Jenny  S = f ( iklim , organisme , bahan induk , topografi dan waktu ) USDA  S = organisme

1. Jenny  S = f (iklim, organisme, bahaninduk, topografidanwaktu) USDA  S = organisme iklim bahaninduktopografi waktu organisme Manusia, hewan, tumbuhan, mikroorganisme fisika tanah Kimia biologi Bakteri, fungi Aktinomycetes Algae, protozoa, metazoa Fisik, metabolit, Aktivitas biokimia

2. Physical Chemical Biological

3. * What’s in soil? 25 % water 25 % air 45 % mineral 1 - 6 % bahan organik

6. Soil Microorganisms .... • Transformation of organic materials • Release nutrients • Enhance nutrient uptake • Almost every chemical transformation taking • place in soil involves active contributions from • soil microorganisms • Play an active role in soil fertility (carbon and • nitrogen)

7. Soil Microorganisms .... • Without microorganisms nutrients stay • in cover crops and compost • Soils would lose their porosity and • water holding capacity, soil erosion would increase.

10. Bakteria : jasadhidupmikroskopikdenganciri-ciriantara lain : monoseluler, prokaryotik, berdindingsel yang mengandungpeptidoglikan, danmembranselmengandungkarbohidratrantailurus yang terikatpadagliseroldenganikatan ester, asam amino pertama yang disintesispadasintesis protein formilmetionin, dansensitifthdantibiotik.

11. BAKTERI • Sel prokaryotik yang khas, uniseluler dan tidak mengandung struktur yang terbatasi membran di dalam sitoplasnya • Digambarkan dengan bentuk seperti bola (kokus), silindris/ batang (basilus) atau spiral • Berukuran mikroskopis (mikrometer) • Reproduksi dengan pembelahan biner sederhana • Hidup dan tumbuh di berbagai tempat pada suhu 00 C – 900 C dan sebagian dapat tumbuh pada suhu ekstrim • Memiliki peran penting pada lingkungan

14. Aktinomycetes • ☺Karakteristikumum : • Prokaryote ygmirip fungi • Dulukelompok fungi morfologi isolate biakanmurni • Tumbuhsbgmiselium & berspora • Perbedaandng fungi : tanpaintisel & Ø hifa 0,5 – 1,0 μm • Organotrof : saprofit, parasit, simbion • ☺Lingkunganhidup & kelimpahannyadalamtanah : • 10 – 50 % populasi total mikrobiatanah (105 – 108propagul) • aerob • tidaktolerankekeringan, atautanahygbasah (aerasiburuk) • pertumbuhan optimum : 28 – 37 0C, < 5 0C sangatkecil • bbrptumbuhpada 55 – 65 0C • toleranlingkunganalkalin, tidaktoleranlingkunganmasam • competitor burukthdsubratygmudahterdegradasi • pendegrasiselulosa & khitin

17. The Fungi • Fungi (Latin fungus), mykes (Greek) = jamur •  mold, mildew, rust, smuts, yeast, mushroom, puffball • Unicell - multicelluler • Microscopic - giant

18. The Fungi • Eukaryotic • Aerobic or facultatively anaerobic • Chemoheterotrophic • Most are decomposers • Mycology is the study of fungi

19. Molds (kapang = jamur benang) • The fungal thallus consists of hyphae; a mass of hyphae is a mycelium. Figure 12.2

20. Yeasts (khamir) • Unicellular fungi • Fission yeasts divide symmetrically • Budding yeasts divide asymmetrically Figure 12.3

21. Mycology: The Study of Fungi Table 12.2

25. A L G A E Definisi umum algae : (Mikro)organisme eukariotik, fotosintetik, aerobic yang paling sederhana. • Ciri umum : • tubuh sederhana berupa thallus, yaitu tubuh tumbuhan yang • tidak dapat dibedakan antara akar, batang dan daun • morfologi : sel tunggal : bentuk batang, bulat atau spiral • multi selluler : lembaran, filamen atau tubuler • Fisiologi : umumnya aerobik, fotosintetik. Beberapa • heterotrof. Pigmen fotosintetik : khlorofil (hijau), • fikoxantin (coklat), fikobilin (biru) atau fikoeritrin • (merah) Ciri-ciri umum : Ciri-ciri umum :

26. A L G A E ……… • Umumnya termasuk protista tingkat tinggi (eukaryotik) kecuali cyanobacter yang termasuk prokaryotik • penting sbg jasad pioneer, sumber pakan ikan, bahan pangan, kosmetika, obat, dll. • beberapa bersifat toksik (neurotxin) Ciri-ciri umum : Ciri-ciri umum : • Habitat : • lingkungan berair atau lembab dan cukup sinar matahari • seperti perairan, tanah, batuan, tubuh tumbuhan dan hewan

27. A L G A E ……… • Struktur sel : • dinding sel : selulosa dan polisakarida lain (pektin, mannan). Sering dilindungi matrik gelatin yang fleksibel • Sitoplasma : mengandung organel RE, vakuola, plastida, granula, mitokondria, dll • Inti sel : eukaryotik, seringkali mempunayi anak inti • Mitokondria : mengandung sistem transpor elektron pada fosforilasi oksidatif • Flagella : alat gerak dalam air. Flagella bisa tunggal, 2-4 sama panjang atau tidak sama panjang. Letak bisa di depan (anterior) atau di belakang (posterior) Ciri-ciri umum : Ciri-ciri umum :

28. A L G A E ……… • Reproduksi : • Aseksual : pembelahan biner, fragmentasi thallus, spora (non motil = aplanospora; motil = zoospora; akinet = sel dorman pada BGA) • Seksual : membentuk zigot (ukuran dan bentuk sama = isogami, bentuk sama, ukuran beda = an isogami, bentuk dan ukuran beda = oogami) • Sifat kelamin algae : bisa hermafrodit (berumah satu = monoesi=berkelamin dua) atau uniseksual (berumah dua = diesi = berkelamin tunggal) Ciri-ciri umum : Ciri-ciri umum : Pertumbuhan algae :tumbuh semua bagian (Ulva) atau bagian tertentu (apikal, interkalar, basal)

29. A L G A E ……… • Klasifikasi : • pigmen: komposisi kimia • Cadangan makanan : kimiawinya • Flagella : jumlah, letak dan morfologinya • Dinding sel : kimiawi & kenampakan fisik • Organisasi sel : sel tunggal, koloni dan susunannya • Siklus hidup & reproduksi : haploid, diploid, haploid – diploid, membelah, fragmentasi Ciri-ciri umum : Ciri-ciri umum :

30. Cyanobacteria • Oxygenic photosynthesis • Gliding motility • Fix nitrogen

31. The Algae • Eukaryotic • Unicellular, filamentous, or multicellular (thallic) • Most are photoautotrophs

32. Algal habitats Figure 12.11a

33. Cyanobacteria Figure 11.12a-c

34. Chlorophyta • Green algae • Cellulose cell walls • Unicellular or multicellular • Chlorophyll a and b • Store glucose polymer • Gave rise to plants Figure 12.12a

35. Siklus hidup alga hijau uniseluler Figure 12.12b

36. Phaeophyta • Brown algae (kelp) • Cellulose + alginic acid cell walls • Multicellular • Chlorophyll a and c, xanthophylls • Store carbohydrates • Harvested for algin Figure 12.11b

37. Rhodophyta • Red algae • Cellulose cell walls • Most multicellular • Chlorophyll a and d, phycobiliproteins • Store glucose polymer • Harvested for agar and carrageenan Figure 12.11c

38. Bacillariophyta • Diatoms • Pectin and silica cell walls • Unicellular • Chlorophyll a and c, carotene, xanthophylls • Store oil • Fossilized diatoms formed oil • Produce domoic acid Figure 12.13

39. Dinoflagellata • Dinoflagellates • Cellulose in plasma membrane • Unicellular • Chlorophyll a and c, carotene, xanthins • Store starch • Some are symbionts in marine animals • Neurotoxins cause paralytic shellfish poisoning Figure 12.14

40. Lichens • Mutualistic combination of an alga (or cyanobacterium) & fungus • Alga produces and secretes carbohydrates, fungus provides holdfast

41. Lichens Figure 12.10

42. Divisio algae dan beberaa sifatnya Divisi Nama umum Pigmen fotosintesis Susunan dd sel Habitat Chlorophycophyta Ganggang hijau Chlorofil a,b; karoten α, β, γ, xantofil Selulosa, glicosida, xylan, mannan, kapur, atau tdk berdinding sel Air tawar, payau, asin; tanah Charophycophyta Stone worts Clorofil a,; karoten α, β, γ, xantofil Selulosa, glicopyranosida, pengapuran Air tawar, payau Euglenophycophyta Euglenoid Klorofil a,b; karoten β, Xantofil Tidak berdinding sel Air tawar, payau, asin; tanah Phaeophycophyta Alga coklat Klorofil a,c; karoten β, Xantofil; fukoxantin Selulosa, asam alginat, fucoidan (sulfated mucopolysaccharide) Air tawar, payau, asin Chrysophycophyta Alga keemasan, kuning-hijau, diatome Klorofil a,c; karoten α, β, γ, Xantofil; fukoxantin Selulosa, silika, CaCO3, musilagenous sebstances, chitin atau tdk ber dd sel Air tawar, payau, asin; tanah Pyrrhophycophyta Dinoflagella Klorofil a,c; karoten β, Xantofil Selulosa, mucigel atau tdk ber dd sel Air tawar, payau, asin Cryptophycophyta Cryptomonod Klorofil a,c; karoten α, β, ε; Xantofil (croco, allo, monado Xantin) Tdk ber dd sel Air tawar, payau, asin Rhodophycophyta Alga merah Klorofila, d; R & C phycocyanin; allo phycocyanin; R & phycoeritrin, xantofil; karoten α, β Selulosa, xylan, galaktan, kalsifikasi Air tawar, payau, asin Cyanophycophyta Algae hijau-biru Klorofil a, phycocyanin,xantofil, karoten β Polisakarida, peptida Air tawar, tanah

43. KELOMPOK ALGAE YANG BANYAK DIJUMPAI DI DALAM TANAH KELOMPOK BENTUK TALLUS KOMPONEN SEL REPRODUKSI ASEKSUAL REPRODUKSI SEKSUAL PIGMEN FOTO SINTAT GENERA Chlorophycophyta (alga hijau) Unisel, kolonial, filamen selulosa Zoospora, pembel sel, fragmentasi filamen Fusi gamet Klorofil a,b; karoten α, β, γ, Xantofil; pati Chlamydomonas, Chlorella, Pleurococcus, Ulotrix,Zygnema Chrysophycophyta (Bacillariophyceae)(diatome) Unisel, kolonial, filamen Pektin, SiO2 Pembelahan sel Fusi gamet Klorofil a, c; karoten β, Xantofil; Minyak, chrysolaminarin Achnantes, Navicula, Pinnularia Chrysophycophyta (Xanthophyceae) (algae hijau-kuning) Unisel, filamen Pektin, (beberapa) SiO2 Zoospora, pembel sel, fragmentasi filamen Fusi gamet Klorofil a, e; karoten β, Xantofil; Minyak, chrysolaminarin Botrydiopsis, Heterococcus, Voucheria Cyanophycophyta (Cyanobacteria) (Algae hijau-biru) Unisel, kolonial, filamen Polisakarida, peptida Spora dng dd tebal, pembel sel, fragmentasi filamen Tidak ada Klorofil a; karoten β, Xantofil; phycocyanin pati Anabaena, Chroococcus, Nostoc

44. Protozoa Flagellates Euglenoids Tripanosomes Ciliates Microsporidia (Encephalitozoon) Dino flagellates Trichomonads (Trichomonas) Slime molds Animals Diplomonads (Giardia) Green algae Plant Red alga Fungi Oomycetes Diatomae Brown algae Pohon filogenetik Eukaryot berdasar perbandingan sekuen 18S r-RNA

45. Protozoa

46. Major differences amongs eucaryotes

47. Protozoa • Eukaryotic • Unicellular • Chemoheterotrophs • Vegetative form is a trophozoite • Asexual reproduction by fission, budding, or schizogony • Sexual reproduction by conjugation • Some produce cysts Figure 12.16

48. Archaezoa • No mitochondria • Multiple flagella • Giardia lamblia • Trichomonas vaginalis (no cyst stage) Figure 12.17b-d

49. Microspora • No mitochondria • Nonmotile • Intracellular parasites • Nosema

50. Rhizopoda (amoebas) • Move by pseudopods • Entamoeba • Acanthamoeba No jpeg for Figure 21.21 Figure 12.18a