220 likes | 513 Vues
Studiju kurss Ievads molekulārajā un šūnas bioloģijā. Bloks Dzīvības ķīmija , molekulārā bioloģija. 8. laboratorijas darbs. DNS gelelektroforēze. Reinis Rutkis Māris Lazdiņš LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra. Gelelektroforēzes iekārta. Gelelektroforēzes iekārta.
E N D
Studiju kurssIevads molekulārajā un šūnas bioloģijā Bloks Dzīvības ķīmija, molekulārā bioloģija 8. laboratorijas darbs. DNS gelelektroforēze. Reinis Rutkis Māris Lazdiņš LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Gelelektroforēzes iekārta LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Gelelektroforēzes iekārta LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Kas ir elektroforēze? Elektroforēzes pamatā ir lādētu daļiņu pārvietošanās elektriskajā laukā. + + + Katods Anods LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
O O O O P O P O - O O - DNS pavediena uzbūves shema Fosfodiestera saite Purīnu vai pirimidīnu bāze Pentoze vides pH ~ 8 negatīvs lādiņš LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforēze - potenciālu starpība starp elektrodiem (V) l – attālums starp elektrodiem lq E – elektriskā lauka intensitāte (stiprums) =/l (V/cm) F =EqF=ma a=F/m=Eq/m + + LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforēze Ja tas notiktu vakuumā, lādētās molekulas paātrinātos un ātri sasniegtu elektrodus. Vidē, kurā parasti veic elektroforēzi, - viskozitātes dēļ, - dēļ daudzām sadursmēm starp molekulām LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforēze daļiņu kustība ir apgrūtināta, - tā notiek lēnāk, - ir vairāk atkarīga no - daļiņas lieluma un - ģeometriskās formas. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforēzes vēsture + Pirmās elektroforēzes tika veiktas U veida caurulēs, cukuru šķīdumos. Pētāmo vielu sadalījuma atšifrēšana bija sarežģīta un sadalījums nestabils. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforēzes vēsture Metodi 1937. gadā ieviesa zviedru ķīmiķis Arne Tiselius. (1902 - 1971) Panākumi tika atzinīgi novērtēti. 1948. gadā saņem Nobela prēmiju. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforēzes vēsture Lai būtu vieglāk saglabāt vielu sadalījumu, sāka lietot nesējus: - papīru un - cietes gēlus. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforēzes vēsture Taču arī šie nesēji deva diezgan nekvalitatīvu ainu. Vēlāk kā optimālākie nesēji izrādījās: - agarozes un - poliakrilamīda gēli. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforēze nesējos LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Elektroforeze nesējos Zonālā ierobežojošā (restriktīvā) elektroforēze LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Gelektroforēze Agarozes gels Lietojams molekulām, kuru izmēri ir lielāki par 10 nm. Lieto 2-0,5% . 1% poru izmērs 150 nm. LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Nukleotūdu (bāzu) pāri - bp. (Base pairs) fosfāts 1 4 bp gara DNS molekula (fragments) 2 3 4 hidroksils LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML
Pie darba ? LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML