DIAGNOSTICO DE LABORATORIO EN MICROBIOLOGIA

1. DIAGNOSTICO DE LABORATORIO EN MICROBIOLOGIA UNIVERSIDAD DE SANTANDER UDES MEDICINA VETERINARIA. MICROBIOLOGIA VETERINARIA. JOHN JAIRO URIBE GONZALEZ

2. OBJETIVOS GENERALES • EVALUAR ASPECTOS DE LA SELECCIÓN, RECOLECCION Y TRASNPORTE DE MUESTRAS. • CRITERIOS DE IDENTIFICACION DE BACTERIAS PATOGENAS. • CARACTERISTICAS DE CULTIVOS Y PRUEBAS BIOQUIMICAS. • DETRMINAR AGENTES ANTIMICROBIANOS • MECANISOS DE ACCION ANTIMICROBIANA • RESISTENCIA ANTIMICROBIANA • COLONIZACION, INVASION Y ENFEREMEDAD CLINICA.

3. IDENTIFICACION DEL AGENTE ETIOLOGICO. • DETRMINAR SUCEPTIBILIDAD ANTIMICROBINA. HISTORIA CLINICA EDAD SEXO ESPECIE NUMERO DE ANIMALES AFECTADOS. TRATAMIENTO ADMINISTRADO.

4. LAS MUESTRAS DEBEN OBTENERSE DE ANIMALES VIVOS O ANTES DE CAMBIOS AUTOLITICOS O PUTREFACCION. • COLONIZACION DEL PATOGENO, MINIMIZANDO LA CONTAMINACION. • REFRIGERACION DE MUESTRAS. • CONTENEDORES INDEPENDIENTES A PRUEBA DE ESCAPES. • IDENTIFICACION DEL ANIMAL, TIPO DE MUESTRA Y FECHA DE RECOLECCION. EXACTITUD Y VALIDEZ DE LOS RESULTADOS ESTA INFLUENCIADA POR LA RECOLECCION Y ENVIO DE LAS MUESTRAS.

5. TINCION DE GRAM: GRAM POSITIVAS (VIOLETAS) GRAM NEGATIVAS (ROJO). • CRISTAL VIOLETA • LUGOL DE GRAM • DECOLORANTE DE GRAM • SAFRANINA. • GRAM POSITIVAS (VIOLETAS). • GRAM NEGATIVAS (ROJO). • GIEMSA: OBSERVACION Rickettsias y Trypanosomas. • COLORANTE GIEMSA • ALCOHOL ABSOLUTO • XILOL • FUCSINA CARBONICA: RECONOCIMIENTO Campylobacter y fusobacterium, color rojo. • FENOL • ALCOHOL AL 1005% • FUCSINA BASICA • AGUA DESTILADA. • AZUL DE METILENO POLICROMO: Bacillusanthracis en ESP, coloracion azul. • TINCION ZIELHL NEELSEN: Bacilos acido alcohol resistentes como mycobacterias. • FUCSINA BASICA • CALENTAR HASTA EMISION DE VAPORES 5 MIN. • DECOLORAR POR 3 MIN. • AZUL DE METILENO 1 MIN. TECNICAS DE COLORACION PRESENCIA DE BACTERIAS PATOGENAS SE CONFIRMA CON EXAMEN DE FROTIS TEÑIDOS. CULTIVOS CELULARES. PRUEBAS BIOQUIMICAS. METODOS INMUNOLOGICOS. PRUEBAS MOLECULARES

6. AGAR NUTRITIVO: MEDIO BASICO, DEMSTRACION MORFOLOGICA Y PIGMENTACION, RECUENTO DE VIABILIDAD. • AGAR SANGRE: CRECIMIENTO PATOGENAS, AISLAMIENTO PRIMARIO, EVALUACION HEMOLISISNAS. • AGAR MAcCONKEY: SELECTIVO DE ENTEROBACTERIAS Y ALGUNAS GRAM NEG. EVALUACION DE FERMENTADORES DE LACTOSA (ROSADAS) Y NO FERMENTADORES. • CALDO SELENITO: ENRIQUECIMIENTO SELECTIVO, AISLAMIENTO Salmonella A PARTIR DE MUESTRAS CON MICROORGANISMOS ENTRICOS GRAM NEG. • AGAR CHOCOLATE: FACTORES DE CREMIENTO (XYV) PARA AISLAMIENTO Haemophilus. • AGAR VERDE BRILLANTE: MEDIO INDICADOR PARA Salmonella (rosado). • AGUA PEPTONADA: ENRIQUECIMIENTO NO SELECTIVO, POTENCIAMIENTO DEL CRECIMIENTO DE MICROORGANISMOS EN BAJO NUMERO. SELECCIÓN MEDIO CONDICIONES ATMOSFERICAS CARACTERISTICAS Y LAS REACCIONES PERMITEN IDENTIFICACION PRELIMINAR. CRITERIOS DE INTIFICACION MORFOLOGIA Y COLOR DE LAS COLONIAS. PRESENCIA O AUSENCIA DE HEMOLISIS COLORACION DE GRAM MOVILIDAD CAPACIDAD DE CRECER EN MAcCONKEY REACCION EN PRUEBAS DE OXIDACION Y FERMENTACION. REACCION PRUEBAS DE CATALASA Y OXIDASA.

7. TECNICAS BIOQUIMICAS CATALASA: AEROBIOS Y ANAEROBIOS FACULTATIVOS, PRESENCIA CITOCROMO OXIDASA. RELACIONAN LAS ACTIVIDADES CATABOLICAS Y UN INDICADOR PARA DEMOSTRAR UTILIZACION DEL SUSTRATO. RANGO DE AZUCARES PERMITE IDENTIFICACION. METODOS COMERCIALES API.

8. TECNICAS INMUNOLOGICAS : LA SEROTIPIFICACION ES LA IDENTIFICACION INMUNOLOGICA DE LOS ANTIGENOS BACTERIANOS. UTILIZAN ANTICUERPOS FLUORESCENTES INMOVILIZADOS EN FASES SOLIDAS ELISA. • TIPIFICACION DE FAGOS: ESPECIFICOS PARA # LIMITADO DE ESPECIES BACTERIANAS SUCEPTIBLES. UTILIZADA EN INVESTIGACION EPIDEMIOLOGICA. TECNICAS MOLECULARES: HIBRIDACION DE ACIDOS NUCLEICOS Y REACCION EN CADENA DE LA POLIMERASA (PCR). HIBRIDACION UTILIZO SONDAS SINTETICAS DE ACIDOS NUCLEICOS QUE SE APLICAN AL MATERIAL GENETICO DEL PATOGENO. SONDAS ARN – ADN. NUMERO PEQUEÑO DE BACTERIAS SE UTILIZA PCR, AMPLIACION ACIDO NUCLEICO DEL MICROORGANISMO, LUEGO SE UTILIZAN PATRONES DE ADN O ARN, EL PRODUCTO SE IDENTIFICA POR ELECTROFORESIS. TECNICAS SEROLOGICAS LA EXPOSICION A UN MICROORGANISMO PERMITE PRODUCCION DE ANTICUERPOS. LA EVIDENCIA DE ESTOS ANTICUERPOS EVIDENCIA LA EXPOSICION A UN AGENTE INFECCIOSO.

9. AGENTES ANTIMICROBIANOS

10. ANTIBIOTICOS: METABOLITOS MICROBIANOS DE BAJO PESO MOLECULAR O AGENTES ANTIMICROBIANOS SINTETICOS QUE ELIMINAN O INIBEN EL CRECIMIENTO BACTERIANO. ALEXANDER FLEMING (1929) ACTIVIDAD ANTIBIOTICA Penicilliumnotatum SOBRE CEPAS ESTAFILOCOCOS. FLOREY Y CHAIN (1940) INDUSTRIA FARMACEUTICA. USO DE ANTIBIOTICOTERAPIA TOXICIDAD SELECTIVA AMPLIOESPECTRO PERFIL DE SEGURIDAD ADMINISTRACION EN DOSIS UNICAS DIARIAS. TIEMPO DE INFUSION BREVE. ESTABILIDAD A CAMBIOS DE TEMPERATURA.

11. MODO Y LUGAR DE ACCION INTERACCION CON LA ESTRUCTURA CELULAR O BLOQUEAR RUTA METABOLICA. BACTERIOSTATICO: INHIBEN EL CRECIMIENTO BACTERIANO PERMITIENDO ACCION SISTEMA INMUNE. CONCENTRACION DEL ANTB. BACTERICIDA: MUERTE CELULAR POR UNIN ESTRUCTURA DIANA. MODO ACCION INHIBICION SISNTESIS PARED CELULAR, SINTESIS DE PROTEINAS Y ACIDOS NUCLEICOS. INHIBICION SINTESIS DE PARED CELULAR PREVIENEN LOS ENLACES DE LAS CADENAS DE PEPTIDOGLICANO, SELECTIVAMENTE TOXICOS. CEFALOSPORINAS Y PENICILINAS. UNION PROTEINAS DE UNION A PENICILINAS ACTIVIDAD AUTOLITICA. RESITENCIA PRODUCCION DE β LACTAMASAS.

12. INHIBICION DE LA FUNCION DE LA MEMBRANA. RUPTURA DE LA INTEGRIDAD FUNCIONAL DE LA MEMBRANA, LAS MACROMOLECULAS Y IONES SE LIBERAN PRODUCIENDO MUERTE CELULAR. DEBIDO A TOXICIDAD SE USO ES GENERALMENTE TOPICO. • INHIBICION DE LA SISNTESIS DE PROTEINAS UNEN A RECEPTORES DE LAS SUBUNIDADES DEL RIBOSOMA, AFECTANDO LA SINTESIS DE PROTEINAS. EL DESARROLLO DE RESISTENCIA ES MEDIADA POR FALTA DE RECEPTORES ESPECIFICOS Y PLASMIDOS DEGRADAN EL ANTB. TETRACICLINAS: PENETRA POR TRANSPORTE ACTIVO Y SE UNE SUBUNIDAD 30 S. BLOQUEA EL SITIO DE UNION DE LAS MOLECULAS DE ARNt PREVINIENDO LA INCORPORACION EN LOS AMINOACIDOS DE LA CADENA POLIPEPTIDICA. INHIBICION DE LA SISNTESIS DE ACIDOS NUCLEICOS. ACCION SOBRE ADN GIRASA, ENZIMA QUE SEPARA LAS CADENAS DE ADN EN LA REPLICACION. ACCION ARN POLIMERASA (QUINOLONAS Y NOVOBIOCINA), RIFAMPICINA PREVINIENDO LA SINTESIS ARN ACTIVO FRENTE MICOBACTERIAS. RUPTURA DE CADENAS DE ADN ANAEROBIAS OBLIGADAS (METRONIDAZOL). FORMACION DE ACIDO FOLICO DEBIDO A SU SIMILARIDAD AL PARA AMINOBENZOICO (SULFAMIDAS). TRIMETROPIM INHIBE ACTIVIDAD DIHIDROFOLATO REDUCTASA.

13. TERAPIA ANTIBACTERIANA COMBINADA. CUANDO SE COMBINAN ANTIBACTERIANOS EL RESULTADO ESTA INFLUENCIADO POR LA ACCION COMBINADA DE LA SUMA DE LAS ACCIONES. EFECTO SINERGICO: CUANDO LA ACCION COMBINADA ES SIGNIFICATIVAMENTE MAS GRANDE. ANTAGONISMO: EFICACIA REDUCIDA CUANDO DOS FARMACOS SE UTILIZAN COMBINADOS. SUSTANCIAS BACTERICIDAS β LACTAMICOS EFICIENTES EN DIVION ACTIVA, SI SE UTILIZA UN BACTERIOSTATICO SU ACTIVIDAD PUEDE ELIMINARSE. • FACTORES QUE INFLUYEN LA ACTIVIDAD ANTIBACTERIANA. IN VIVO POR EL LUGAR Y LA TASA DE ABSORCION, SITIO DE EXCRESION, DISTRIBUCION TISULAR. • INTERACCION FARMACO PATOGENO. LA RESPUESTA DE UN FARMACO IN VITRO PUEDE DIFERIR IN VIVO. AMBIENTE CONSTANTE DISTRIBUCION Y CONCENTRACION LOCALIZACION (INTRACELULAR) MAS RESISTENTES. UNION A PROTEINAS ABSORCION MEDIADA POR PUS O TEJIDO NECROTICO. INTERACCION HOSPEPADOR PATOGENO. LA ADMINISTRACION DE UNA SUSTANCIA ANTIMICROBIANA PUEDE ALTERAR LA RESPUESTA INMUNE DEL HOSPEDADOR. CAMBIA MICROBIOTA NORMAL. FAVORECIMIENTO SOBRECRECIMIENTO DE MICROORGANISMOS RESISTENTES.

14. RESISTENCIA A LOS ANTIMICROBIANOS. USO INDISCRIMINADO DE ESTOS COMPUESTOS DA LUGAR A UNA SELECCIÓN DE BACTERIAS HEREDITARIAMENTE RESISTENTES. LA RESISTENCIA SE CODIFICA GENETICAMENTE EN CROMOSOMAS O PLASMIDOS. ENTEROBACTERIAS – PSEUDOMONAS. • MECANISMO DE RESISTENCIA PRODUCCION DE ENZIMAS REDUCCION DE LA PERMEABILIDAD CELULAR RUTAS METABOLICAS ALTERNATIVAS ELIMINACION POR EXPULSION DEL ANTIBIOTICO ALTERACION DEL SITIO DIANA. • ESTRATEGIAS DE LIMITACION DE LA RESISTENCIA. RESTRICCION DEL USO DE ANTIBIOTICOS BASE DATOS SOBRE MICROORGANISMOS RESISTENTES. EVALUACION DEL RIESGO Y BENEFICIOS DE LA TERAPIA. TERAPIA ANTIBIOTICA DEBE SUMINISTRARSE A LAS DOSIS TERAPEUTICAS RECOMENDADAS. RESPETAR LOS PERIODOS DE BLANQUEO DE LOS ANTIBIOTICOS. NO DEBEN UTILIZARSE COMO PROMOTORES DE CRECIMIENTO, MEJORAR MEDIDAS DE HIGUIENE. PRUEBAS DE SUSCEPTIBILIDAD ANTIBACTERIANA. DETERMINAR EL USO DEL ANTIBIOTICO MAS ADECUADO SE REALIZAN PRUEBAS IN VITRO. DILUCION EN CALDO, DIFUSION DE DISCOS, GRADIENTE DE AGAR. METODO DE DIFUSION DISCO KIRBY BAUER USADA HABITUALMENTE. CONCENTRACION MINIMA INHIBITORIA. CMI. ES LA DILUCION MAS ALTA DE UN AGENTE ANTIBACTERIANO QUE INHIBE EL CRECIMIENTO DE UN AISLAMIENTO. CMB CONCENTRACION MINIMA BACTERICIDA ES LA DILUCION MAS ALTA DE UN FARMACO QUE PUEDE ELIMINAR UNA BACTERIA.

16. COLONIZACION BACTERIANA, INVASION TISULAR Y ENFERMEDAD CLINICA. SAPROFITAS CRECEN SOBRE MATERIA ORGANICA, LAS PATOGENAS INFECTAN ANIMALES Y HOMBRES. EL DESARROLLO Y LA GRAVEDAD ESTA INFLUENCIADA POR DETRMINANTES DEL HOSPEDERO. LA PIEL ES UN ORGANO DEFENSA QUE LIMITA EL INGRESO BACTERIANO. TRAUMATISMO O INFECCIONES OPORTUNISTAS. KOCH POSTULADO SOBRE MICRORGANISMOS CAUSANTES DE ENFERMEDAD. AISLAMIENTO EN CULTIVO A PARTIR DEL TEJIDO INFECTADO, DEBE CAUSAR ENFERMEDAD, DEBE SER AISLADO A PARTIR DE ANIMALES INFECTADOS EXPERIMENTALMENTE. • INFECCION DE ANIMALES SUCEPTIBLES INFECCION EXOGENA: TRANSMISION DIRECTA O INDIRECTA DE UN ANIMAL INFECTADO. INFECCION ENDOGENA: BACTERIAS COMENSALES ANIMAL ES SOMETIDO A ESTRÉS. (VF)

17. LA INFECCION PUEDE ADQUIRIRSE POR DISTINTAS VIAS . • LA VIRULENCIA SE RELACIONA CON LA CAPACIDAD DE INVADIR Y PRODUCIR ENFERMEDAD • FACTORES QUE INFLUYEN EN EL RESULTADO DE LA INTERACCION ENTRE HOSPEDADOR Y PATOGENO. (VF) • COLONIZACION Y CRECIMIENTO • REPLICACION EVITAR ELIMINACION = COLONIZACION • LOS PATOGENOS DEBEN COMPETIR POR NUTRIENTES, FLORA NORMAL, TOLERAR CONDICIONES MICROAMBIENTALES Y EVADIR MECANISMOS DEFENSA. • HIERRO COMPONENTE DEL CITOCROMOS Y PROTEINAS FERRO SULFURADAS = RESPIRACION BACTERIANA. COMPUESTOS QUELANTES DE HIERRO (SIDEROFOROS), LISAN GR . • DISEMINACION EN EL HOSPEDADOR • EVASION DE LOS MECANISMOS DE DEFENSA ÉXITO DE LA INVASION. • PERMANENCIA PUNTO DE INFECCION RUPTURA DE TEJIDOS POR MEDIO DE LAS COLAGENASAS, LIPASAS, HIALURONIDASAS Y FIBRINOLISINA. • TORRENTE SANGUINEO LIBRES O INTRACELULARES. • MECANISMOS DE SUPERVIVENCIA BACTERIANA.

19. DAÑO A LOS TEJIDOS DEL HOSPEDADOR Y SIGNOS CLINICOS ASOCIADOS. LAS BACTERIAS LOGRAN DAÑAR LOS TEJIDOS DEL HOSPEDERO POR MEDIO DE EXOTOXINAS Y ENDOTOXINAS. EXOTOXINAS: SE PRODUCEN DENTRO DEL CUERPO TIENEN EFECTO LOCAL O SISTEMICO Clostridium botulinum. MUERTE CELULAR POR DIGESTION DE LIPIDOS (LECITINASA Y FOSFOLIPASAS). ENDOTOXINAS: LIPOPOLISACARIDOS DE LA MEMBRANA EXTERNA DE GRAM NEGATIVAS SE LIBERAN A PARTIR DE LA LISIS CELULAR. EL DAÑO TISULAR ESTA MEDIADO POR ENZIMAS SECRETADAS Y RESPUESTA INMUNE. EFECTOS: INTERACCION CON FAGOCITOS PMN Y MACROFAGOS, PLAQUETAS Y LINFOCITOS B. LIBERACION DE INTERLEUCINA 1 QUE PRODUCE FIEBRE, ACTIVACION DEL COMPLEMENTO, CAMBIOS PROINFLAMATORIOS. • TIPOS DE INFECCION BACTERIANAS CATEGORIZADAS COMO AGUDAS, SUBAGUDAS Y CRONICAS. AGUDAS: CORTO Y GRAVE (DIAS) ELIMINACION DE LA BACTERIA INVASORA POR SISTEMA INMUNE. SUBAGUDAS: EFECTOS CLINICOS DE MENOR INTENSIDAD. CRONICAS: FALLAS EN LA ELIMINACION DEL PATOGENO. REPLICACION CELULAR, NO HAY RESPUESTA CELULAR Y HUMORAL, ELIMINACION PERSISTENTE.