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Reaxys Fueling Discovery – Driving Innovation

Reaxys Fueling Discovery – Driving Innovation. 陳建丞 Trainer, Elsevier Taiwan. 大綱. 前言 搜尋頁面簡述 Rapamycin 搜尋 自訂帳號 相關資訊. 前言. 找尋化學相關資訊  搜尋與閱讀  花時間. 需要找資料 老師出作業 做實驗前 / 後 書報討論 寫論文. 資料哪裡找 期刊 書籍 專利 網路 …. 從搜尋結果中再抽取需要的資訊. Time. Time. 較容易的搜尋方式 – Reaxys. 流程化的工作方式

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Reaxys Fueling Discovery – Driving Innovation

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Presentation Transcript

  1. ReaxysFueling Discovery – Driving Innovation 陳建丞 Trainer,Elsevier Taiwan

  2. 大綱 • 前言 • 搜尋頁面簡述 • Rapamycin 搜尋 • 自訂帳號 • 相關資訊 2014年11月28日星期五Slide 2

  3. 前言 2014年11月28日星期五Slide 3

  4. 找尋化學相關資訊  搜尋與閱讀  花時間 • 需要找資料 • 老師出作業 • 做實驗前/後 • 書報討論 • 寫論文 • 資料哪裡找 • 期刊 • 書籍 • 專利 • 網路… 從搜尋結果中再抽取需要的資訊 Time Time 2014年11月28日星期五Slide 4

  5. 較容易的搜尋方式 – Reaxys • 流程化的工作方式 • 快速提供驗證過的詳細實驗步驟及數據 • 完整列出被測試過的化合物各項性質 • 減少建構合成流程的時間 • 直觀的介面 • 易於使用的網路介面，不必安裝軟體 • 由化學家所設計 • 任何時間及任何地點(校內)皆可使用 • 不受人數限制 2014年11月28日星期五Slide 5

  6. 豐富的內涵 2014年11月28日星期五Slide 6

  7. Chemical Spider? Reaction Bioactivity Product or Reactant? Drug or Poison? Substance Patent/Article Ecotoxic Effect on environment? Application? Identified? Spectroscopy 2014年11月28日星期五Slide 7

  8. Reaxys如何建立? – 將 journal articles and patents抽絲剝繭 Physical Data Physical Data Spectra Spectra Bioactivity Data Bioactivity Data Natural Product Natural Product Reaxys 23 March 2010 ‹6›

  9. 發展方向 *紙本的歷史累積 *電子化的開端 *語言與搜尋方 式的改變 *簡易的介面 *資料庫的擴容 *搜尋方式再進化 2014年11月28日星期五Slide 9

  10. 搜尋頁面簡述 2014年11月28日星期五Slide 10

  11. 1 2 3 搜尋頁面介紹 (Reactions) 搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分 2014年11月28日星期五Slide 11

  12. 兩種輸入方式 四種文字輸入方式：化學名/InChi-Key/CAS-No/Smiles 繪圖程式選擇：MarvinSketch/ChemDraw 2014年11月28日星期五Slide 12

  13. 條件限定(Conditions(Form-based)) 可以利用不同敘述得到更好的搜尋結果 文字清單說明各文章的不同用語 2014年11月28日星期五Slide 13

  14. 1 2 3 搜尋頁面介紹 (SubstanceandProperties) 搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分 2014年11月28日星期五Slide 14

  15. 條件限定(Properties(Form-based)) 五大分類：(自訂)/基本資料/物性/光譜/生物活性/環境毒性 2014年11月28日星期五Slide 15

  16. 條件限定Properties(advanced) Reaction type

  17. 搜尋頁面介紹 (Text, Authors and more) 在文字搜尋頁面中，另外提供了輸入專利號及專利出處的選項 2014年11月28日星期五Slide 17

  18. Rapamycin 搜尋 2014年11月28日星期五Slide 18

  19. Rapamycin 在腫瘤細胞中，抑制mTOR基因來進行標靶治療是目前的研究目標。 最早的發現是由Rapamycin的藥理研究而來，研究指出其具有抗生素、免疫抑制及抗腫瘤的作用，以下將以 Rapamycin為例，利用 Reaxys進行搜尋。 • Start a search ： mTOR inhibitor 2014年11月28日星期五Slide 19

  20. 如果要手動畫分子結構，可以在空白處點兩下，會跳出繪圖程式。如果要手動畫分子結構，可以在空白處點兩下，會跳出繪圖程式。 也可以利用 ”Generate structure from name” 鍵入化學名以產生分子。 現在要以 Rapamycin 開始進行搜尋。 rapamycin mtor 2014年11月28日星期五Slide 20

  21. 搜尋結果為 11個化合物在461篇文章出現。 若是想先看結構而非文字時，可以選擇 ”Substance(Grid)” 以進行結果檢視。 2014年11月28日星期五Slide 21

  22. 以下這些聯結表示對於此分子在Reaxys內所有的可用數據。以下這些聯結表示對於此分子在Reaxys內所有的可用數據。 利用左側的Filter可以指定結果中出現您所需要的數據或性質。 點擊“e”會連結至emolecules website，此頁面包含的該分子的來源廠商及價格資訊 2014年11月28日星期五Slide 22

  23. 點擊 會出現進階選項及”View related markush”，可提供您專利相關資訊。 點擊 ，可以以3D模式檢視分子。 使用”Filter”中的”Sub-structure”，可以再加入某個官能基將結果範圍縮小。 2014年11月28日星期五Slide 23

  24. 使用”Filter”中的”Bioactivity”，其中提供多項選擇可以將結果範圍縮小至相關資訊。使用”Filter”中的”Bioactivity”，其中提供多項選擇可以將結果範圍縮小至相關資訊。 在”Filter”中所顯示的數字代表著該項數據所包含的資料筆數。 2014年11月28日星期五Slide 24

  25. 上方的”Breadcrumbs”讓您隨時注意自己進行到哪一個步驟，點擊其中一個可回到該步驟。上方的”Breadcrumbs”讓您隨時注意自己進行到哪一個步驟，點擊其中一個可回到該步驟。 “No of preparations”讓您知道關於此化合物的製備方法數及參與反應數。 若有特別指定，搜尋結果會以”Hit Data”顯示。 2014年11月28日星期五Slide 25

  26. Reaxys的Output提供多種輸出功能。 資料輸出種類：Substance Grid、 Substance Details Table、Substance Citation Table 資料輸出格式：PDF、Word、Excel…. 資料輸出範圍 資料輸出選擇 2014年11月28日星期五Slide 26

  27. Reaxys提供”Synthesis Plan”的功能，讓您在查詢資料的同時，也能建構自己的合成流程圖。 點擊“Synthesize”，會自動跳轉到”Synthesis Plan”的頁面，此頁顯示的是”Synthesis Plan”頁面上半部。 2014年11月28日星期五Slide 27

  28. 此頁顯示的是”Synthesis Plan”頁面下半部。 Reaxys會將所有可能路徑列出供使用者參考選擇，除此之外，還可以藉由排序或”Filter”的方式來找尋所需之反應。 2014年11月28日星期五Slide 28

  29. 反應圖中若有出現“ViewScheme”，表示該反應為多步反應，點擊可觀看其流程圖。反應圖中若有出現“ViewScheme”，表示該反應為多步反應，點擊可觀看其流程圖。 此流程圖下方會顯示此反應的詳細步驟。 點下Output可以將合成圖及合成細節輸出；或是點擊save，可以將結果存成檔案，供下次使用。 2014年11月28日星期五Slide 29

  30. 反應圖中若有出現“Show Experimental Procedure”，表示可直接觀看該反應的詳細實驗內容，點擊後會直接顯示在下方。 點擊”Title/Abstract”，下方會出現其篇名及摘要。 2014年11月28日星期五Slide 30

  31. 點擊每一篇的Show Details，可以觀看該篇詳細內容，包含該篇所提及的化合物及反應。 點擊”Title/Abstract”，下方會出現其篇名及摘要。

  32. 自訂帳號 2014年11月28日星期五Slide 32

  33. 自訂帳號 設定帳號後： 可自訂預設繪圖程式 可留下搜尋歷史紀錄 可設定新知通報 *帳號只在同一所校內有效 2014年11月28日星期五Slide 33

  34. 改變分子繪圖程式 2014年11月28日星期五Slide 34

  35. 相關資訊 2014年11月28日星期五Slide 35

  36. taiwan.elsevier.com ，台灣官網:Reaxys 資訊下載 2014年11月28日星期五Slide 36

  37. www.facebook.com/reaxysclub,FB粉絲團:最新消息與討論www.facebook.com/reaxysclub,FB粉絲團:最新消息與討論 2014年11月28日星期五Slide 37

  38. 如有相關問題請連絡： • 陳建丞 • c.chen@elsevier.com 相關網頁： • www.reaxys.com(首頁) • taiwan.elsevier.com • (台灣官網，包含產品介紹及教學檔下載) • www.facebook.com/reaxysclub • (Facebook粉絲團，包含最新消息及線上交流)

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