INTERAKSI 6,7,4’-TRIHIDROKSI ISOFLAVON DENGAN ESTROGEN RESEPTOR 

1. INTERAKSI 6,7,4’-TRIHIDROKSI ISOFLAVON DENGAN ESTROGEN RESEPTOR  Ira handayani 20504007 Pembimbing : Fida M. Warganegara Departemen Kimia Program Pascasarjana Institut Teknologi Bandung

2. AGENDA PRESENTASI PENDAHULUAN TUJUAN TINJAUAN PUSTAKA METODOLOGI PENELITIAN HASIL & PEMBAHASAN KESIMPULAN

3. PENDAHULUAN • Estrogen Reseptor (ER) merupakan target penting dalam dunia pengobatan sebagai hormon pengganti pada wanita yang menopouse dan sebagai obat kemoterapi melawan kanker • Isoflavon kedelai, seperti genistein, daidzein dan glycetein, merupakan fitoestrogen yang terikat dengan afinitas yang rendah terhadap kedua bentuk estrogen reseptor (ER) tetapi cenderung mempunyai afinitas yang lebih tinggi terhadap ER. • 6,7,4’-trihidroksi isflavon (faktor 2) merupakan suatu isoflavon yang diisolasi dari tempe kedelai yang difermentasi dengan rhizopus oligosporus. • Senyawa ini mempunyai sifat sebagai antioksidan yang lebih tinggi dibandingkan genistein dan daidzein (Murata dkk, 1967 dan Ziliken dkk, 1985). • Oleh karena itu diasumsikan bahwa afinitas ikatan faktor 2 dengan estrogen reseptor  jauh lebih tinggi dibandingkan genistein

4. TUJUAN • Untuk mengetahui interaksi antara ER dengan faktor 2 secara komputasi • Untuk mengetahui apakah afinitas ikatan faktor 2 dengan estrogen reseptor jauh lebih tinggi dibandingkan isoflavon lainnya sebagai agonis ER

5. TINJAUAN PUSTAKA

6. Skema Distribusi ER dan ER

7. STRUKTUR ER Kode pdb : 1QKM.pdb

8. Urutan Asam Amino ER-LBD

9. Skema Interaksi Antara Genistein Dengan ER-LBD

10. Teori Protein Docking G = Kvdw *Vvdw + Khb * Vhb + Kele * Vcoul + Ktor * Vtor +Ksol * Vsol G = -RT ln KI KI = e -G/RT

11. METODOLOGI PENELITIAN • Model Ligand Binding Domain ER • Persiapan Database Ligan • Docking Reseptor-Ligan dan Virtual Ligan screening.

12. HASIL & PEMBAHASAN • Struktur Ligand Binding Domain ER • Database Ligan • Docking Reseptor-Ligan dan Virtual Ligan screening.

13. Grafik Energi Minimum Struktur ER-LBD

14. Stuktur ER-LBD sebelum dan sesudah minimisasi dan equlibrasi Harga RMSD : 1.234 Sebelum minimisasi & equlibrasi (Biru). Dan setelah minimisasi & equlibrasi (Ungu)

15. Database Ligan

16. Tabel hasil keluaran Autodock dari docking antara ER-Faktor 2 • = ada - = tidak ada

17. Perbandingan Energi Terendah

18. Urutan potensi estrogenik fitoestrogen untuk ER • Menurut Kuiper dkk: E2 genistein = coumestrol  zearalenone  daidzein  biochanin A = apigenin = kaempferol = naringenin  phloretin = quercetin = ipriflavone = formononetin =chrysin • Berdasarkan virtual ligan screening: E2 > Faktor 2 > Genistein> 6, 7-dihidroksi-4’- metoksiisoflavon >Daidzein > Glycitein > 6,4’-dihidroksi- 7-Metoksiisoflavon >Biochanin A

19. Kesimpulan • Interaksi antara ER dengan faktor 2merupakan interaksi dengan 4 ikatan hidrogen yaitu interaksi antara gugus O pada faktor 2 dengan gugus H residu Arg346 pada ER. Dan interaksi antara gugus H pada faktor 2 dengan residu Glu305, Gly472, dan Phe356. • Afinitas ikatan faktor 2 dengan estrogen reseptor  jauh lebih tinggi dibandingkan genestein, daidzein, biochanin A, glycitein, 6, 7-dihidroksi-4’- metoksiisoflavon dan 6,4’-dihidroksi-7-methoksiisoflavonsebagai agonis ER

20. Ucapan Terimakasih • Dr. Muhamad A. Martoprawiro (Dosen Kimia Komputasi dan teori) untuk fasilitas komputasi dan diskusi yang membantu penelitian saya

21. terima kasih atas perhatiannya

22. 1QKM.pdb Energi Minimum NAMD Y T Reseptor.pdb Model Ligand Binding Domain ER

23. Persiapan Database Ligan Ligan Chemsketch Ligan format 2D ACDlabs Ligan format 3D Molda Ligan.pdb

24. Docking Reseptor-ligan Dan Virtual Screening