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スーパーコンピュータ講習会

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vernon-lowery
17 diapositives · 248 Views · Nov 21, 2014

スーパーコンピュータ講習会. 全体構成 ファイアーウオール経由での使用方法 ディスクの構成 バッチキュー 運用、その他. senri saho. ＳＸ５０. ＳＸ５１. ＳＸ５３. ＳＸ５５. ＳＸ５４. ＳＸ５２. ＳＸ５６. ＳＸ５７. 全体構成. front03. CMC. RCNP. ILE. 全体構成 （１ノード）. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ. 10 Ｇ Ｆ.

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スーパーコンピュータ講習会 - slide 1
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スーパーコンピュータ講習会
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  1. スーパーコンピュータ講習会 • 全体構成 • ファイアーウオール経由での使用方法 • ディスクの構成 • バッチキュー • 運用、その他

  2. senri saho ＳＸ５０ ＳＸ５１ ＳＸ５３ ＳＸ５５ ＳＸ５４ ＳＸ５２ ＳＸ５６ ＳＸ５７ 全体構成 front03 CMC RCNP ILE

  3. 全体構成（１ノード） 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ １２８GB

  4. ＳＸ５０ ＳＸ５１ ＳＸ５３ ＳＸ５５ ＳＸ５４ ＳＸ５２ ＳＸ５６ ＳＸ５７ 全体構成（ＳＸ５ノード間） IXS HIPPI GbE GbE

  5. ファイアーウオール経由での使用方法 • 外部からはsshのみのアクセス • slogin と scp • ２つのルート • ＲＣＮＰルート • senri.rcnp.osaka-u.ac.jp • saho.rcnp.osaka-u.ac.jp • ＣＭＣルート • login.hpc.cmc.osaka-u.ac.jp • ftp.hpc.cmc.osaka-u.ac.jp

  6. senri saho ＳＸ５４ ＳＸ５７ ファイアーウオール経由での使用方法（ログイン） slogin slogin loginサーバ メニューで振分け front03 slogin/telnet

  7. senri saho ＳＸ５７ ＳＸ５n ファイアーウオール経由での使用方法（ファイル転送） sｃｐ sｃｐ ftpサーバ ｎｆｓ ｎｆｓ % scp senri.rcnp.osaka-u.ac.jp:/home.super/rcnp1001/test.dat . % scp ftp.hpc.cmc.osaka-u.ac.jp:/sx/rcnp/home/rcnp1001/test.dat .

  8. ディスクの構成 disk total quota on IBM /sx/rcnp/home 1TB 5GB /home.super /sx/rcnp/work 2TB none /work.super /sxshort/rcnp 8TB none /sx/rcnp/data 3TB none /data.super /sx/rcnp/data2 5.5TB none /data2.super homeとworkはＲＣＮＰユーザー専用 sxshortは他センターのユーザーと共用 IBM機の/homeと/workの利用

  9. バッチキュー（シングル、ｒｃｎｐノード（ｓｘ５７））バッチキュー（シングル、ｒｃｎｐノード（ｓｘ５７）） キュー 最大 メモリー　　　割当 　　　　　ＣＰＵ時間　　標準/最大　ＣＰＵ数 ＲＳ 5分 ２～１６ＧＢ　　　２ ＲＭ 2時間 ２～　８ＧＢ　　１４ ＲＬ 8時間 ２～１６ＧＢ　　１４ 但し、ＲＳはインタラクティブと共用

  10. バッチキュー（パラレル用、ｃｍｃノード） キュー 　ＣＰＵ時間 　　メモリー 割当 　標準/最大 　標準/最大 ＣＰＵ数 Ｐ４ 　２０～７２０時間 　５～　６０ＧＢ 　４ Ｐ８ ４０ ～１４４０時間 １０～　９０ＧＢ 　８ Ｐ１６ １６０時間～無制限 １５～１２０ＧＢ １６ ｍｐｉ３２ １６０時間～無制限 ４０～１２０ＧＢ ３２ ｍｐｉ６４ １６０時間～無制限 ４０～１２０ＧＢ ６４ ｃｍｃユーザー向けの会話型（ＳＸ５）と Ｐ１キューは使用しない

  11. バッチキュー（走り方１） Ｐ４ Ｐ４ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ Ｐ１６ Ｐ８ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ 10ＧＦ １２８GB

  12. ＳＸ５０ ＳＸ５１ ＳＸ５３ ＳＸ５５ ＳＸ５４ ＳＸ５２ ＳＸ５６ ＳＸ５７ バッチキュー（走り方２） mpi32 IXS mpi32 mpi64

  13. バッチキュー（フェアシェアスケジューリングとＥＲＳ）バッチキュー（フェアシェアスケジューリングとＥＲＳ） • 過去に消費した資源の量が多いほど、新たな資源割当の優先度を下げる • 資源は、ＣＰＵ時間、メモリ、ジョブ待時間など • ユーザー単位、グループ単位などで制御可能 • 半減期がある　―　現在1週間 • 資源が余っている時は利用できるが実績には反映される • ＣＭＣ：ＩＬＥ：ＲＣＮＰ＝２：１：１ • ＲＣＮＰの中は各ユーザーが平等

  14. バッチキュー（ギャングスケジューリング） • パラレルに走行するスレッドを同期させる • 経過時間の短縮 • 同期の効率化

  15. バッチキュー（状況表示） • ジョブキューの状況を見る • /usr/bin/jobr • 但し、ＲＣＮＰ以外のユーザーの詳細情報は見られない

  16. 運用 • コンサルティング • ヘルプデスクシステム • http://helpdesk.center.osaka-u.ac.jp/ • ｃｍｃの事務で受け付け • 内容により、cmc事務、ＮＥＣ，ｃｍｃ教官、 ｒｃｎｐに転送される • 日本語のみ • データベースシステム • メイルでの相談受付 • consult@rcnp.osaka-u.ac.jp

  17. その他 • ｔｃｓｈあります • /usr/local/bin/tcsh • 非サポート