400 likes | 485 Vues
Programcsomag fejlesztése "multiplex microbead assay" eredmények kiértékelésére. Soft Flow Hungary Kft. 7628 Pécs, Kedves u. 24. Lustyik György. http://www.softflow.hu. Reagensek, különböző színű mikrogyöngyök. Orvosi, biológiai vizsgálati minta. Reakció cella.
E N D
Programcsomag fejlesztése "multiplex microbead assay"eredmények kiértékelésére • Soft Flow Hungary Kft. • 7628 Pécs, Kedves u. 24 Lustyik György http://www.softflow.hu
Reagensek, különböző színű mikrogyöngyök Orvosi, biológiai vizsgálati minta Reakció cella Multiplex MikrogyöngyAssay (MMA)
MultiplexMicrobeadAssay Fl Klaszter azonosító fluoreszcencia színek Reporter fluoreszcencia Minden szín-kombináció önálló klasztert alkot Minden klaszter más-más minta-komponens kimutatását végzi Egy minta-komponens a mennyiségével (koncentrációjával) egyenesen arányos riporter fluoreszcenciát „gerjeszt”
Áramlási citométer cella Fényszórás jelek
R1 C1 C2 Fényszórás jel (SSC, DD) Az összetapadt gyöngyök kiszűrésére SSC Klaszter azonosító fluoreszcens színek (paraméterek) 1 vagy 2 fluoreszcens szín, színenként 8-16 fluoreszcencia intenzitás kombinációi Riporter paraméter(ek) A riporter paraméter intenzitásából történik az azonosított minta-komponens kvantitálása Detektált jelek: A klaszterek pozíciója alapján azonosítjuk a detektált minta-komponenst
Reagensek, mikrogyöngyök Standard minták Kontroll minták A mérőkészülék ellenőrzésére szolgáló minták Assay Kit Reagensekből, gyöngyök keverékéből és egyéb komponensekből álló készlet, amely alkalmas bizonyos számú vizsgálati minta analízisére. Mérési és kiértékelési utasítás Assay Specifikációs Fájlban (ASF) rögzített információ
ASF-ben rögzített térfogatú vizsgálati minta Assay Kit reagensek előírt mennyiségben összetételben Kísérleti minták Betegek mintái Az MMA technológia kivitelezése Standard minták Kontroll minták Egyéb minták Reakció cella
4. A mikrogyöngy klaszterek és az Assay Kit által determinált minta-paraméterek egymáshoz rendelése Az eredmények kiértékelése: 1. Adatfájl/mérőkészülék tipus felismerése 2. Mérőkészülék beállítás, pontosság ellenőrzése 3. A mikrogyöngy klaszterek azonosítása 5. Kalibrációs görbe (függvény) készítése 6. Koncentrációk kiszámítása 7. Riport dokumentum(ok) elkészítése 8. Kötelező mentések
2. Mérőkészülék beállítás, pontosság 1. Adatfájl/mérőkészülék tipus felismerésének szabályai ellenőrzéséhez szükséges adatok 3. A mikrogyöngy klaszterek azonosításának szabályai 4. A mikrogyöngy klaszterek és az Assay Kit által determinált minta-paraméterek egymáshoz rendeléséhez szükséges adatok 5. Kalibrációs függvény megadása ASF Mentés
ASF 6. Koncentrációk kiszámítása 7. Riport dokumentum(ok) elkészítése 8. Kötelező mentések ASF információ
Kit gyártója Assay specifikációs fájl (ASF) generálása az assay kit alapján Kitek felhasználói Kísérletek tervezése Mérési eredmények kiértékelése Eredmények riport formátumba foglalása
Task Force for Antigen Quantitation: European Working Group on Clinical Cell Analysis Centers for Disease Control and Prevention (USA) Laboratory Centere for Disease Control of Canada National Committee on Clinical Laboratory Standards International Federation of Clinical Chemistry National Institute of Standards and Technology (USA) A program tervezése, megvalósítása az alábbi szervezetek, intézmények irányelvei alapján történt: A funkcionális és klinikai célú tesztelés a Laboratory Centere for Disease Control, Health Canada, Ottava közreműködésével valósul meg.
10plex Cytokin Tplx.001 26NV01-001
y = a + b {1 + ( ) } x d f c
Kísérletek tervezése Mérési eredmények kiértékelése Eredmények riport formátumba foglalása SAT Flow felhasználói szoftver
Assay specifikációs fájlok (ASF) importálása a SAT Flow programba
Hátralévő feladatok: Funkcionális tesztelés Kísérleti/klinikai tesztelés Nyelvi modulok beépítése (pl. japán) Report készítés pdf formátumban
A program tervezése és a programozás Görömbey Péter programtervező matematikus Torday Robert Rácz Gábor Smudla Antal programozók lelkes munkája