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Jesualdo Tomás Fernández Breis Departamento de Informática y Sistemas Universidad de Murcia

Uso de patrones semánticos para la transformación e interoperabilidad de información clínica. Jesualdo Tomás Fernández Breis Departamento de Informática y Sistemas Universidad de Murcia jfernand@um.es http://webs.um.es/jfernand. SemanticHealthNet (2011- 2015).

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  1. Uso de patronessemánticospara la transformación e interoperabilidad de informaciónclínica Jesualdo Tomás Fernández Breis Departamento de Informática y Sistemas Universidad de Murcia jfernand@um.es http://webs.um.es/jfernand

  2. SemanticHealthNet (2011-2015) Network of Excellence FP7-ICT-2011-7http://www.semantichealthnet.eu/

  3. Aproximación a conceptos relevantes • Arquetipos • Estructuras y tiposusadospararecogida de datos, con anotacionesterminológicasparadefinir el significado de los datos • Terminologías • Términosusados en un ámbitoconcreto, de ampliouso en la prácticaclínica • Ontologías • Formalización del significado de los conceptos de un dominio y susinterrelaciones

  4. Contexto Fernández-Breis, Maldonado, Marcos et al, Leveraging Electronic Healthcare Record Standards and Semantic Web Technologies for the Identification of Patient Cohorts. JAMIA(2013) 20:e288-e296

  5. Transformación guiada por ontologías ONTOLOGÍA ARQUETIPO

  6. Observaciones del proceso • Permiteunaexplotacióncentrada en la semántica de los datos • Las reglas de transformaciónbásicas no eransuficientes • No toda la semánticavieneexplícita en los datos • Existesemánticaimplícita en el modelo de informacióny en la estructura del modeloclínico • Puedesernecesariomapear “expresiones” en origen a “expresiones” en destino

  7. Representación semánticade compuesto activo [@archetype_node_id=‘at0003’ and @xsi:type=‘ELEMENT’] => ‘Pharmaceutical/biologic product (product)’ ‘has component part’ some ‘Substance (substance)’ PATRÓN SEMÁNTICO

  8. Qué son los patrones semánticos • Plantillas de transformación • Definencómo se va a formalizar el significado de un conjunto de datos Active Ingredient (X, Y)  Y ‘has component part’ some X

  9. Transformación con patrones: SWIT Ontologías Transformaciónsemántica Mapping Extracción de datos Reglas Mapeo Patrones instanciados Patrones Datos RDF/OWL Arquetipos/BD Datos

  10. Patrones en interoperabilidad: Administración de medicación Representaciónsemánticausandoontologías (SNOMED CT, BioTop, SHN ontology) hasPatient Pharmaceutical Product isRealizedBy Medication Administration Plan hasComponentPart hasDuration hasEndTime hasStartTime Substance Duration PointInTime

  11. Patrones en interoperabilidad: Administración de medicación • Modelosclínicos de administración de medicación SHN y epSOS

  12. Patrones en interoperabilidad: Administración de medicación

  13. Patrones en interoperabilidad: Administración de medicación

  14. Implicaciones, reflexiones, conclusiones • Foco en el significado, no en la estructura • Independenciade lasestructurasusadas en origen • Formalizaciónasegurapropiedades de los datos (p.ej., consistencia) • Tecnologíasestándares W3C: Open Data/Linked Data • Modelosclínicos& patronessemánticos • Proceso de desarrollo • Binding avanzado

  15. Agradecimientos • Mari Carmen LegazGarcía, Marcos MenárguezTortosa (Universidad de Murcia) • Catalina MartínezCosta, Stefan Schulz (Medical University Graz, Austria) TIN2010-21388-C02-02 FP7-ICT-2011-7 Grant 288408

  16. Uso de patronessemánticospara la transformación e interoperabilidad de informaciónclínica Jesualdo Tomás Fernández Breis Departamento de Informática y Sistemas Universidad de Murcia jfernand@um.es http://webs.um.es/jfernand

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