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16S amplicon

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1 diapositives · 262 Views · Sep 01, 2014

Ligation Detection Reaction. Pfu DNA Ligase. Discriminating oligo. Common Probe. Cy3. OH. P. cZip code. GCAATTACGGATT. CGCIIATTTAC G. 16S amplicon. GCGIITAAATG C CGTTAATGCCTAA. Perfect match. Ligation product. Cy3. cZip code. CGCIIATTTAC G GCAATTACGGATT A. A.

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  1. Ligation Detection Reaction Pfu DNA Ligase Discriminating oligo Common Probe Cy3 OH P cZip code GCAATTACGGATT CGCIIATTTACG 16S amplicon GCGIITAAATGCCGTTAATGCCTAA Perfect match Ligation product Cy3 cZip code CGCIIATTTACGGCAATTACGGATT A A 16S amplicon GCGIITAAATGCCGTTAATGCCTAA Detection on chip Ligation MIX DNA ‘universal’chip’ Zip 1 Spacer (polyA) Cy3 Spacer (polyA) cZip 3 SLIDE CGCIIATTTACGGCAATTACGGATT Ligationproduct Zip 3 Spacer (polyA) Spacer (polyA) Zip 4 B