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GALEN. Claudia Bärthel 08.01.2004. Inhalt. Was ist GALEN? Entwicklung Komponenten Top Level Ontologie Category Ontologie Attribute Ontologie. Was ist GALEN?. Generalized Architecture for Languages, Encyclopaedias and Nomenclatures in Medcine
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GALEN Claudia Bärthel 08.01.2004
Inhalt • Was ist GALEN? • Entwicklung • Komponenten • Top Level Ontologie • Category Ontologie • Attribute Ontologie
Was ist GALEN? • Generalized Architecture for Languages, Encyclopaedias and Nomenclatures in Medcine • Repräsentation klinischer Information in neuer Art und Weise • Neuartiges mehrsprachiges Kodiersystem für die Medizin • Handhabbarkeit der Komplexität medizinischer Begriffsysteme
Was ist GALEN? • Arbeitet unabhängig vom verwendeten Kodiersystem und verwendeter Eingabesprache • Brücke zwischen Klassifikationssystemen und klinischen Anwendungen
Entwicklung • 1992 - 1995 • The GALEN Projekt • 1995 - 1999 • The GALEN-IN-USE Projekt • 1999 – • OpenGALEN
The GALEN Project • Basis: PEN&PAD Projekt der University of Manchester • Finanziert durch Europäische Kommission • Bildung eines Konsortiums aus 11 Mitglieder (UK, Schweiz, Niederlande, Schweden, Finnland, Deutschland und Italien) • Entwicklung GRAIL und GALEN Referenzmodell
GALEN-IN-USE Projekt • Förderung durch Europäische Kommission • Europäisches Referenzmodell für medizinische Prozeduren • Unterstützung bei Entwicklung nationaler Klassifikationen und Ontologien, Medikamentenlexika und chirurgische Prozeduren • GRAIL-Implementationen
OpenGALEN • Gegründet durch Universitäten Manchester u. Nijmengen • Non-for-profit Organinsation • Vorstand: Prof. Alan Rector, Prof. Pieter de Vries Robbe und Pieter Zanstra
Komponenten • GALEN Common Reference Model • GRAIL • Terminologieserver
CORE Modell (1) • Modell für medizinische Konzepte • Wiederverwendbar • Anwendungsunabhängig • Sprachunabhängig • „Herz“ von GALEN
CORE Modell (2) • Verwendung für • Elektronische Krankenakte • Klinische Benutzerschnittstellen • Klassifikations- und Kodiersysteme • Entscheidungsunterstützung • Wissens-Management-Systeme • Natürliche Sprachprozesse
GRAIL • Basis für CORE Modell • Spezialisierte Beschreibunglogik • Entities Categories Individuals • Statements • Kriterien • Zusammengesetze Entitäten
High Level Ontologie • Category Ontologie • Primary High Level Ontologie • Secondary High Level Ontologie • Attribute Ontologie
Primary High Level OntologieCategory Ontologie • Ausdruck veränderlicher Eigenschaften durch Feature-State-Pairs z.B. Disease which hasFeature (Severity which hasState severe) • Selectors u. Statuses immer mit der Entität, die sie näher bestimmen, durch einzelnen semantischen Link verbunden z.B. Hand which hasLeftRightSelector right Selection
Secondary High Level OntologieCategory Ontologie • Disease wird definiert als: Phenomenon which hasPathologicalStatus pathological • Disorder wird definiert als: Phenomenon which hasAbnormalityStatus nonNormal
High Level OntologieAttribute Ontologie • DomainAttribute ConstructiveAttribute ModifierAttribute TemporalAttribute
High Level OntologieAttribute Ontologie • ConstructiveAttribute PartitiveAttribute StructuralAttribute FunctionalAttribute LocativeAttribute z.B. (Phenomenon whichG <LocativeAttribute Heart hasPathologicalStatus phatological>) name Heart Disease
High Level OntologieAttribute Ontologie • ModifierAttributes hasFeature hasState hasStatus hasSelector hasModality z.B. Disease which hasSeverityFeature (Severity which hasSeverityState severe)
High Level OntologieAttribute Ontologie • Roles and RoleDesignatingAttributes • Roles • XRole • RoleDesignatingAttributes • playsXRole • hasXRole
Modelle basierend auf High Level Ontologie • Chirurgische Prozeduren • Anatomie • Krankheiten • Arzneimittel