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Using Computers for Data Analysis

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barny
64 diapositives · 2.3K Views · Sep 29, 2014

Using Computers for Data Analysis. Adam Schlichting University of Illinois at Chicago Department of Emergency Medicine. Introduction Why?. Too many calculations to do on a handheld calculator. Introduction Programs. EpiInfo Centers for Disease Control and Prevention (CDC) Free software

Using Computers for Data Analysis - slide 1
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  1. Using Computers for Data Analysis Adam Schlichting University of Illinois at Chicago Department of Emergency Medicine

  2. IntroductionWhy? • Too many calculations to do on a handheld calculator

  3. IntroductionPrograms • EpiInfo • Centers for Disease Control and Prevention (CDC) • Free software • http://www.cdc.gov/epiinfo/

  4. IntroductionPrograms • Statistical Program for Social Scientists (SPSS) • Easy to use, point and click • Similar to Microsoft Excel • Fairly powerful

  5. IntroductionPrograms • Statistical Analysis Software (SAS) • Very powerful • Not so easy to use

  6. IntroductionPrograms • Other Programs • PEPI • STATA • FOCUS

  7. IntroductionPrograms • We’ll focus on: • SPSS • EpiInfo for special situations • Easiest to use • Tell you everything you need to know 99% of the time • Biostatisticians exist for the remaining 1%

  8. SPSSThe Program

  9. SPSSThe Program

  10. SPSSImporting Data • Excel is easier to enter and manipulate data • Need to import data • Excel • Access • DBase • Delineated text • …

  11. SPSSImporting Data: Specify File Type

  12. SPSSImporting Data: Specify File Location

  13. SPSSImporting Data: Import Variable Names

  14. SPSSImported Data: Complete

  15. SPSSSaving Imported Data as a SPSS File

  16. SPSSSaving Imported Data as a SPSS File

  17. SPSSAnalysis: Frequency Counts • Do frequency counts of everything • Points out errors that need to be cleaned • Look for obvious mistakes • Age = 650 instead of 65

  18. SPSSAnalysis: Frequency Counts

  19. SPSSAnalysis: Frequency Counts

  20. SPSSAnalysis: Frequency Counts • Use shift/click and Ctrl/click to select variables

  21. SPSSAnalysis: Frequency Counts

  22. SPSSAnalysis: Frequency Counts

  23. SPSSAnalysis: Frequency Counts

  24. SPSSAnalysis: Frequency Counts: Printing

  25. SPSSAnalysis: Frequency Counts: Printing

  26. SPSSAnalysis: Central Tendency • Useful for demographics, lab values • Defaults: • N • Range • Mean • Standard Deviation

  27. SPSSAnalysis: Central Tendency

  28. SPSSAnalysis: Central Tendency • Use shift/click and Ctrl/click to select variables

  29. SPSSAnalysis: Central Tendency

  30. SPSSAnalysis: Central Tendency

  31. SPSSAnalysis: Central Tendency

  32. SPSSAnalysis: Crosstabs • Compare subgroups of catagorical variables on other variables • Not used for continuous variables • Our example: In this sample, does outcome differ by: prehospital GCS? sex?

  33. SPSSAnalysis: Crosstabs

  34. SPSSAnalysis: Crosstabs

  35. SPSSAnalysis: Crosstabs

  36. SPSSAnalysis: Crossabs

  37. SPSSAnalysis: Crossabs

  38. SPSSAnalysis: Crosstabs • Gives a nice breakdown of data • But how do we know if a relationship exists?

  39. SPSSAnalysis: Crosstabs • Use Statcalc in EpiInfo to quickly calculate Odds Ratios, Relative Risks, Confidence Intervals and p-values

  40. EpiInfoStatcalc

  41. EpiInfoStatcalc

  42. EpiInfoStatcalc

  43. EpiInfoStatcalc • Must translate orientation in SPSS table into Exposure/disease orientation for Statcalc • Disease = outcome • Exposure = risk

  44. EpiInfoStatcalc • Disease = outcome = Alive • 1 = alive, 28 days • 2 = dead, 28 days • Bad outcome (death) = + disease • Exposure = risk = sex • 1 = male • 2 = female

  45. EpiInfoStatcalc

  46. EpiInfoStatcalc Nothing significant

  47. EpiInfoStatcalc • If we had other data…