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UNIVERSITÉ DE LA MÉDITERRANÉE CENTRE D’OCÉANOLOGIE DE MARSEILLE

UNIVERSITÉ DE LA MÉDITERRANÉE CENTRE D’OCÉANOLOGIE DE MARSEILLE. L'évaluation de la racine des Bilatériens avec des méthodes phylogénomiques évolutives . Responsable de l’unité d’enseignement « Diversité des Organismes Vivants » : Prof. Charles F. Boudouresque. CHIKH Yazid

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Presentation Transcript

  1. UNIVERSITÉ DE LA MÉDITERRANÉE CENTRE D’OCÉANOLOGIE DE MARSEILLE L'évaluation de la racine des Bilatériens avec des méthodes phylogénomiques évolutives Responsable de l’unité d’enseignement « Diversité des Organismes Vivants » : Prof. Charles F. Boudouresque CHIKH Yazid SPROCK Ivonel

  2. Le séquençage de génome est un outil puissant afin de résoudre les interrelations entre différents groupes d’organismes vivants par la recherche d’homologie , d’orthologie et de paralogiede séquences. • Dunn et al. (2008)se sont intéressés à un échantillon génétique limité de 29 espèces, Recueillant un total de 39,9 Mpb de séquences EST*. Dans cette étude des nouvelles séquences EST ont été introduites afin d’améliorer la phylogénie des métazoaires. • Acoelomorphe et Nemertodermatide ont été longtemps un sujet de controverse pour leurs classifications. L’emplacement d’Acoelomorpha dans sa nouvelle case permettrais de comprendre l’évolution de l’arbre phylogénétique des bilateriens. *ExpressedSequence Tag

  3. Obtention d’EST • La construction d’une banque d’ADNc à partir d’ARNm, qui permet de reconstituer la structure probable d’un génome. • Leurs avantages • Enorme quantité et diversité des données des banques d’EST. • Reconstitution via les contig des séquences complètes d'ADNc

  4. Séquençage et Assemblage BLAST* MCL** 1 espèce de Spongiaires 2 espèces d’Aceolomorphe 2 espèces de Nermatodermatide 1 espèce d’Entoprocte 1 espèce de Cycliophore Homologie Paralogie (Alignement des séquences) *basic local alignment search tool ** Markov Cluster algorithm

  5. Arbre phylogénétiquesimplifié de Metazoa le plus probable

  6. 1) Acoelomorphe comme groupe frère des autres Bilatériens Evolution rapide de séquences des espèces examinées • Acoeles ont été difficile à les emplacer • Acoele et Némertodermatide ACOELOMORPHE Groupe frère de Nephrozoa Les caractères morphologiques pour lesquelles on place et rassembler les Acoelomorphes,sont principalement ultra-structurales. • Acoelomorphe est le groupe externe le plus éminent pour faire des comparaisons entre protostomien et deutérostomien.

  7. Les Acoelomorphes possèdent un système nerveux orthogonal et autre antérieur en forme d’anneau centralisé. Caractère ancestral pour le Bilatérien Le placement cohérent d’Acoelomorphe est groupe frère de Nephrozoa. • Dans Némertodermatide et Acoele il y a un orifice pour le système digestif Cet orifice est homologue à la bouche des bilatériens(Hejnol y Martiridale 2008).

  8. 2) Diminution le support de placement de Xenoturbelladans le Deutérostomien • Aucun support robuste au placement de Xenoturbellaavec Deutérostomien • Les analyses de la nouvelle matrice placent Xenoturberllaavec Acoelomorpha Des arguments morphologiques soutiennent le placement de Xenoturbella avec Acoelomorphe (Haszprunar, 1996 in présent étude). Par contre, un soutien morphologique fort n’a pas été apporté pour le placement avec Deutérostomien.

  9. 3) Cycliophores, Ectoproctes, Entoproctes et leurs parents • Première inclusion de Cycliophora dans une étude phylogénomique. Placement du cycliophoreSymbionPandoracomme groupe frère d’ectoproctes. Symbion Pandora Le clade composé d ’Entoproctaet Cycliophora a été placé comme frère d’Ectoprocte (Faible support de bootstrap!!!)

  10. Entoprocta, Ectoprocta et Cycliophores Polyzoa Groupe frère de Platyzoa dans Spiralia

  11. 4) Cténophores et la base de l’arbre des Métazoaires • Cténophores comme groupe frère de tous les autres métazoaires. • Philippe et al. (2009) ont placé à Porifera comme frère de tous les autres métazoaires. • Schierwater et al. (2009) ont conclu que «Diploblastiques» (y compris Cténophore et Porifera), est frère de tous les autres animaux.

  12. Indiscernable!!! D’après Schierwater et al. 2009, PLoS Biology.

  13. Le placement d’Acoelomorphe en effet un groupe frère de tous les autres Bilatériens. • Le placement des Cténophores est encore en débat. • Il faut faire plusieurs analyses phylogénétique (l'échantillonnage taxon plus loin, à la fois avec EST noveaux et projets de génomes pour Porifera Cténophore en particulier) pour éclaircir les divisions les plus profondes dans l'arbre de la vie de métazoaires.

  14. Merci pour votre attention!

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