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Unité 1038 (Grenoble Campus Ouest)

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Unité 1038 (Grenoble Campus Ouest)

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Presentation Transcript

  1. Unité 1038 (Grenoble Campus Ouest)

  2. Chimie et Biologie des Métaux Biologie à Grande Echelle Physiologie Cellulaire et Végétale Biologie du Cancer et de l’Infection Institut de Recherche en Sciences et Technologiespour le Vivant (iRTSV) Fonctions intégrées des protéines ; Du vivant aux nanotechnologies

  3. J’ai 8 secondes pour vous dire que l’unité 1038 … c’est de la DYNAMITE

  4. Intitulé complet : Unité 1038 Biologie à Grande Echelle (BGE) Directeur : Jérôme GARIN Directeur adjoint :Xavier GIDROL

  5. Intitulé complet : Unité 1038 Biologie à Grande Echelle (BGE) Directeur : Jérôme GARIN Directeur adjoint :Xavier GIDROL Nombre total de personnes : 51 statutaires (25 Chercheurs ; 26 Ingénieurs, Techniciens, Personnels administratifs) Les équipes : Biomics Xavier GIDROL EDyP Christophe BRULEY Gen&ChemMarie-Odile FAUVARQUE

  6. Intitulé complet : Unité 1038 Biologie à Grande Echelle (BGE) Directeur : Jérôme GARIN Directeur adjoint :Xavier GIDROL Nombre total de personnes : 51 statutaires (25 Chercheurs ; 26 Ingénieurs, Techniciens, Personnels administratifs) Les équipes : Biomics Xavier GIDROL EDyP Christophe BRULEY Gen&ChemMarie-Odile FAUVARQUE Autres tutelles :UJF ; CEA

  7. Les axes de recherche Equilibre Prolifération/Différenciation Recherche de Biomarqueurs (biomarqueurs de pathologies ; cibles thérapeutiques) Ubiquitine Protéases et immunité innée Unité 1038 : Biologie à Grande Echelle (BGE)

  8. Les axes de recherche Equilibre Prolifération/Différenciation Recherche de Biomarqueurs (biomarqueurs de pathologies ; cibles thérapeutiques) Ubiquitine Protéases et immunité innée Les « faits marquants » Plate-forme siRNA sur puce Plate-forme HTS d’analyse phénotypique Plate-forme protéomique pour l’analyse comparative d’échantillons complexes et la quantification absolue des protéines Plate-forme bioinformatique Unité 1038 : Biologie à Grande Echelle (BGE)

  9. Nature Methods (January 2010) : « Methods to watch » High-throughput phenotyping « Automated methods to score phenotypes in model organisms continue to Develop and will permit previously inaccessible areas of biology to be probed » Single Cell methods « The ability to study single cells will permit a better understanding of cellular heterogeneity » Targeted Proteomics « Technology for sensitively and reproducibly detecting targeted proteins by mass spectrometry picks up speed »

  10. Single Cell Methods

  11. Single Cell Methods

  12. High-throughput phenotyping • Base de données AMT du Protéome urinaire • 1 233 analyses LC-MS/MS • 16 204 peptides uniques ; 1 936 protéines

  13. High-throughput phenotyping • Base de données AMT du Protéome urinaire • 1 233 analyses LC-MS/MS • 16 204 peptides uniques ; 1 936 protéines

  14. High-throughput phenotyping Targeted Proteomics • Base de données AMT du Protéome urinaire • 1 233 analyses LC-MS/MS • 16 204 peptides uniques ; 1 936 protéines

  15. High-throughput phenotyping Ubiquitine Protéases (immunité innée)

  16. High-throughput phenotyping • 700 KINASES • 1 400 siRNA • 15 replicates/siRNA • 84 000 Images • 31 500 000 data/cell line • 4 cell lines + 3 Primo-cultures 1 To de données

  17. Biologie des Systèmes ; Modélisation du Vivant Kitano et al. Nature (2002)