1 / 20

Woese et al., PNAS 1990: zakořeněné schéma tří domén

Woese et al., PNAS 1990: zakořeněné schéma tří domén. Eukaryota: Rostlinně-živočišná dichotomie. Konec milénia: 71 dobře popsaných taxonů bez zjevných sest e rských skupin. Acantharea Diphylleia Komokiacea Pseudospora Actinophryida Diplomonadida Luffisphaera Ramicristata Alveolata

mteresa
Télécharger la présentation

Woese et al., PNAS 1990: zakořeněné schéma tří domén

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Woese et al., PNAS 1990: zakořeněné schéma tří domén

  2. Eukaryota: Rostlinně-živočišná dichotomie

  3. Konec milénia: 71 dobře popsaných taxonů bez zjevných sesterských skupin Acantharea DiphylleiaKomokiaceaPseudosporaActinophryida Diplomonadida LuffisphaeraRamicristata Alveolata DiscocelisMicrosporidiaRhodophyta Ancyromonas Ebriida MinisteriaReticulomyxaApusomonadida Ellobiopsida MulticiliaRetortamonadidaBiomyxa Entamoebidae Nephridiophagidae„Rosette agent“ Caecitellus Euglenozoa Nucleariidae SpironemidaeCarpediemonasFonticula OpisthokontaSpongomonadidaCentroheliozoa Glaucophyta OxymonadidaStephanopogon Cercomonadida Granuloreticulosa Parabasalida SticholoncheChlorarachniophyta Gymnophrea ParamyxeaStramenopiles Coelosporidium Gymnosphaerida PelobiontidaTelonema Collodictyon Haplosporida Phaeodarea ThaumatomonadidaCopromyxida Haptophyta PhagodiniumTrimastixCryothecomonas Heterolobosea PhalansteriumVampyrellida Cryptomonadida Hyperamoeba Plasmodiophorida ViridaeplantaeDesmothoracida Jakobida PolycistineaXenophyophoraDimorphida KathablepharidaPseudodendromonadida ....plus mnoho rodů s nejasnou ultrastrukturní identitou! David J. Patterson: The diversity of eukaryotes. American Naturalist 1999 micro*scope http://starcentral.mbl.edu/microscope/

  4. Nová fylogenetická struktura diversity eukaryot Simpson AG and Roger AJ, Curr Biol 2004: The real 'kingdoms' of eukaryotes.

  5. Superskupina Opisthokonta Choanoflagellata Ichthyosporea Metazoa Nuclearia Fungi - Microsporidia Fungi - Chytridiomycota

  6. Synapomorfie opisthokont:Unikátní inzerce v EF1a Steenkamp et al., Mol Biol Evol 2006

  7. Superskupina Amoebozoa Phalansterium Mycetozoa Multicilia Mastigamoebida Entamoeba Arcellinida Amoeba proteus

  8. Superskupina Excavata Trimastix Oxymonadida Diplomonadida Heterolobosea Carpediemonas Malawimonas Jakobida Euglenozoa Parabasala

  9. suspension-feeding groove: morfologická synapomorfie exkavát Dysnectes brevis (Yubuki et al. 2007) Carpediemonas membranifera (Simpson 2003)

  10. Synapomorfie spojující diplomonády a parabasalidy:horizontální transfer prolyl-tRNA synthetasy z archebakterií Andersson et al., 2005

  11. Superskupina Archaeplastida (Plantae) Chlorophyta Glaucophyta Rhodophyta Zygnematales Embryophyta

  12. Superskupina Chromalveolata Cryptophyta Kathablepharida Haptophyta Telonema Apicomplexa Phaeophyceae Oomycota Dinoflagellata Ciliophora

  13. Synapomorfie chromalveolát: unikátní paralog jaderně kódované v plastidu fungující glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenasy

  14. Superskupina Rhizaria Plasmodiophorida Euglyphida Cercomonadida Desmothoracida Foraminifera Polycistinea Chlorarachniophyta Acantharea

  15. „Zbylé“ linie eukaryot Collodictionida Apusomonadida Centrohelida Hemimastigophora Breviata Planomonas (dříve Ancyromonas)

  16. Rhizaria – jen další skupina chromalveolát? ML analýza, 16 proteinů Hackett et al., 2007

  17. Kořen eukaryot mezi Unikonta a Bikonta? Stechmann& Cavalier-Smith, Curr Biol 2003: The root of the eukaryote tree pinpointed

  18. Myosiny třídy II: možná synapomorfie unikont...? ...ale Naegleria je má taky!! Odronitz & Kollmar, 2007 Richards & Cavalier-Smith, Nature 2005

  19. Apusomonády asi sesterské opistokontům! Apusomonas proboscidea Bayesovská analýza, SSU+LSU+aktin+HSP90+a-tubulin +b-tubulin; Kim et al., 2006 Amastigomonas mutabilis

  20. Kořen eukaryot mezi archeplastidy a zbytkem? • RGC - rare genomic changes • – RGC_CAM • - RGC_CA • - RGC_DEL • - RGC_INS Rogozin et al., 2009

More Related