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GENÓMICA Y SU APLICACIÓN EN BOVINOS

GENÓMICA Y SU APLICACIÓN EN BOVINOS. DR. Remigio Espinosa . Veracruz, Noviembre 2009. GENOMA. CROMOSOMAS. CÉLULA. LOS GENES CONTIENEN INSTRUCCIONES PARA PRODUCIR PROTEÍNAS. ADN. LAS PROTEÍNAS FORMAN LA ESTRUCTURA DE LA VIDA Y ACTÚAN EN FORMA COLECTIVA PARA DETERMINAR EL FENOTIPO.

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GENÓMICA Y SU APLICACIÓN EN BOVINOS

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  1. GENÓMICA Y SU APLICACIÓN EN BOVINOS DR. Remigio Espinosa Veracruz, Noviembre 2009

  2. GENOMA CROMOSOMAS CÉLULA LOS GENES CONTIENEN INSTRUCCIONES PARA PRODUCIR PROTEÍNAS ADN LAS PROTEÍNAS FORMAN LA ESTRUCTURA DE LA VIDA Y ACTÚAN EN FORMA COLECTIVA PARA DETERMINAR EL FENOTIPO

  3. Usar la información genómica para la selección genética es el sueño que tuvieron los genetistas durante mucho tiempo

  4. El proyecto de secuencia del ganado bovino fue realizado con vacas Hereford y tomo 6 años en analizarse e involucró a mas de 300 científicos de 25 países

  5. ES POSIBLE EN LA GANADERÍA LECHERA POR…….. • 3 RAZONES: • El banco de datos de genotipo CDDR • La información de pruebas de progenie de mas de 50 años • La capacidad computacional actual, gran avance tecnológico Reproductive status of Holstein and Jersey cows in the United States H. D. Norman,1 J. R. Wright, S. M. Hubbard, R. H. Miller, and J. L. Hutchison Animal Improvement Programs Laboratory, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705-2350 20 million breedings during >8 million lactations of >5 million cows in >23,000 herds.JDS 92:3517-3528

  6. ¿Que son las evaluaciones Genómicas? • Son evaluados 40,000 marcadores genéticos (SNPs) single nucleotidepolymorphism “SNIP” • Para cada SNP, es estimada la diferencia de la habilidad predicha de transmisión (HPT=PTA) entre los animales con un alelo comparado con otro • La evaluación Genómica combina el efecto de os SNP y se estima con el promedio paterno existente o los PTA de cada animal

  7. Contribuidores al CCDR(Cooperative Dairy DNA Repository) • ¡Sólo los 8 centros originales participantes de IA tiene permitido someter machos para genotipo durante los próximos cinco años! • CRI • Select Sires • Alta • Accelerated • Taurus • ABS • Semex

  8. PROGRESO DE LA GENÓMICA • Pruebas de enero 2009, primera vez que se publican toros “genómicos” ”El cambio mas grande de la industria después del semen congelado” -Toros con alto Mérito Neto, nunca antes visto por la industria ¡Wow!

  9. TERMINOLOGÍA GENÉTICA ANTERIOR • Habilidad predicha de transmisión (PTA) y el promedio de los padres (PA) • -PTA- Progenie • -PA- Promedio de los padres • -Genómica- no requiere datos, pero se • adicionan en la prueba • Confiabilidad • -La confiabilidad de PA no podía exceder el 50% por el muestreo al azar de genes de cada padre • - La genómica puede aumentar el %

  10. GENÓMICA VS. PTA TRADICIONAL • El genotipo es una fuente de información como los padres, progenie y registros. • El PTA oficial tendrá un indicador si incluye una contribución genómica (G) • Un genotipo es utilizado para calcular las evaluaciones genómicas para los 29 rasgos • Las evaluaciones genómicas • son utilizadas de la misma • manera que el PTA tradicional

  11. Vaquillas Hermanas Completas en el hato Genesis Moet Promedio Padres

  12. LOS RESULTADOS GENÓMICOS

  13. ¡IMPORTANTE! La Genómica ha cambiado los programastradicionales permitiendo un progreso genético mucho más rápido

  14. ILLUMINA BOVINE SNP 50GENOTYPING BEADCHIP Hoy cuesta $225por animal

  15. TOROS CON GENOTIPO ALREDEDOR DEL MUNDOdesdeEnero 2009

  16. ANIMALES CON GENOTIPO(n=25,393)En EstadosUnidoshastaAbril 2009

  17. ANIMALES PREDICTORES

  18. El Semental perfecto • En Suiza nos muestran la selección GENÓMICA http://videoportal.sf.tv/video?id=51bbae2f-a5f9-461d-8c54-f832020cd866

  19. EFECTO DE LOS SNP PARA PRODUCCIÓN DE LECHE O´Connell, 2008

  20. Beltsville \ BARC Beltsville \ BARC Beltsville \ BARC Show \ HideLeftNavigation : Home : About : Help : ContactUs : En Español : MarkerEffectsMenu SNP MarkerEffectsfor Holstein or Red & White CalculatedAugust 2009 MarkerEffects Brown Swiss Holstein or Red & White Jersey

  21. DISEÑO EXPERIMENTALHolstein, Jersey y Pardo Suizo Datos del 2004 utilizados para predecir datos independientes del 2009

  22. PRUEBAS GENÓMICASToros jóvenes de E.U. con código NAAB, Abr. 2009 * 2007-2008 conteos incompletos

  23. USOS POTENCIALES PARA LOS PRODUCTORES • Identificación posibles reemplazos • Animales genéticamente superiores • Identificación de recesivos indeseables • Verificación de parentesco • Valor añadido a ventas de hembras • Cruzamientos dirigidos, perfil de DNA “complementario”

  24. SELECCIÓN • La selección genómica de hembras jóvenes será una herramienta importantísima para el ganadero. • El servicio de tipificación ya se puede solicitar en algunos países

  25. POSIBILIDADES DE RASGOS NUEVOS NO EVALUADOS • Consumo de alimento • Nivel hormonal • Grado de Inmunidad • Cuidado de pezuñas • Etc

  26. DE EVALUACIÓN GENÓMICA A PRUEBA CON HIJAS Los datos de evaluación genómica se obtuvieron en Enero y las pruebas con hijas son de Abril 2009 56 Toros 40 hijas en promedio, rango de 10 a 91 CAMBIO RASGO PROMEDIO MAX MIN Leche -74 412 -612 Grasa -3 9 -18 Proteína -1 11 -15 Vida Productiva -0.5 0.8 -2.0 DPR 0.0 0.7 -0.8 Fac. de Parto 0 1.0 -1.0 PTA TIPO -0.07 0.19 -0.60 $MNV -37 41 -188 MNV CONF. 10 17 1

  27. El Genoma en el Ganado de Carne

  28. Instituciones y Organismos • USDA 35 MILL DE DÓLARES • Baylor College of Medicine, Houston, Texas • Instituto Nacional de Salud, Dr. Raynard Kington • Instituto de Genética Humana en la Universidad de München, Alemania. • Universidad de Washington, Departamento de Ciencia Animal y Escuela de Ciencias biológicas.

  29. El Cromosoma 14 • El cromosoma 14 (BTA14) ha sido explorado para distintos locis de rasgos cuantificables (QTL) y genes de importancia económica tanto en ganado de leche como de carne. • En la Universidad de Washington, más de 40 investigadores encontraron cerca de 126 QTL para el genoma del ganado de carne. La mayoría encontrados de la región 15 a la 45 del cromosoma. • Rasgos de importancia económica:

  30. El Cromosoma 14 • Rasgos de importancia económica: • Ganancia diaria promedio pre-destete (PrWADG) • Ganancia diaria promedio post-destete (PoWADG) • Peso al nacimiento (BW) • Peso de la canal (CW) • Espesor de grasa dorsal (BFT) • Marmoleo (BMS) • Promedio de peso corporal (ABW) • Calidad de canal (EQT) • Tasa de crecimiento (GR) • Area del Rib eye (REA)

  31. SmartGene para Carne Es un proyecto que proporciona información para la evaluación genética en la industria de carne en Australia, proporciona nuevos EBVs e incrementa la confiabilidad de algunos valores de cruzamiento.

  32. GRACIAS POR SU ATENCIÓN Dr. Remigio Espinosa G. respinosa@reproduccionanimal.com.mx

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