SlideServe
Menu
Préférences
© SlideServe · v2026

Phylogeny of LRRs in P. amoebophila's Lgr Genes

colman avatar
2 diapositives · 114 Views · Sep 22, 2014

This study analyzes the evolutionary relationships of 72 LRRs associated with six lgr genes of P. amoebophila using Neighbor-Joining, Bayesian, and UPGMA tree methods. Results show clustering patterns among the LRRs, with notable relationships between LgrA, LgrE, and LgrF.

Phylogeny of LRRs in P. amoebophila's Lgr Genes - slide 1
01 / 2Phylogeny of LRRs in P. amoebophila's Lgr Genes
1 / 17

Télécharger la présentation

Phylogeny of LRRs in P. amoebophila's Lgr Genes
Une image / un lien ci-dessous est fourni (tel quel) pour télécharger la présentation

Politique de téléchargement : le contenu du site vous est fourni TEL QUEL pour votre information et votre usage personnel ; il ne peut être vendu, concédé sous licence ni partagé sur d’autres sites sans l’accord de son auteur.Le contenu vous est fourni TEL QUEL, pour votre information et votre usage personnel uniquement. Téléchargez la présentation en cliquant sur ce lien. Lors du téléchargement, si vous ne parvenez pas à télécharger une présentation, l’éditeur a peut-être supprimé le fichier de son serveur.Pendant le téléchargement, si vous ne parvenez pas à obtenir une présentation, le fichier a peut-être été supprimé par l’éditeur.

F I N

Plus de contenu associé

Transcription de la présentation
  1. A B

  2. Additional file 8. Phylogeny of the 72 LRRs related to the six lgr genes of P. amoebophila. Neighbor-Joining tree on the nucleotide sequence of the repeats. A: Bayesian tree carried out with MrBayes using maximum Likelihood F84 model with 5’000’000 generations, 10 Markov chains and a sample frequency of 100. B: UPGMA tree based on distances calculated using the proportion of identical amino acids present at the same place in the repeats. All analyses reveal that all first LRRs cluster except that of LgrA. Considering the last repeats and depending on the phylogenetical approach, only three are closely related: those of LgrA, LgrE, and LgrF.