1 / 1

Class I-A

Arabidopsis thaliana PHO1;H2. Arabidopsis thaliana PHO1;H2. 100. 100. Capsella rubella PHO1;H11. Capsella rubella PHO1;H11. 63. 64. Thellungiella halophila PHO1;H9. Thellungiella halophila PHO1;H9. 100. 100. Brassica rapa PHO1;H17. Brassica rapa PHO1;H17. 97. 97.

zea
Télécharger la présentation

Class I-A

An Image/Link below is provided (as is) to download presentation Download Policy: Content on the Website is provided to you AS IS for your information and personal use and may not be sold / licensed / shared on other websites without getting consent from its author. Content is provided to you AS IS for your information and personal use only. Download presentation by click this link. While downloading, if for some reason you are not able to download a presentation, the publisher may have deleted the file from their server. During download, if you can't get a presentation, the file might be deleted by the publisher.

E N D

Presentation Transcript

  1. Arabidopsis thaliana PHO1;H2 Arabidopsis thaliana PHO1;H2 100 100 Capsella rubella PHO1;H11 Capsella rubella PHO1;H11 63 64 Thellungiella halophila PHO1;H9 Thellungiella halophila PHO1;H9 100 100 Brassica rapa PHO1;H17 Brassica rapa PHO1;H17 97 97 Brassica rapa PHO1;H16 Brassica rapa PHO1;H16 77 84 Capsella rubella PHO1;H10 Capsella rubella PHO1;H10 100 100 Arabidopsis thaliana PHO1;H6 Arabidopsis thaliana PHO1;H6 100 100 Thellungiella halophila PHO1;H10 Thellungiella halophila PHO1;H10 87 85 Brassica rapa PHO1;H19 Brassica rapa PHO1;H19 58 50 Brassica rapa PHO1;H21 Brassica rapa PHO1;H21 a b 100 100 Brassica rapa PHO1;H20 Brassica rapa PHO1;H20 Brassica rapa PHO1;H18 Brassica rapa PHO1;H18 59 54 86 79 Brassica rapa PHO1;H13 Brassica rapa PHO1;H13 Thellungiella halophila PHO1;H11 Thellungiella halophila PHO1;H11 100 100 Arabidopsis thaliana PHO1;H5 Arabidopsis thaliana PHO1;H5 100 100 100 100 Capsella rubella PHO1;H9 Capsella rubella PHO1;H9 Brassica rapa PHO1;H23 Brassica rapa PHO1;H15 50 52 Brassica rapa PHO1;H22 Brassica rapa PHO1;H23 91 Brassica rapa PHO1;H15 Brassica rapa PHO1;H22 93 Brassica rapa PHO1;H14 Brassica rapa PHO1;H14 100 90 100 100 100 91 • Brassica rapaPHO1;H2 Brassica rapa PHO1;H2 Thellungiella halophila PHO1;H8 Thellungiella halophila PHO1;H8 98 70 98 Arabidopsis thaliana PHO1;H3 Arabidopsis thaliana PHO1;H3 74 97 99 Capsella rubella PHO1;H8 Capsella rubella PHO1;H8 Carica papaya PHO1;H3 Carica papaya PHO1;H3 Citrus clementina PHO1;H5 Citrus clementina PHO1;H5 Linum usitatissimum PHO1;H8 Linum usitatissimum PHO1;H8 99 99 Linum usitatissimum PHO1;H6 Linum usitatissimum PHO1;H6 60 66 Linum usitatissimum PHO1;H7 Linum usitatissimum PHO1;H7 100 100 54 Linum usitatissimum PHO1;H5 Linum usitatissimum PHO1;H5 98 100 Linum usitatissimum PHO1;H10 Linum usitatissimum PHO1;H10 100 100 Linum usitatissimum PHO1;H9 Linum usitatissimum PHO1;H9 100 100 70 Linum usitatissimum PHO1;H11 Linum usitatissimum PHO1;H11 74 Ricinus communis PHO1;H3 Ricinus communis PHO1;H3 90 91 Ricinus communis PHO1;H2 Ricinus communis PHO1;H2 51 Manihot esculenta PHO1;H3 Manihot esculenta PHO1;H3 63 63 Populus trichocarpa PHO1;H7 Populus trichocarpa PHO1;H7 98 99 Populus trichocarpa PHO1;H4 Populus trichocarpa PHO1;H4 100 100 Populus trichocarpa PHO1;H6 Populus trichocarpa PHO1;H6 100 100 65 Populus trichocarpa PHO1;H11 Populus trichocarpa PHO1;H11 62 Thellungiella halophila PHO1;H7 Thellungiella halophila PHO1;H7 84 88 Thellungiella halophila PHO1;H2 Thellungiella halophila PHO1;H2 75 69 87 83 Brassica rapa PHO1;H5 Brassica rapa PHO1;H5 61 Brassica rapa PHO1;H7 Brassica rapa PHO1;H7 70 Capsella rubella PHO1;H2 Capsella rubella PHO1;H2 100 100 100 100 Arabidopsis thaliana PHO1;H8 Arabidopsis thaliana PHO1;H8 Arabidopsis thaliana PHO1;H7 Arabidopsis thaliana PHO1;H7 100 100 Capsella rubella PHO1;H1 Capsella rubella PHO1;H1 100 100 Capsella rubella PHO1;H5 Capsella rubella PHO1;H5 100 100 Arabidopsis thaliana PHO1;H4 Arabidopsis thaliana PHO1;H4 62 100 100 84 78 Brassica rapa PHO1;H4 Brassica rapa PHO1;H4 Thellungiella halophila PHO1;H1 Thellungiella halophila PHO1;H1 Carica papaya PHO1;H2 Carica papaya PHO1;H2 Phaseolus vulgaris PHO1;H6 Glycine max PHO1;H9 60 67 79 Glycine max PHO1;H9 Phaseolus vulgaris PHO1;H6 85 100 Glycine max PHO1;H10 Glycine max PHO1;H10 100 Glycine max PHO1;H11 Glycine max PHO1;H11 100 Glycine max PHO1;H2 100 Glycine max PHO1;H2 100 100 Glycine max PHO1;H7 Glycine max PHO1;H7 100 100 55 Phaseolus vulgaris PHO1;H7 20 Phaseolus vulgaris PHO1;H7 Cucumis sativus PHO1;H1 Cucumis sativus PHO1;H1 77 86 Cucumis sativus PHO1;H6 Cucumis sativus PHO1;H6 Malus domestica PHO1;H8 Malus domestica PHO1;H8 58 50 Malus domestica PHO1;H9 Malus domestica PHO1;H9 100 100 Malus domestica PHO1;H7 Malus domestica PHO1;H7 99 99 Malus domestica PHO1;H10 Malus domestica PHO1;H10 100 100 Prunus persica PHO1;H3 Prunus persica PHO1;H3 55 Vitis vinifera PHO1;H6 Vitis vinifera PHO1;H6 Mimulus guttatus PHO1;H6 Mimulus guttatus PHO1;H6 Class I-A Vitis vinifera PHO1;H3 Vitis vinifera PHO1;H3 100 100 82 Vitis vinifera PHO1;H2 Vitis vinifera PHO1;H2 83 85 97 Vitis vinifera PHO1;H5 Vitis vinifera PHO1;H5 87 100 Class I Vitis vinifera PHO1;H4 Vitis vinifera PHO1;H4 Citrus sinensis PHO1;H1 Citrus sinensis PHO1;H1 100 100 Citrus clementina PHO1;H7 Citrus clementina PHO1;H7 100 100 Citrus clementina PHO1;H6 Citrus clementina PHO1;H6 100 99 97 98 Populus trichocarpa PHO1;H12 Populus trichocarpa PHO1;H12 Aquilegia coerulea PHO1;H1 Aquilegia coerulea PHO1;H1 Aquilegia coerulea PHO1;H2 Aquilegia coerulea PHO1;H2 100 100 Aquilegia coerulea PHO1;H5 Aquilegia coerulea PHO1;H5 Capsella rubella PHO1;H4 Citrus clementina PHO1;H4 100 100 64 Arabidopsis thaliana PHO1;H9 Citrus sinensis PHO1;H2 56 Thellungiella halophila PHO1;H3 Populus trichocarpa PHO1;H9 100 98 75 Brassica rapa PHO1;H1 Manihot esculenta PHO1;H5 99 Brassica rapa PHO1;H6 Eucalyptus grandis PHO1;H4 50 55 Carica papaya PHO1;H4 Capsella rubella PHO1;H3 55 72 Citrus clementina PHO1;H2 Arabidopsis thaliana PHO1;H10 100 100 Citrus sinensis PHO1;H5 27 Brassica rapa PHO1;H3 59 Manihot esculenta PHO1;H6 Thellungiella halophila PHO1;H4 100 Manihot esculenta PHO1;H4 Prunus persica PHO1;H5 100 78 Ricinus communis PHO1;H1 Medicago truncatula PHO1;H4 54 100 Populus trichocarpa PHO1;H1 Medicago truncatula PHO1;H3 100 Eucalyptus grandis PHO1;H1 Phaseolus vulgaris PHO1;H2 100 98 100 Eucalyptus grandis PHO1;H2 Glycine max PHO1;H13 100 100 Eucalyptus grandis PHO1;H3 Cucumis sativus PHO1;H7 56 Mimulus guttatus PHO1;H3 Mimulus guttatus PHO1;H7 100 Mimulus guttatus PHO1;H2 Eucalyptus grandis PHO1;H1 100 Cucumis sativus PHO1;H3 Eucalyptus grandis PHO1;H2 100 100 Cucumis sativus PHO1;H2 Eucalyptus grandis PHO1;H3 52 Vitis vinifera PHO1;H7 Citrus clementina PHO1;H2 92 100 Dicotyledon 99 Glycine max PHO1;H6 Citrus sinensis PHO1;H5 100 Glycine max PHO1;H3 100 Manihot esculenta PHO1;H6 100 Phaseolus vulgaris PHO1;H1 Manihot esculenta PHO1;H4 100 100 Medicago truncatulaPHO1;H5 Ricinus communis PHO1;H1 100 57 Medicago truncatulaPHO1;H6 Populus trichocarpa PHO1;H1 61 Malus domestica PHO1;H2 Cucumis sativus PHO1;H3 100 100 Malus domestica PHO1;H1 Cucumis sativus PHO1;H2 100 56 Dicotyledon Malus domestica PHO1;H11 Vitis vinifera PHO1;H7 100 Prunus persica PHO1;H1 Capsella rubella PHO1;H4 100 Citrus clementina PHO1;H4 Arabidopsis thaliana PHO1;H9 51 100 Citrus sinensis PHO1;H2 Thellungiella halophila PHO1;H3 73 Populus trichocarpa PHO1;H9 Brassica rapa PHO1;H1 100 68 96 Manihot esculenta PHO1;H5 Brassica rapa PHO1;H6 99 Eucalyptus grandis PHO1;H4 Carica papaya PHO1;H4 63 Capsella rubella PHO1;H3 Mimulus guttatus PHO1;H3 84 100 Arabidopsis thaliana PHO1;H10 Mimulus guttatus PHO1;H2 94 100 Brassica rapa PHO1;H3 Glycine max PHO1;H6 51 100 Thellungiella halophila PHO1;H4 Glycine max PHO1;H3 100 Cucumis sativus PHO1;H7 Phaseolus vulgaris PHO1;H1 75 100 Prunus persica PHO1;H5 Medicago truncatula PHO1;H5 100 Medicago truncatulaPHO1;H4 Medicago truncatula PHO1;H6 100 68 99 Medicago truncatulaPHO1;H3 Malus domestica PHO1;H2 100 100 Phaseolus vulgaris PHO1;H2 Malus domestica PHO1;H1 100 100 Glycine max PHO1;H13 Malus domestica PHO1;H11 100 Mimulus guttatus PHO1;H7 Prunus persica PHO1;H1 Selaginella moellendorffii PHO1;H4 Selaginella moellendorffii PHO1;H4 82 81 Selaginella moellendorffii PHO1;H10 Selaginella moellendorffii PHO1;H10 96 95 100 Selaginella moellendorffii PHO1;H3 Selaginella moellendorffii PHO1;H3 100 80 79 Selaginella moellendorffii PHO1;H8 Selaginella moellendorffii PHO1;H8 Selaginella moellendorffii PHO1;H5 Selaginella moellendorffii PHO1;H5 Glycine max PHO1;H8 Glycine max PHO1;H8 100 99 Glycine max PHO1;H5 Glycine max PHO1;H5 100 100 98 Phaseolus vulgaris PHO1;H5 Phaseolus vulgaris PHO1;H5 97 Medicago truncatula PHO1;H1 Medicago truncatulaPHO1;H1 Glycine max PHO1;H4 Glycine max PHO1;H4 100 100 82 84 Glycine max PHO1;H1 Glycine max PHO1;H1 100 100 Phaseolus vulgaris PHO1;H3 Phaseolus vulgaris PHO1;H3 71 72 Medicago truncatula PHO1;H2 Medicago truncatulaPHO1;H2 1 Cucumis sativus PHO1;H4 Cucumis sativus PHO1;H4 Citrus clementina PHO1;H1 Citrus clementina PHO1;H1 100 Class I-B 100 Citrus sinensis PHO1;H4 Citrus sinensis PHO1;H4 Mimulus guttatus PHO1;H5 Mimulus guttatus PHO1;H5 72 78 Aquilegia coerulea PHO1;H4 Aquilegia coerulea PHO1;H4 Vitis vinifera PHO1;H8 Vitis vinifera PHO1;H8 Linum usitatissimum PHO1;H4 Linum usitatissimum PHO1;H4 100 100 Linum usitatissimum PHO1;H1 Linum usitatissimum PHO1;H1 Populus trichocarpa PHO1;H3 Populus trichocarpa PHO1;H3 98 100 Populus trichocarpa PHO1;H10 Populus trichocarpa PHO1;H10 65 70 Manihot esculenta PHO1;H1 Manihot esculenta PHO1;H1 59 51 Manihot esculenta PHO1;H7 Manihot esculenta PHO1;H7 70 56 Ricinus communis PHO1;H4 Ricinus communis PHO1;H4 Malus domestica PHO1;H3 Malus domestica PHO1;H3 83 81 Malus domestica PHO1;H6 Malus domestica PHO1;H6 100 100 Prunus persica PHO1;H2 Prunus persica PHO1;H2 Capsella rubella PHO1;H7 Arabidopsis thaliana PHO1 94 86 Arabidopsis thaliana PHO1 Capsella rubella PHO1;H7 54 Brassica rapa PHO1;H10 Brassica rapa PHO1;H10 Brassica rapa PHO1;H8 100 100 Brassica rapa PHO1;H8 Thellungiella halophila PHO1;H6 Thellungiella halophila PHO1;H6 Eucalyptus grandis PHO1;H8 Eucalyptus grandis PHO1;H8 Eucalyptus grandis PHO1;H6 Eucalyptus grandis PHO1;H6 96 98 100 Eucalyptus grandis PHO1;H7 Eucalyptus grandis PHO1;H7 53 99 72 Zea mays PHO1;H2 Zea mays PHO1;H2 75 100 100 Class II-A Sorghum bicolor PHOH2 Sorghum bicolor PHOH2 80 100 100 100 100 Setaria italica PHO1;H2 Setaria italica PHO1;H2 95 91 Oryza sativa PHO1;H2 Oryza sativa PHO1;H2 Brachypodium distachyon PHO1;H2 Brachypodium distachyon PHO1;H2 Pinus taeda PHO1;H2 Pinus taeda PHO1;H2 100 100 100 Pinus taeda PHO1;H1 Pinus taeda PHO1;H1 98 Picea glauca PHO1;H3 Picea glauca PHO1;H3 100 100 Picea glauca PHO1;H2 Picea glauca PHO1;H2 Linum usitatissimum PHO1;H2 Glycine max PHO1;H14 100 96 Linum usitatissimum PHO1;H3 Glycine max PHO1;H12 100 Ricinus communis PHO1;H5 Phaseolus vulgaris PHO1;H4 100 Manihot esculenta PHO1;H2 Cucumis sativus PHO1;H5 Angiosperm Angiosperm 10 Land Plants Populus trichocarpa PHO1;H8 Eucalyptus grandis PHO1;H5 100 Populus trichocarpa PHO1;H2 Malus domestica PHO1;H4 100 100 Land Plants Populus trichocarpa PHO1;H5 Malus domestica PHO1;H5 100 Carica papaya PHO1;H1 Prunus persica PHO1;H4 Brassica rapa PHO1;H9 Populus trichocarpa PHO1;H8 52 100 Brassica rapa PHO1;H11 Populus trichocarpa PHO1;H2 75 99 Brassica rapa PHO1;H12 82 Populus trichocarpa PHO1;H5 Thellungiella halophila PHO1;H5 Linum usitatissimum PHO1;H2 100 Gymnosperm 100 Arabidopsis thaliana PHO1;H1 Linum usitatissimum PHO1;H3 Gymnosperm 71 100 Capsella rubella PHO1;H6 100 Ricinus communis PHO1;H5 97 Citrus sinensis PHO1;H3 Manihot esculenta PHO1;H2 100 Citrus clementina PHO1;H3 Brassica rapa PHO1;H11 59 Glycine max PHO1;H14 Brassica rapa PHO1;H9 82 98 Glycine max PHO1;H12 Brassica rapa PHO1;H12 80 100 Phaseolus vulgaris PHO1;H4 Thellungiella halophila PHO1;H5 100 Cucumis sativus PHO1;H5 Capsella rubella PHO1;H6 59 81 Eucalyptus grandis PHO1;H5 Arabidopsis thaliana PHO1;H1 97 58 Malus domestica PHO1;H4 Class II 95 Citrus sinensis PHO1;H3 100 100 62 Malus domestica PHO1;H5 Citrus clementina PHO1;H3 100 Prunus persica PHO1;H4 Carica papaya PHO1;H1 56 Vitis vinifera PHO1;H1 72 Vitis vinifera PHO1;H1 100 Mimulus guttatus PHO1;H4 Mimulus guttatus PHO1;H4 100 91 87 86 Mimulus guttatus PHO1;H1 Mimulus guttatus PHO1;H1 Aquilegia coerulea PHO1;H3 Aquilegia coerulea PHO1;H3 Sorghum bicolor PHOH3 100 Sorghum bicolorPHOH3 100 99 100 Zea mays PHO1;H1 Zea mays PHO1;H1 99 100 Seed Plants Seed Plants Setaria italica PHO1;H3 100 Setaria italica PHO1;H3 100 Brachypodium distachyon PHO1;H1 Brachypodium distachyon PHO1;H1 65 75 59 94 Oryza sativa PHO1;H3 59 Oryza sativa PHO1;H3 93 Setaria italica PHO1;H1 Setaria italica PHO1;H1 100 100 Sorghum bicolor PHOH1 Sorghum bicolor PHOH1 100 100 Oryza sativa PHO1;H1 Oryza sativa PHO1;H1 Picea glauca PHO1;H1 Picea glauca PHO1;H1 99 98 Pinus taeda PHO1;H3 Pinus taeda PHO1;H3 Plants Class II-B Selaginella moellendorffiiPHO1;H6 Selaginella moellendorffii PHO1;H6 Plants 94 Physcomitrella patens PHO1;H4 88 Physcomitrella patens PHO1;H4 100 100 Physcomitrella patens PHO1;H7 Physcomitrella patens PHO1;H7 100 100 Physcomitrella patens PHO1;H1 Physcomitrella patens PHO1;H1 57 69 Physcomitrella patens PHO1;H6 Physcomitrella patens PHO1;H6 100 100 Physcomitrella patens PHO1;H3 Physcomitrella patens PHO1;H3 Selaginella moellendorffii PHO1;H7 Selaginella moellendorffii PHO1;H7 100 100 Selaginella moellendorffii PHO1;H2 Selaginella moellendorffii PHO1;H2 97 97 Selaginella moellendorffii PHO1;H9 Selaginella moellendorffii PHO1;H9 86 85 Selaginella moellendorffii PHO1;H1 Angiosperm Selaginella moellendorffii PHO1;H1 Angiosperm Physcomitrella patens PHO1;H5 Physcomitrella patens PHO1;H5 100 100 Physcomitrella patens PHO1;H2 Physcomitrella patens PHO1;H2 Micromonas pusilla PHO1 Micromonas pusilla PHO1 95 88 Ostreococcus lucimarinus PHO1 Ostreococcus lucimarinusPHO1 Caenorhabditis elegans SYG-1 Caenorhabditis elegans SYG-1 100 Saccharomyces cerevisiae SYG1 Saccharomyces cerevisiae SYG1 99 Mus musculus XPR1 Mus musculus XPR1 100 Homo sapiens XPR1 Homo sapiens XPR1 Gymnosperm Gymnosperm 0.1 0.1 Class II-Basal 100 100 100 Green algae Out-groups Figure S1. ML trees generated using both WAG and LG models.

More Related