 CD4 Fusion Complète VIH Interaction HR1-HR2
Réplication continue du VIH dans les cellules CD4 + au sein des tissus lymphoides tissus lymphoides des muqueuses digestive et génitale rate ganglions Circulation sanguine
Infection chronique Stabilisation charge virale Niveaux relatifs 100,000 30,000 1000 Mois Primo-infection symptomatique
Progression de la maladie HIV 7-10 ans Progresseurs typiques 90 % Infection VIH <5 % Progresseurs rapides <3 ans Nonprogresseurs à longterme <10 % >10-15 ans CD4 normaux, stables
Charge virale et CD4 sont des marqueurs de progression de la maladie Le niveau de stabilisation de la charge virale prédit la vitesse de progression de la maladie VIH
1000 800 600 400 200 0 CD4 + 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 Infection Temps en années Histoire naturelle du VIH Symptomes constitutionnels
Survenue des infections opportunistes en fonction du nombre de CD4
Pathogène opportuniste Hôte Agent pathogène Statut immunitaire de l’hôte Maladie
Effet des trithérapies antirétrovirales (HAART) sur l’histoire naturelle du VIH
29.4% 8.8%
Déclin des événements SIDA sous HAART (183 événements, 1457 PA) 40 35 30 25 Incidence pour 100 PA 20 15 10 5 0 -6 -6 3 9 15 HAART Mois Telenti et al. JAMA
Raison • Déficit immunitaire = responsable de la mortalité et de la morbidité dans l’infection VIH • HAART restaure l’immunité
Intérêts d’une classification • Prise en charge • Rationalisation des stratégies • Prophylaxies • ARV • Collectif : données épidémiologiques • Évaluation / validation des stratégies • Comparaisons / partage d’expérience
Stade I : 1. Asymptomatique 2. Lymphadénopathies généralisées • Stade II: 3. Perte de poids, < 10% du poids corporel 4. Manifestations cutanéo-muqueuses mineures (dermatose séborrhéique, prurigo,mycoses unguéales, ulcérations buccales récurrentes, chéilite angulaire) 5. Zona dans les cinq dernières années 6. Sinusite bactérienne récurrentes Et/ou échelle de performance 2 : symptomatique, activité normale
Stade III : 7. Perte de poids, > 10 % du poids corporel 8. Diarrhée chronique inexpliquée, > 1 mois 9. Fièvre prolongée non expliquée (intermittente ou constante) , > 1 mois 10. Candidose buccale (muguet) 11. Leucoplasie chevelue de la cavité buccale 12. Tuberculose pulmonaire 13. Infections bactériennes graves (c’est-à-dire pneumonie, pyomyositis) Et/ou échelle de performance 3 : alité < 50% du jour durant le dernier mois.
Stade IV: 14. Syndrome cachectique dû au VIH 15. Pneumopathie pneumocystis jirovecii 16. Toxoplasmose cérébrale 17. Cryptosporidiose avec diarrhée > 1 mois 18. Cryptococcose extrapulmonaire 19. Maladie cytomégalovirus d’un organe autre que foie, rate ou nodule lymphatique (ex: rétinite) 20. Infection au virus Herpes simplex, mucocutanée (> 1 mois) ou viscérale 21. Leucoencéphalopathie multifocale progressive 22. Toute mycose endémique disséminée 23. Candidose de l’œsophage, de la trachée, des bronches
Suite stade IV: 24. Mycobactériose atypique, disséminée ou pulmonaire 25. Septicémie à salmonelle non-typhoïdique 26. Tuberculose extrapulmonaire 27. Lymphome 28. Sarcome de Kaposi 29. Encéphalopathie VIH Et/ou échelle de performance 4 : alité > 50% de la journée durant le dernier mois.
Exercice: classification OMS OMS 1 OMS 2 OMS 3 OMS 4