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Crecimiento de la pared celular en bacterias mediante dislocaciones. Realizado por: Cosme Gonzalez Ayani Francisco Javier López Encinas Eduardo Jiménez Mori Alejandro Navarro Marín . SIMULACIONES MONTECARLO. En todos las simulaciones:
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Crecimiento de la pared celular en bacterias mediante dislocaciones Realizado por: Cosme Gonzalez Ayani Francisco Javier López Encinas Eduardo Jiménez Mori Alejandro Navarro Marín
SIMULACIONES MONTECARLO • En todos las simulaciones: • los puntos azules y rojos marcan las posiciones iniciales de las ±b(vector de Burgers) dislocaciones. • Las líneas rojas y azules representan sus trayectorias. • Y los círculos negros marcan el final del cilindro. • Los puntos negros son las dislocaciones inactivas que debido a que crean un potencial desordenado pueden atrapar a las dislocaciones activas inhibiendo el crecimiento. • Los simulaciones se hacen a temperatura cero.
SIMULACIONES MONTECARLO • En estas diapositivas mostramos las 3 simulaciones Montecarlo que realizaron los autores del articulo “Dislocation-mediatedgrowth of bacteria cellwall”. • Simulación 1: en esta simulación se muestra el movimiento de 30 dislocaciones negativas en presencia de 10,000 dislocaciones inactivas. Los parámetros de la simulación están en concordancia con los parámetros biológicos de la bacteria. Como ya se ha dicho se puede apreciar como algunas dislocaciones activas se detienen debido a la acción de las dislocaciones inactivas
SIMULACIONES MONTECARLO • En las dos simulaciones restantes se eliminan las dislocaciones inactivas con objeto de estudiar con mas profundidad los efectos de las interacciones elásticas entre dislocaciones. • Simulación 2:se muestran 30 dislocaciones activas moviéndose y interaccionando de manera débil. Como consecuencia dos dislocaciones con signo distinto del vector de Burgers pueden aniquilarse mutuamente. • Simulación 3: en esta simulación se mantiene el numero de dislocaciones positivas, pero ahora la manera de interaccionar es mas fuerte. Como resultado no se producen aniquilaciones y se obtiene un movimiento mas ordenado.
BIBLIOGRAFIA • Dislocation-mediate growth of bacterial cell wall – Ariel Amir and R.Nelson. And SI text • Theory of interacting dislocation in cylinders – Ariel Amir, Jayson Paulose and R. Nelson