1 / 17

Transferència gènica horitzontal

TRANSFERÈNCIA GÈNICA HORITZONTAL EN EUCARIOTES. Transferència gènica horitzontal. Marta Puig Mòdul de Genòmica i Proteòmica. TGH/L: Definició. Es defineix com el moviment o transferència d’informació genètica a organismes que no són els propis descendents.

dirk
Télécharger la présentation

Transferència gènica horitzontal

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. TRANSFERÈNCIAGÈNICAHORITZONTAL EN EUCARIOTES Transferènciagènicahoritzontal Marta Puig Mòdul de Genòmica i Proteòmica

  2. TGH/L: Definició • Es defineixcom el moviment o transferènciad’informaciógenètica a organismes que no sónels propis descendents.

  3. Teoria de l’endosimbiosi Paulinellachromatophora

  4. HGT: com es produeix?

  5. TGH: comhodetectem?  Incongruènciesfilogenètiques

  6. TGH: problemes per a detectar-la • Pèrduagènica diferencial • Artefactes en la reconstrucciófilogenètica • Degeneració (milionsd’anys) • Poca diferència si es tracta de llinatges moltemparentats. • Duplicaciógènica ancestral…

  7. TGH: Generalitats • No tots els gens/rutes metabòliques tenen la mateixa probabilitat de ser transmesos. • Alguns, funcions clarament especialitzades (metabolisme anaeròbic a diferents llinatges d’eucariotes). • Funcions més generalistes: (D. discoideum, adaptació al sòl, 18 HGTs potencials).

  8. TGH: Tipus • Tenimdiversespossibilitats…

  9. TGH: Tipus • Procariotes  Eucariotes. • Eucariotes  Eucariotes (infraestimada?) • Procariotes  orgànuls (molt estranya). • Orgànuls  Nucli • Orgànul  Orgànul • Eucariotes  Procariotes (menys comú que vice-versa: N molt més grans en procariotes, altres mecanismes, poc “interès” pels gens eucariòtics?).

  10. Procariota  Eucariota • És la més comuna (procariotes N moltgrans), però en vertebrats (humansinclosos) s’haposat en dubte per a un nombre important de gens. • Factorsdecisiuperquè es produeixi: “contacte”, connexió “íntima” amb el sistema vascular de l’hoste, engoliment i digestió… • Exemples: Saccharomycescerevisiae. Gen DHODadquirit de Lactobacilliales(pèrdua del DHOD nadiu) i DBS1delsα-proteobacteris.

  11. Procariota  Eucariota • Cromosoma 19 d’Ostreococcus tauri: no s’assembla al d’altres algues verdes. Sembla derivat completament d’un altre llinatge!

  12. Eucariota  Eucariota • Entre diferents llinatges de fongs (factors de virulència, MAT loci al gènere Stemphylium). • Entre diferents patògens de plantes (fongs filamentosos del fílum ascomicets  oomicets). • Molts d’aquests gens provenen de procariotes: detecció més fàcil.

  13. Eucariota  Eucariota Elysiachlorotica Cargols marins “fotosintètics”:Aquireixen els cloroplasts d’una espècie d’algues de la qual s’alimenten (Vaucherialitorea) i poden fer la fotosíntesi amb l’energia solar: molt important en períodes d’escassetat, perquè poden emmagatzemen els sucres. Elysia no pot fabricar els cloroplasts per sí sol, però tot indica que la seva capacitat de mantenir-los depèn d’alguns gens (psbO) que haurien passat al nucli per HGT, originalment provinents d’aquestes algues.

  14. Orgànul  Orgànul • Plastidis: cap cas documentat d’incorporació de gens foranis (+ compactació genoma). • Mitocondris: Relativament abundant. • Exemples: Citocrom b de mitocondris entre 3 espècies d’escarabats mexicans, plantes (parasitisme directe o bé a través de simbionts fúngics).

  15. TGH: reconstrucció filogenètica

  16. TGH i l’arbre de la vida 2.000’s 1.977

  17. Bibliografia • Stanhope, M. J., Lupas, A., Italia, M. J., Koretke, K. K., Volker, C., & Brown, J. R. (2001). Phylogeneticanalyses do notsupport horizontal gene transfersfrom bacteria tovertebrates. Nature, 411(6840), 940-944. • Bergthorsson, U., Adams, K. L., Thomason, B., & Palmer, J. D. (2003). Widespread horizontal transfer of mitochondrial genes in flowering plants. Nature, 424(6945), 197-201. • Patron, N. J., Rogers, M. B., & Keeling, P. J. (2004). Gene replacement of fructose-1, 6-bisphosphatealdolasesupportsthehypothesis of a single photosyntheticancestor of chromalveolates. EukaryoticCell, 3(5), 1169-1175. • Andersson, J. O., Sarchfield, S. W., & Roger, A. J. (2005). Gene transfers from nanoarchaeota to an ancestor of diplomonads and parabasalids. Molecular biology and evolution, 22(1), 85-90. • Davis, C. C., Anderson, W. R., & Wurdack, K. J. (2005). Gene transfer from a parasitic flowering plant to a fern. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 272(1578), 2237-2242. • Hall, C., Brachat, S., & Dietrich, F. S. (2005). Contribution of horizontal gene transfer to the evolution of Saccharomycescerevisiae. Eukaryotic Cell, 4(6), 1102-1115. • Richards, T. A., Dacks, J. B., Jenkinson, J. M., Thornton, C. R., & Talbot, N. J. (2006). Evolution of filamentousplantpathogens: gene exchangeacrosseukaryotickingdoms. CurrentBiology, 16(18), 1857-1864. • Alvarez, N., Benrey, B., Hossaert-McKey, M., Grill, A., McKey, D., & Galtier, N. (2006). Phylogeographicsupportfor horizontal gene transfer involvingsympatricbruchidspecies. Biol. Direct, 1, 21. • Derelle, E., Ferraz, C., Rombauts, S., Rouzé, P., Worden, A. Z., Robbens, S., ... & Moreau, H. (2006). Genomeanalysis of thesmallest free-living eukaryoteOstreococcustauriunveilsmanyuniquefeatures. Proceedings of theNationalAcademy of Sciences, 103(31), 11647-11652. • Keeling, Patrick J., and Jeffrey D. Palmer. "Horizontal gene transfer in eukaryotic evolution." Nature Reviews Genetics 9.8 (2008): 605-618. • Nedelcu, A. M., Miles, I. H., Fagir, A. M., & Karol, K. (2008). Adaptiveeukaryote‐to‐eukaryote lateral gene transfer: stress‐related genes of algalorigin in theclosestunicellularrelatives of animals. Journal of evolutionarybiology, 21(6), 1852-1860. • Schwartz, J. A., Curtis, N. E., & Pierce, S. K. (2010). Usingalgaltranscriptomesequencestoidentifytransferred genes in the sea slug, Elysiachlorotica. EvolutionaryBiology, 37(1), 29-37.

More Related